MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR301872

Hederacoside C; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR301872
RECORD_TITLE: Hederacoside C; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Hederacoside C
CH$COMPOUND_CLASS: Triterpene saponins
CH$FORMULA: C59H96O26
CH$EXACT_MASS: 1221.391
CH$SMILES: C[C@@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](OC[C@H]3O[C@@H](OC(=O)[C@]45CCC(C)(C)C[C@H]4C4=CC[C@@H]6[C@@]7(C)CC[C@H](O[C@@H]8OC[C@H](O)[C@H](O)[C@H]8O[C@@H]8O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]8O)[C@@](C)(CO)[C@@H]7CC[C@@]6(C)[C@]4(C)CC5)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C59H96O26/c1-24-34(63)38(67)42(71)49(78-24)83-46-29(20-60)80-48(45(74)41(46)70)77-22-30-37(66)40(69)44(73)51(81-30)85-53(75)59-17-15-54(3,4)19-27(59)26-9-10-32-55(5)13-12-33(56(6,23-61)31(55)11-14-58(32,8)57(26,7)16-18-59)82-52-47(36(65)28(62)21-76-52)84-50-43(72)39(68)35(64)25(2)79-50/h9,24-25,27-52,60-74H,10-23H2,1-8H3/t24-,25-,27-,28-,29+,30+,31+,32+,33-,34-,35-,36-,37+,38+,39+,40-,41+,42+,43+,44+,45+,46+,47+,48+,49-,50-,51-,52-,55-,56-,57+,58+,59-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY RYHDIBJJJRNDSX-MCGLQMIESA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.37805
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 1221.62626

PK$SPLASH: splash10-0ab9-1082923502-139587f7973bfbc1bdce
PK$NUM_PEAK: 184
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  66.52644 63.0 63
  87.04984 102.0 102
  129.05038 46.0 46
  147.06396 54.0 54
  149.12573 46.0 46
  155.06371 41.0 41
  189.1716 105.0 105
  201.16396 49.0 49
  207.17838 97.0 97
  217.15085 49.0 49
  237.07599 56.0 56
  238.08626 49.0 49
  239.08818 51.0 51
  241.06619 49.0 49
  243.08418 44.0 44
  244.08131 54.0 54
  255.0885 49.0 49
  257.09592 41.0 41
  257.10406 80.0 80
  258.10248 58.0 58
  259.08572 127.0 127
  273.08847 197.0 197
  273.09979 277.0 277
  274.09555 100.0 100
  275.08752 51.0 51
  275.11627 100.0 100
  276.11783 49.0 49
  279.09967 190.0 190
  279.11282 380.0 380
  280.10623 107.0 107
  281.12488 56.0 56
  286.62772 56.0 56
  291.98044 51.0 51
  293.08374 54.0 54
  293.12119 236.0 236
  294.13513 41.0 41
  295.09607 119.0 119
  296.30051 44.0 44
  309.09198 49.0 49
  309.12131 613.0 612
  328.10406 49.0 49
  341.01309 80.0 80
  345.26236 49.0 49
  365.13409 54.0 54
  383.13828 224.0 224
  387.12491 95.0 95
  389.14243 49.0 49
  392.3317 63.0 63
  395.29947 51.0 51
  401.14362 46.0 46
  405.12885 100.0 100
  409.35419 73.0 73
  419.16229 95.0 95
  423.14279 46.0 46
  425.1972 49.0 49
  426.3436 56.0 56
  437.24371 58.0 58
  437.32474 173.0 173
  437.33966 433.0 433
  437.35907 234.0 234
  438.18213 51.0 51
  438.34824 146.0 146
  438.36749 41.0 41
  439.25888 44.0 44
  439.34198 44.0 44
  439.35782 51.0 51
  441.15271 112.0 112
  441.16724 161.0 161
  442.17279 80.0 80
  454.33466 49.0 49
  455.16666 321.0 321
  455.2901 49.0 49
  455.32068 49.0 49
  455.35736 849.0 848
  456.14136 44.0 44
  456.34244 119.0 119
  456.35757 119.0 119
  456.37439 44.0 44
  458.17859 41.0 41
  471.17877 445.0 445
  472.15997 41.0 41
  472.81815 46.0 46
  473.35922 90.0 90
  473.37897 41.0 41
  539.37079 41.0 41
  552.1853 44.0 44
  564.20416 44.0 44
  565.38208 207.0 207
  565.40692 66.0 66
  567.19983 100.0 100
  582.20465 46.0 46
  583.21698 41.0 41
  583.37036 61.0 61
  583.38629 90.0 90
  584.40594 105.0 105
  587.22412 263.0 263
  601.38605 61.0 61
  601.409 51.0 51
  601.45081 44.0 44
  603.19183 41.0 41
  603.22205 41.0 41
  605.39496 41.0 41
  605.42303 49.0 49
  607.41565 41.0 41
  607.44586 46.0 46
  612.71564 58.0 58
  617.19305 49.0 49
  617.20844 51.0 51
  618.25012 109.0 109
  618.64441 44.0 44
  619.2326 122.0 122
  619.3963 51.0 51
  619.42981 547.0 546
  619.61017 41.0 41
  620.40472 97.0 97
  620.43469 44.0 44
  635.40436 102.0 102
  636.41437 41.0 41
  655.77844 41.0 41
  659.21338 83.0 83
  677.888 51.0 51
  711.40662 44.0 44
  713.23181 49.0 49
  713.25421 46.0 46
  713.27649 49.0 49
  720.47522 41.0 41
  720.79388 46.0 46
  729.45599 46.0 46
  734.53961 44.0 44
  749.26923 251.0 251
  750.24976 41.0 41
  750.27783 41.0 41
  751.41919 58.0 58
  751.44702 248.0 248
  751.47876 153.0 153
  752.40527 44.0 44
  752.43732 46.0 46
  752.46027 49.0 49
  752.48383 44.0 44
  753.47046 41.0 41
  753.49017 49.0 49
  764.48645 61.0 61
  765.46948 44.0 44
  765.49335 90.0 90
  766.46185 63.0 63
  766.50629 56.0 56
  767.44159 85.0 85
  767.46545 68.0 68
  781.4729 151.0 151
  782.47925 285.0 285
  783.49713 49.0 49
  797.43982 41.0 41
  797.46863 68.0 68
  859.4953 56.0 56
  861.52563 66.0 66
  897.54114 41.0 41
  898.5072 95.0 95
  898.52289 49.0 49
  898.57129 56.0 56
  899.50708 49.0 49
  913.51965 197.0 197
  914.50568 112.0 112
  915.50214 66.0 66
  927.50885 139.0 139
  927.56372 58.0 58
  928.54547 49.0 49
  929.47815 41.0 41
  930.6015 46.0 46
  943.47723 63.0 63
  943.52515 100.0 100
  944.49847 41.0 41
  944.52545 88.0 88
  1040.47156 44.0 44
  1059.57373 49.0 49
  1059.60388 92.0 92
  1060.54065 95.0 95
  1075.57068 61.0 61
  1089.56763 41.0 41
  1089.59814 102.0 102
  1090.55164 114.0 114
  1091.59448 58.0 58
  1186.48645 49.0 49
  1221.57483 273.0 273
  1221.63342 1000.0 999
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo