MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR301865

Hederacoside C; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR301865
RECORD_TITLE: Hederacoside C; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Hederacoside C
CH$COMPOUND_CLASS: Triterpene saponins
CH$FORMULA: C59H96O26
CH$EXACT_MASS: 1221.391
CH$SMILES: C[C@@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](OC[C@H]3O[C@@H](OC(=O)[C@]45CCC(C)(C)C[C@H]4C4=CC[C@@H]6[C@@]7(C)CC[C@H](O[C@@H]8OC[C@H](O)[C@H](O)[C@H]8O[C@@H]8O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]8O)[C@@](C)(CO)[C@@H]7CC[C@@]6(C)[C@]4(C)CC5)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C59H96O26/c1-24-34(63)38(67)42(71)49(78-24)83-46-29(20-60)80-48(45(74)41(46)70)77-22-30-37(66)40(69)44(73)51(81-30)85-53(75)59-17-15-54(3,4)19-27(59)26-9-10-32-55(5)13-12-33(56(6,23-61)31(55)11-14-58(32,8)57(26,7)16-18-59)82-52-47(36(65)28(62)21-76-52)84-50-43(72)39(68)35(64)25(2)79-50/h9,24-25,27-52,60-74H,10-23H2,1-8H3/t24-,25-,27-,28-,29+,30+,31+,32+,33-,34-,35-,36-,37+,38+,39+,40-,41+,42+,43+,44+,45+,46+,47+,48+,49-,50-,51-,52-,55-,56-,57+,58+,59-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY RYHDIBJJJRNDSX-MCGLQMIESA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.37805
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 1221.62626

PK$SPLASH: splash10-05fu-2181912302-dc80ce6ca57c57c482e4
PK$NUM_PEAK: 183
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  63.89187 45.0 45
  69.03982 47.0 47
  111.04583 38.0 38
  122.60077 43.0 43
  129.0 40.0 40
  129.05518 45.0 45
  129.11142 67.0 67
  129.93747 38.0 38
  130.05708 47.0 47
  145.0507 47.0 47
  147.0632 47.0 47
  147.06812 72.0 72
  163.06128 83.0 83
  179.07237 45.0 45
  207.16322 38.0 38
  237.06056 45.0 45
  239.10048 43.0 43
  241.06953 38.0 38
  243.09138 56.0 56
  249.19115 47.0 47
  255.09183 43.0 43
  256.83319 43.0 43
  257.08871 52.0 52
  257.09879 90.0 90
  258.1098 52.0 52
  259.08041 47.0 47
  261.07617 45.0 45
  261.0975 92.0 92
  261.17706 52.0 52
  269.67795 45.0 45
  273.08731 92.0 92
  273.09933 92.0 92
  279.09366 85.0 85
  279.11304 280.0 280
  280.11099 90.0 90
  285.27118 43.0 43
  293.07434 54.0 54
  293.12607 789.0 788
  294.13846 49.0 49
  295.09454 139.0 139
  309.1131 128.0 128
  309.12476 184.0 184
  310.11737 94.0 94
  311.14114 47.0 47
  349.24332 47.0 47
  352.63968 38.0 38
  359.01422 45.0 45
  388.13187 38.0 38
  390.16251 52.0 52
  397.30444 90.0 90
  398.31873 45.0 45
  399.13696 40.0 40
  401.09631 45.0 45
  405.13104 45.0 45
  408.14954 38.0 38
  409.33575 155.0 155
  409.35019 61.0 61
  410.34753 43.0 43
  411.3833 83.0 83
  419.14294 49.0 49
  419.16159 204.0 204
  423.30457 45.0 45
  425.13852 40.0 40
  425.16437 40.0 40
  425.34964 40.0 40
  426.35474 40.0 40
  427.34082 38.0 38
  436.05719 65.0 65
  437.173 61.0 61
  437.30942 49.0 49
  437.32239 65.0 65
  437.35028 372.0 372
  438.34952 191.0 191
  439.17328 54.0 54
  439.35376 49.0 49
  441.12796 47.0 47
  441.14368 101.0 101
  441.17215 182.0 182
  454.1655 40.0 40
  455.17392 359.0 359
  455.20215 63.0 63
  455.34689 513.0 512
  456.35748 184.0 184
  457.14581 45.0 45
  457.38599 61.0 61
  458.36703 38.0 38
  459.16638 56.0 56
  471.16086 143.0 143
  471.17673 215.0 215
  473.34338 38.0 38
  473.36111 87.0 87
  541.44629 56.0 56
  567.37738 92.0 92
  567.41309 38.0 38
  569.18384 47.0 47
  581.25354 56.0 56
  582.21863 76.0 76
  583.40277 94.0 94
  587.19159 54.0 54
  587.2182 229.0 229
  587.36188 40.0 40
  588.22375 43.0 43
  588.23853 38.0 38
  601.3797 40.0 40
  601.42291 96.0 96
  603.42828 45.0 45
  606.36542 40.0 40
  606.39716 38.0 38
  607.40259 45.0 45
  617.21454 157.0 157
  617.39264 40.0 40
  618.38013 45.0 45
  618.4278 52.0 52
  619.43182 108.0 108
  619.48773 38.0 38
  620.40851 130.0 130
  620.44202 85.0 85
  621.46533 38.0 38
  635.38751 110.0 110
  635.42841 43.0 43
  636.44031 103.0 103
  679.51306 52.0 52
  711.43524 43.0 43
  714.25696 56.0 56
  731.2334 45.0 45
  749.26154 300.0 300
  749.29504 90.0 90
  750.28302 47.0 47
  751.27551 38.0 38
  751.44104 56.0 56
  751.4668 253.0 253
  752.44263 45.0 45
  752.48468 83.0 83
  763.48376 58.0 58
  765.45905 47.0 47
  765.49677 112.0 112
  767.41913 38.0 38
  768.42285 52.0 52
  781.4549 52.0 52
  781.4917 146.0 146
  782.28711 40.0 40
  782.48895 135.0 135
  862.54718 52.0 52
  897.50177 92.0 92
  897.53009 128.0 128
  898.51892 96.0 96
  913.49347 63.0 63
  913.53766 70.0 70
  913.55695 38.0 38
  914.52997 40.0 40
  914.55914 52.0 52
  915.50665 45.0 45
  920.2113 38.0 38
  927.52246 108.0 108
  927.54657 40.0 40
  928.53845 83.0 83
  931.54224 52.0 52
  941.32971 40.0 40
  943.47333 38.0 38
  943.5506 101.0 101
  944.52673 54.0 54
  944.57178 40.0 40
  945.5882 61.0 61
  1028.35364 45.0 45
  1059.56226 191.0 191
  1059.60083 85.0 85
  1059.62976 38.0 38
  1060.01953 45.0 45
  1060.60864 45.0 45
  1060.64954 47.0 47
  1075.56873 56.0 56
  1075.59631 38.0 38
  1077.56323 38.0 38
  1077.75061 45.0 45
  1089.56836 96.0 96
  1089.62244 40.0 40
  1090.60034 38.0 38
  1091.56702 96.0 96
  1131.50525 40.0 40
  1186.56421 58.0 58
  1221.56067 155.0 155
  1221.62695 1000.0 999
  1221.70422 38.0 38
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo