MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR301867

Hederacoside C; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR301867
RECORD_TITLE: Hederacoside C; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Hederacoside C
CH$COMPOUND_CLASS: Triterpene saponins
CH$FORMULA: C59H96O26
CH$EXACT_MASS: 1221.391
CH$SMILES: C[C@@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](OC[C@H]3O[C@@H](OC(=O)[C@]45CCC(C)(C)C[C@H]4C4=CC[C@@H]6[C@@]7(C)CC[C@H](O[C@@H]8OC[C@H](O)[C@H](O)[C@H]8O[C@@H]8O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]8O)[C@@](C)(CO)[C@@H]7CC[C@@]6(C)[C@]4(C)CC5)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C59H96O26/c1-24-34(63)38(67)42(71)49(78-24)83-46-29(20-60)80-48(45(74)41(46)70)77-22-30-37(66)40(69)44(73)51(81-30)85-53(75)59-17-15-54(3,4)19-27(59)26-9-10-32-55(5)13-12-33(56(6,23-61)31(55)11-14-58(32,8)57(26,7)16-18-59)82-52-47(36(65)28(62)21-76-52)84-50-43(72)39(68)35(64)25(2)79-50/h9,24-25,27-52,60-74H,10-23H2,1-8H3/t24-,25-,27-,28-,29+,30+,31+,32+,33-,34-,35-,36-,37+,38+,39+,40-,41+,42+,43+,44+,45+,46+,47+,48+,49-,50-,51-,52-,55-,56-,57+,58+,59-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY RYHDIBJJJRNDSX-MCGLQMIESA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.37805
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 1221.62626

PK$SPLASH: splash10-0a4i-0052912100-d07276cae39dc6da97b5
PK$NUM_PEAK: 169
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  52.45382 22.0 22
  85.02646 25.0 25
  97.02657 29.0 29
  111.04424 20.0 20
  115.04035 44.0 44
  129.05334 24.0 24
  133.04797 30.0 30
  147.06175 56.0 56
  147.06929 24.0 24
  153.00937 20.0 20
  160.54936 23.0 23
  165.0766 24.0 24
  177.16003 28.0 28
  207.08014 22.0 22
  207.17494 24.0 24
  208.18118 28.0 28
  225.07668 23.0 23
  231.08432 26.0 26
  239.09013 87.0 87
  243.07593 22.0 22
  243.08929 43.0 43
  244.09077 23.0 23
  255.08188 73.0 73
  257.03976 20.0 20
  257.09772 25.0 25
  257.11081 22.0 22
  259.08087 24.0 24
  261.08817 59.0 59
  261.18988 20.0 20
  262.11346 20.0 20
  273.08133 20.0 20
  273.09833 167.0 167
  274.09793 24.0 24
  275.11606 48.0 48
  279.10352 293.0 293
  279.11868 86.0 86
  281.11603 75.0 75
  286.79846 29.0 29
  291.09238 20.0 20
  291.10583 42.0 42
  293.11047 90.0 90
  293.125 567.0 566
  294.13016 108.0 108
  295.09814 75.0 75
  296.10641 23.0 23
  299.24112 45.0 45
  309.12027 440.0 440
  310.11072 22.0 22
  310.13162 28.0 28
  310.87524 22.0 22
  311.11676 26.0 26
  311.1304 39.0 39
  311.14142 23.0 23
  325.11282 77.0 77
  352.05576 35.0 35
  371.15079 20.0 20
  384.0372 28.0 28
  384.12439 22.0 22
  388.13422 20.0 20
  389.13754 48.0 48
  389.15045 65.0 65
  390.14838 23.0 23
  397.30307 30.0 30
  398.31503 30.0 30
  399.22604 23.0 23
  401.16211 24.0 24
  405.12753 49.0 49
  407.13959 20.0 20
  407.16013 20.0 20
  409.33871 81.0 81
  409.35602 77.0 77
  411.34967 20.0 20
  417.14273 20.0 20
  419.14926 166.0 166
  419.1723 20.0 20
  419.31461 30.0 30
  420.15219 22.0 22
  425.15091 47.0 47
  425.32617 44.0 44
  425.35226 77.0 77
  435.12259 22.0 22
  436.1478 25.0 25
  437.16678 20.0 20
  437.3262 165.0 165
  437.345 283.0 283
  438.33896 208.0 208
  438.35559 67.0 67
  439.35132 23.0 23
  441.15463 130.0 130
  441.17444 49.0 49
  453.16617 25.0 25
  455.17358 111.0 111
  455.28967 30.0 30
  455.35641 1000.0 999
  456.1813 24.0 24
  456.33444 50.0 50
  456.35983 261.0 261
  457.15448 49.0 49
  457.34781 22.0 22
  457.36362 30.0 30
  458.56619 20.0 20
  471.17303 92.0 92
  471.18851 38.0 38
  472.15717 28.0 28
  473.33798 25.0 25
  473.36499 138.0 138
  474.35632 36.0 36
  474.38428 38.0 38
  493.32294 32.0 32
  498.16589 23.0 23
  507.33789 20.0 20
  515.16168 20.0 20
  519.35938 20.0 20
  521.35028 24.0 24
  533.16998 24.0 24
  533.19788 20.0 20
  548.37726 20.0 20
  563.19147 22.0 22
  565.23883 22.0 22
  567.19385 22.0 22
  567.38879 22.0 22
  574.21405 25.0 25
  583.41858 59.0 59
  585.41327 25.0 25
  587.41144 23.0 23
  588.2041 22.0 22
  597.89246 37.0 37
  599.23914 24.0 24
  601.39008 20.0 20
  601.40186 48.0 48
  601.43286 29.0 29
  602.41699 29.0 29
  603.18909 22.0 22
  617.23981 29.0 29
  618.42511 25.0 25
  619.38538 42.0 42
  619.41968 341.0 341
  620.41675 140.0 140
  620.44684 20.0 20
  621.44403 51.0 51
  635.34204 20.0 20
  635.41376 43.0 43
  636.39465 54.0 54
  636.43073 20.0 20
  659.24988 24.0 24
  697.42792 22.0 22
  714.47992 24.0 24
  719.46338 39.0 39
  746.4422 22.0 22
  751.44379 68.0 68
  752.44031 24.0 24
  752.46857 29.0 29
  753.41174 29.0 29
  753.44745 24.0 24
  753.50598 22.0 22
  765.49725 47.0 47
  766.50317 22.0 22
  767.4458 53.0 53
  769.43756 22.0 22
  781.47168 85.0 85
  782.4519 20.0 20
  782.50781 47.0 47
  784.45142 24.0 24
  797.44708 22.0 22
  798.49756 20.0 20
  838.46106 23.0 23
  881.28589 24.0 24
  913.54852 22.0 22
  963.26056 20.0 20
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo