MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303984

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303984
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)[C@H]1[C@@H]2[C@H](COC2=O)[C@@H](O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3/t13-,18+,19-,20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-XVVDYKMHSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26135
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.1387441

PK$SPLASH: splash10-000i-0964000000-f6e68572cbf112d0d65c
PK$NUM_PEAK: 323
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  85.0284 21.0 21
  103.05686 20.0 20
  104.05579 9.0 9
  108.04578 14.0 14
  108.0561 9.0 9
  109.0303 14.0 14
  115.05154 28.0 28
  115.05765 33.0 33
  117.05712 8.0 8
  117.06448 35.0 35
  117.07104 99.0 99
  118.07489 18.0 18
  119.02936 9.0 9
  119.04398 14.0 14
  120.00465 9.0 9
  122.03493 28.0 28
  122.0423 15.0 15
  125.06002 12.0 12
  126.06424 24.0 24
  127.05729 12.0 12
  129.06911 21.0 21
  131.04947 34.0 34
  132.79884 9.0 9
  133.06076 9.0 9
  133.06705 34.0 34
  135.03947 52.0 52
  135.04715 61.0 61
  135.05681 15.0 15
  136.04678 16.0 16
  138.07092 13.0 13
  141.08571 14.0 14
  141.24362 9.0 9
  143.04166 18.0 18
  143.05247 87.0 87
  144.05211 31.0 31
  144.56793 9.0 9
  145.05083 9.0 9
  145.06233 302.0 302
  145.06943 166.0 166
  146.06902 39.0 39
  147.04778 33.0 33
  147.07982 11.0 11
  151.03925 36.0 36
  153.05287 78.0 78
  153.39444 8.0 8
  154.05577 36.0 36
  154.06288 41.0 41
  155.04808 15.0 15
  156.05553 23.0 23
  159.03807 12.0 12
  159.0466 8.0 8
  159.06139 17.0 17
  160.04875 9.0 9
  161.05414 80.0 80
  161.06223 57.0 57
  167.062 10.0 10
  168.07687 73.0 73
  169.04907 7.0 7
  169.08537 31.0 31
  169.09413 9.0 9
  170.08037 9.0 9
  171.04202 9.0 9
  171.05241 27.0 27
  172.05156 15.0 15
  173.04131 13.0 13
  173.06339 322.0 322
  174.06021 15.0 15
  174.06696 21.0 21
  174.07687 23.0 23
  175.0488 13.0 13
  175.07635 224.0 224
  176.06664 13.0 13
  176.0836 21.0 21
  177.05125 19.0 19
  177.06058 11.0 11
  178.04945 9.0 9
  181.09027 9.0 9
  181.15846 8.0 8
  183.05891 11.0 11
  183.08134 7.0 7
  184.05989 10.0 10
  185.05902 1000.0 999
  185.16631 7.0 7
  185.79588 24.0 24
  186.06209 161.0 161
  187.045 8.0 8
  187.05293 16.0 16
  188.02991 11.0 11
  188.04633 28.0 28
  188.05687 7.0 7
  188.42757 15.0 15
  189.03763 27.0 27
  189.05211 151.0 151
  189.06035 84.0 84
  190.04405 19.0 19
  190.0589 36.0 36
  190.07028 31.0 31
  190.20331 8.0 8
  191.06364 39.0 39
  193.04372 10.0 10
  193.05991 22.0 22
  194.90048 8.0 8
  195.06938 99.0 99
  195.10696 8.0 8
  198.08627 11.0 11
  198.0952 8.0 8
  198.44995 10.0 10
  199.03505 22.0 22
  199.04326 33.0 33
  200.04358 10.0 10
  201.0522 112.0 112
  201.06279 41.0 41
  202.05031 30.0 30
  202.065 24.0 24
  202.59103 7.0 7
  203.07034 70.0 70
  204.06464 17.0 17
  208.0699 40.0 40
  211.05946 8.0 8
  211.07323 11.0 11
  212.08421 8.0 8
  213.11867 14.0 14
  214.10721 15.0 15
  215.03941 27.0 27
  217.04872 8.0 8
  218.05745 9.0 9
  219.00569 9.0 9
  219.05002 15.0 15
  219.06587 101.0 101
  219.10439 10.0 10
  220.06682 7.0 7
  220.07828 8.0 8
  221.07214 15.0 15
  228.95602 9.0 9
  229.04913 273.0 273
  230.04022 47.0 47
  230.0554 35.0 35
  230.06499 10.0 10
  231.06326 8.0 8
  232.05446 31.0 31
  235.07372 10.0 10
  235.11369 10.0 10
  236.08153 11.0 11
  236.89682 9.0 9
  237.05045 12.0 12
  239.06996 36.0 36
  241.08928 11.0 11
  246.04881 8.0 8
  247.05536 72.0 72
  247.06396 151.0 151
  248.05838 7.0 7
  248.07837 27.0 27
  249.08435 13.0 13
  250.05318 27.0 27
  251.0657 11.0 11
  253.03314 15.0 15
  254.05635 24.0 24
  256.06784 9.0 9
  256.14151 17.0 17
  256.43649 7.0 7
  257.09036 16.0 16
  259.06799 9.0 9
  259.08124 22.0 22
  260.04016 11.0 11
  260.10974 16.0 16
  261.04803 12.0 12
  261.06497 13.0 13
  261.07651 11.0 11
  262.06726 8.0 8
  263.07858 28.0 28
  264.0661 8.0 8
  264.08627 12.0 12
  266.06732 11.0 11
  267.05396 8.0 8
  267.06992 36.0 36
  268.08759 12.0 12
  268.1507 13.0 13
  269.08224 36.0 36
  271.0607 9.0 9
  271.08871 12.0 12
  274.06049 9.0 9
  274.07867 20.0 20
  275.06363 13.0 13
  275.09457 18.0 18
  276.0737 39.0 39
  277.07709 9.0 9
  277.09662 12.0 12
  279.10211 20.0 20
  280.08035 21.0 21
  281.07336 12.0 12
  282.08844 431.0 431
  282.1059 71.0 71
  283.05698 127.0 127
  283.08255 59.0 59
  283.09909 42.0 42
  284.05869 12.0 12
  284.07883 16.0 16
  285.10559 19.0 19
  285.26727 7.0 7
  288.06641 18.0 18
  288.08771 13.0 13
  289.08609 38.0 38
  289.10611 8.0 8
  290.06006 10.0 10
  290.08463 12.0 12
  290.10089 68.0 68
  291.05759 10.0 10
  291.07086 9.0 9
  291.09802 30.0 30
  291.11429 28.0 28
  292.06366 14.0 14
  292.1153 20.0 20
  293.08243 7.0 7
  293.11859 21.0 21
  294.10037 9.0 9
  294.12384 9.0 9
  295.05304 9.0 9
  295.09348 16.0 16
  295.11536 9.0 9
  297.06406 24.0 24
  297.08405 17.0 17
  297.92261 7.0 7
  298.0697 51.0 51
  298.08841 70.0 70
  299.06854 8.0 8
  299.07944 11.0 11
  299.09311 10.0 10
  300.09897 12.0 12
  303.10199 24.0 24
  304.06076 8.0 8
  304.0686 24.0 24
  304.08118 16.0 16
  305.0575 17.0 17
  305.07541 57.0 57
  306.05945 16.0 16
  306.08554 151.0 151
  307.05774 10.0 10
  307.07892 50.0 50
  307.09253 133.0 133
  307.1113 29.0 29
  308.0704 8.0 8
  308.09692 26.0 26
  308.11227 24.0 24
  309.08084 25.0 25
  310.05966 7.0 7
  310.11743 30.0 30
  310.13184 11.0 11
  312.05566 9.0 9
  312.09229 83.0 83
  312.11255 27.0 27
  313.09247 54.0 54
  313.11578 28.0 28
  313.12488 27.0 27
  314.0777 14.0 14
  314.11841 8.0 8
  316.07178 9.0 9
  319.08118 10.0 10
  319.10959 33.0 33
  320.0625 13.0 13
  320.09537 45.0 45
  320.11252 99.0 99
  321.07327 28.0 28
  321.08923 16.0 16
  321.11151 100.0 100
  322.06107 7.0 7
  322.07913 16.0 16
  322.10449 25.0 25
  322.11612 89.0 89
  323.08075 9.0 9
  323.10144 49.0 49
  323.89954 7.0 7
  324.05991 14.0 14
  324.10184 19.0 19
  325.03442 9.0 9
  325.10849 24.0 24
  325.25232 8.0 8
  329.09055 18.0 18
  329.11664 9.0 9
  330.08255 7.0 7
  330.11292 9.0 9
  333.06732 9.0 9
  333.07788 14.0 14
  334.07153 9.0 9
  334.09332 10.0 10
  335.08755 8.0 8
  335.09695 17.0 17
  336.08829 29.0 29
  336.10126 43.0 43
  337.06763 9.0 9
  337.10593 74.0 74
  338.11301 7.0 7
  338.12482 15.0 15
  339.09088 29.0 29
  339.11182 20.0 20
  339.13217 11.0 11
  341.09763 9.0 9
  347.07407 11.0 11
  348.09207 39.0 39
  349.03989 9.0 9
  349.05731 9.0 9
  349.08005 48.0 48
  349.10568 32.0 32
  350.0723 10.0 10
  351.08823 15.0 15
  351.10736 37.0 37
  351.12979 67.0 67
  352.08728 8.0 8
  352.13245 39.0 39
  353.09549 12.0 12
  354.09692 27.0 27
  355.10873 18.0 18
  364.07208 21.0 21
  364.09195 46.0 46
  365.09097 12.0 12
  366.09406 12.0 12
  366.1048 16.0 16
  367.11285 22.0 22
  368.08014 9.0 9
  369.16669 12.0 12
  379.10004 9.0 9
  382.11496 12.0 12
  384.10272 7.0 7
  397.12875 9.0 9
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo