MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303990

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303990
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)[C@H]1[C@@H]2[C@H](COC2=O)[C@@H](O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3/t13-,18+,19-,20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-XVVDYKMHSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26135
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.1387441

PK$SPLASH: splash10-0002-0689100000-977181d3a444fc021e4a
PK$NUM_PEAK: 261
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  85.02766 17.0 17
  103.05689 8.0 8
  115.05494 25.0 25
  117.06809 35.0 35
  117.39807 7.0 7
  118.07465 11.0 11
  119.05373 5.0 5
  122.01287 7.0 7
  122.0358 26.0 26
  125.06001 8.0 8
  131.04985 29.0 29
  133.06099 9.0 9
  134.03185 8.0 8
  135.04329 77.0 77
  136.0394 11.0 11
  136.04871 7.0 7
  137.05156 10.0 10
  138.06642 5.0 5
  143.05002 16.0 16
  144.57617 9.0 9
  145.06398 98.0 98
  146.06534 16.0 16
  146.07283 23.0 23
  147.0433 17.0 17
  147.07942 10.0 10
  150.04794 11.0 11
  151.0388 7.0 7
  155.04851 11.0 11
  159.04433 10.0 10
  160.05063 27.0 27
  161.05928 15.0 15
  163.04794 19.0 19
  165.05312 14.0 14
  166.84587 10.0 10
  167.06599 6.0 6
  167.07973 6.0 6
  168.07437 20.0 20
  168.08057 25.0 25
  168.88728 7.0 7
  169.08528 121.0 121
  170.09311 24.0 24
  171.03259 11.0 11
  171.04671 6.0 6
  172.04248 7.0 7
  173.05791 47.0 47
  173.07132 16.0 16
  174.0506 8.0 8
  175.0764 66.0 66
  176.07903 7.0 7
  177.05739 6.0 6
  179.86215 10.0 10
  181.08894 32.0 32
  183.71074 6.0 6
  184.34232 9.0 9
  184.98352 9.0 9
  185.06085 386.0 386
  185.10881 6.0 6
  186.06386 66.0 66
  186.07509 10.0 10
  187.02902 8.0 8
  187.03766 8.0 8
  187.0457 8.0 8
  187.05452 6.0 6
  188.04303 42.0 42
  188.06058 8.0 8
  189.05386 94.0 94
  191.07082 6.0 6
  192.0695 9.0 9
  193.03909 8.0 8
  193.05273 8.0 8
  193.07021 8.0 8
  195.06718 38.0 38
  196.07045 8.0 8
  198.09111 5.0 5
  199.0416 18.0 18
  200.04292 10.0 10
  201.0484 8.0 8
  201.06126 36.0 36
  202.05949 8.0 8
  202.06795 23.0 23
  203.06883 36.0 36
  204.06673 19.0 19
  204.07878 12.0 12
  208.0578 5.0 5
  213.05487 5.0 5
  219.06169 54.0 54
  219.071 55.0 55
  219.08574 9.0 9
  220.03558 6.0 6
  220.06517 8.0 8
  221.08322 12.0 12
  224.05971 8.0 8
  225.04344 11.0 11
  226.05823 8.0 8
  226.08516 6.0 6
  226.09439 8.0 8
  229.04855 219.0 219
  230.0043 7.0 7
  230.04814 47.0 47
  230.05991 14.0 14
  232.09164 5.0 5
  233.07304 9.0 9
  237.05659 7.0 7
  238.05711 8.0 8
  239.03551 5.0 5
  239.07297 23.0 23
  240.07124 6.0 6
  240.89914 6.0 6
  243.74443 7.0 7
  246.0696 8.0 8
  247.01842 8.0 8
  247.05988 716.0 715
  248.06442 69.0 69
  249.05254 6.0 6
  249.06656 18.0 18
  249.92929 5.0 5
  251.03198 9.0 9
  251.06273 9.0 9
  251.11151 7.0 7
  252.03893 9.0 9
  253.08415 10.0 10
  253.10628 6.0 6
  254.04626 12.0 12
  255.06386 15.0 15
  256.06479 5.0 5
  258.82761 6.0 6
  260.08163 5.0 5
  261.05197 6.0 6
  263.07031 17.0 17
  267.06192 25.0 25
  267.07431 36.0 36
  268.05878 8.0 8
  268.07764 8.0 8
  270.95779 6.0 6
  273.0592 8.0 8
  275.08755 13.0 13
  275.31412 6.0 6
  276.07147 6.0 6
  276.08847 7.0 7
  277.09006 7.0 7
  278.08517 6.0 6
  279.06192 18.0 18
  279.10086 10.0 10
  280.06735 6.0 6
  281.08334 8.0 8
  282.0889 133.0 133
  283.06204 60.0 60
  283.08487 13.0 13
  283.10165 24.0 24
  284.06421 19.0 19
  285.10181 6.0 6
  286.0806 9.0 9
  288.0773 9.0 9
  290.08469 15.0 15
  290.10254 9.0 9
  291.07062 6.0 6
  291.08276 8.0 8
  291.10147 8.0 8
  292.03815 10.0 10
  292.07782 19.0 19
  293.06882 16.0 16
  295.05673 7.0 7
  297.06717 14.0 14
  297.0849 7.0 7
  297.10724 6.0 6
  298.08002 82.0 82
  299.04929 7.0 7
  299.07742 10.0 10
  299.09164 9.0 9
  300.064 6.0 6
  300.08371 7.0 7
  305.07462 40.0 40
  306.09058 62.0 62
  307.09161 22.0 22
  309.09644 6.0 6
  310.09647 6.0 6
  311.07306 7.0 7
  311.53012 8.0 8
  312.0907 5.0 5
  312.10617 20.0 20
  313.06763 6.0 6
  313.10141 155.0 155
  313.11615 48.0 48
  313.46191 5.0 5
  314.11044 13.0 13
  317.09174 6.0 6
  318.03683 8.0 8
  319.10156 21.0 21
  320.1004 22.0 22
  320.11026 22.0 22
  321.07025 8.0 8
  321.10864 60.0 60
  321.12393 12.0 12
  322.08096 7.0 7
  322.10876 35.0 35
  322.13339 13.0 13
  323.09113 20.0 20
  323.11047 14.0 14
  324.08624 5.0 5
  326.11179 6.0 6
  329.10284 10.0 10
  333.07495 29.0 29
  335.09238 6.0 6
  336.11124 9.0 9
  337.09689 7.0 7
  337.11172 20.0 20
  338.10641 23.0 23
  339.09833 5.0 5
  339.11755 5.0 5
  339.80716 7.0 7
  340.10196 6.0 6
  341.07602 8.0 8
  347.09137 14.0 14
  348.0675 6.0 6
  348.09262 7.0 7
  348.10873 23.0 23
  349.06061 9.0 9
  349.10175 9.0 9
  351.09055 22.0 22
  351.11795 70.0 70
  352.06732 13.0 13
  352.09589 14.0 14
  352.13068 6.0 6
  353.11105 5.0 5
  353.1384 14.0 14
  354.10251 15.0 15
  355.11334 29.0 29
  359.09198 6.0 6
  364.09067 15.0 15
  365.09552 6.0 6
  366.09061 9.0 9
  366.10977 15.0 15
  366.27478 5.0 5
  367.08218 9.0 9
  367.125 8.0 8
  369.13962 7.0 7
  377.09927 10.0 10
  378.68176 8.0 8
  379.10309 8.0 8
  379.12375 26.0 26
  380.1062 11.0 11
  380.12207 8.0 8
  382.11115 11.0 11
  383.112 6.0 6
  395.11014 6.0 6
  396.11755 18.0 18
  397.09326 30.0 30
  397.12741 1000.0 999
  397.24219 6.0 6
  398.12878 207.0 207
  398.82227 10.0 10
  399.11078 22.0 22
  399.12866 60.0 60
  399.14429 25.0 25
  401.15063 7.0 7
  413.95352 7.0 7
  414.12952 288.0 288
  414.94202 6.0 6
  415.11859 27.0 27
  415.13895 147.0 147
  415.25235 7.0 7
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo