MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303989

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303989
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)[C@H]1[C@@H]2[C@H](COC2=O)[C@@H](O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3/t13-,18+,19-,20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-XVVDYKMHSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26135
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.1387441

PK$SPLASH: splash10-014r-0960000000-9269d1b20a30e5e6639d
PK$NUM_PEAK: 258
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  65.04372 24.0 24
  78.35412 21.0 21
  79.05279 33.0 33
  91.05243 25.0 25
  91.0575 39.0 39
  93.03331 44.0 44
  103.05307 67.0 67
  105.03843 24.0 24
  105.07182 89.0 89
  109.027 26.0 26
  110.03529 35.0 35
  115.05263 737.0 736
  115.06287 81.0 81
  116.05205 74.0 74
  116.0629 124.0 124
  116.86576 28.0 28
  117.03409 46.0 46
  117.06966 1000.0 999
  118.03884 26.0 26
  118.06789 35.0 35
  118.07585 37.0 37
  119.08175 25.0 25
  121.02766 99.0 99
  122.03368 91.0 91
  122.0407 67.0 67
  123.04703 54.0 54
  125.05916 60.0 60
  127.05349 323.0 323
  128.05981 221.0 221
  128.07266 43.0 43
  128.57564 35.0 35
  130.04282 94.0 94
  131.04922 416.0 416
  131.06444 24.0 24
  132.53391 20.0 20
  133.06342 130.0 130
  133.075 39.0 39
  134.04369 22.0 22
  135.03793 113.0 113
  135.04446 282.0 282
  136.04932 30.0 30
  137.05293 26.0 26
  138.06287 35.0 35
  139.05234 33.0 33
  139.07948 22.0 22
  143.04677 220.0 220
  144.04599 24.0 24
  144.0537 73.0 73
  144.90707 26.0 26
  145.06569 446.0 446
  145.07823 24.0 24
  146.06453 43.0 43
  147.05559 25.0 25
  147.06802 32.0 32
  148.04262 24.0 24
  148.04999 25.0 25
  148.60695 28.0 28
  149.02507 20.0 20
  149.0551 30.0 30
  150.02864 58.0 58
  151.03824 60.0 60
  152.06287 20.0 20
  153.0717 110.0 110
  155.05016 169.0 169
  156.05171 31.0 31
  157.06979 24.0 24
  159.03323 67.0 67
  159.04547 65.0 65
  160.05836 45.0 45
  162.05386 34.0 34
  163.06036 24.0 24
  164.06137 52.0 52
  165.07156 78.0 78
  166.0415 21.0 21
  167.08246 24.0 24
  168.07329 27.0 27
  169.06174 28.0 28
  169.08025 38.0 38
  171.03949 203.0 203
  172.05481 22.0 22
  173.05214 39.0 39
  173.06308 33.0 33
  174.05875 38.0 38
  175.05763 27.0 27
  176.06534 24.0 24
  177.07489 55.0 55
  178.07608 24.0 24
  178.98967 20.0 20
  180.04868 21.0 21
  180.06358 21.0 21
  180.10269 67.0 67
  181.06198 64.0 64
  181.0927 28.0 28
  184.08669 33.0 33
  185.05753 849.0 848
  185.64247 24.0 24
  186.05627 35.0 35
  186.0672 60.0 60
  187.03683 61.0 61
  188.04417 54.0 54
  188.05562 37.0 37
  189.06061 156.0 156
  189.07938 31.0 31
  190.07976 26.0 26
  190.08797 41.0 41
  191.07368 54.0 54
  192.05673 30.0 30
  193.07915 20.0 20
  194.08148 32.0 32
  195.04344 31.0 31
  196.06223 33.0 33
  197.05499 33.0 33
  198.06419 20.0 20
  198.07126 30.0 30
  199.04674 25.0 25
  200.05208 66.0 66
  201.05627 20.0 20
  201.06705 21.0 21
  204.04976 24.0 24
  204.09111 30.0 30
  205.06229 67.0 67
  205.07764 30.0 30
  206.05937 21.0 21
  207.05435 20.0 20
  207.09436 33.0 33
  208.04764 39.0 39
  208.09132 21.0 21
  209.06111 77.0 77
  210.05962 47.0 47
  210.06973 107.0 107
  211.04381 38.0 38
  211.07509 53.0 53
  212.04874 20.0 20
  212.05701 28.0 28
  213.04327 34.0 34
  217.06285 41.0 41
  217.08833 24.0 24
  218.07344 55.0 55
  219.08153 51.0 51
  220.10057 20.0 20
  221.06564 61.0 61
  221.08951 30.0 30
  221.10214 33.0 33
  222.06317 20.0 20
  223.07272 53.0 53
  224.05045 77.0 77
  225.04544 99.0 99
  225.05621 76.0 76
  226.06123 63.0 63
  227.92998 34.0 34
  229.04453 55.0 55
  230.93146 21.0 21
  231.07962 47.0 47
  233.04584 60.0 60
  233.0575 111.0 111
  233.07558 47.0 47
  234.09621 20.0 20
  235.06682 68.0 68
  235.08795 53.0 53
  236.07478 144.0 144
  236.08759 51.0 51
  237.06133 79.0 79
  237.37881 27.0 27
  238.06538 26.0 26
  239.07211 336.0 336
  239.08374 45.0 45
  240.06694 20.0 20
  240.08374 90.0 90
  241.04715 37.0 37
  241.05608 41.0 41
  241.08092 59.0 59
  241.30981 33.0 33
  247.07498 149.0 149
  247.08522 33.0 33
  248.08778 34.0 34
  248.28134 22.0 22
  249.06218 25.0 25
  249.08463 30.0 30
  250.08089 46.0 46
  251.03224 35.0 35
  251.06874 24.0 24
  251.11876 58.0 58
  252.03595 25.0 25
  252.07466 22.0 22
  253.02629 61.0 61
  253.05214 98.0 98
  254.04843 91.0 91
  254.06009 22.0 22
  255.05605 40.0 40
  255.06892 97.0 97
  256.32822 21.0 21
  257.96359 24.0 24
  259.07248 48.0 48
  261.05844 32.0 32
  261.09479 26.0 26
  261.96185 24.0 24
  262.04681 39.0 39
  262.06412 106.0 106
  263.06287 89.0 89
  263.07877 94.0 94
  263.1026 20.0 20
  263.10983 63.0 63
  264.03967 20.0 20
  264.07574 31.0 31
  266.05341 38.0 38
  267.05066 25.0 25
  267.06555 151.0 151
  268.06134 30.0 30
  269.06216 52.0 52
  269.07596 24.0 24
  269.10098 24.0 24
  270.07214 27.0 27
  273.09955 21.0 21
  275.05472 76.0 76
  275.07486 104.0 104
  276.05939 68.0 68
  276.08041 27.0 27
  277.04413 32.0 32
  277.09677 30.0 30
  278.04022 31.0 31
  278.06927 91.0 91
  278.08328 53.0 53
  278.92081 22.0 22
  279.07114 25.0 25
  280.03934 50.0 50
  281.09845 25.0 25
  281.11462 25.0 25
  282.05948 35.0 35
  282.07715 32.0 32
  282.09729 87.0 87
  283.05566 34.0 34
  283.07037 93.0 93
  287.07803 25.0 25
  289.05295 60.0 60
  289.10815 31.0 31
  289.26855 32.0 32
  290.0845 91.0 91
  290.09924 27.0 27
  291.05276 70.0 70
  291.07361 24.0 24
  292.07251 28.0 28
  293.05252 20.0 20
  293.10156 26.0 26
  294.04932 25.0 25
  294.09741 20.0 20
  294.68002 24.0 24
  295.06683 26.0 26
  305.07965 164.0 164
  307.09552 24.0 24
  308.06863 20.0 20
  309.07794 37.0 37
  317.84991 32.0 32
  323.09921 25.0 25
  332.08429 27.0 27
  338.103 27.0 27
  339.08652 22.0 22
  346.07941 21.0 21
  365.81598 61.0 61
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo