MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303993

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303993
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)[C@H]1[C@@H]2[C@H](COC2=O)[C@@H](O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3/t13-,18+,19-,20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-XVVDYKMHSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26135
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.1387441

PK$SPLASH: splash10-014r-0940000000-93a1cf9acd2d2f9b5eb4
PK$NUM_PEAK: 219
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  67.0566 18.0 18
  77.03568 25.0 25
  78.04506 32.0 32
  79.04794 27.0 27
  79.05502 85.0 85
  91.0524 37.0 37
  93.03376 68.0 68
  96.05486 46.0 46
  103.04501 27.0 27
  103.05556 37.0 37
  105.06803 58.0 58
  105.07323 50.0 50
  110.03148 42.0 42
  110.22872 26.0 26
  114.04154 44.0 44
  115.05466 823.0 822
  115.55753 30.0 30
  115.95602 21.0 21
  116.0554 75.0 75
  116.06223 70.0 70
  117.03792 25.0 25
  117.05756 29.0 29
  117.06948 694.0 693
  118.04092 64.0 64
  119.05025 50.0 50
  121.03152 19.0 19
  122.02947 63.0 63
  122.03542 152.0 152
  123.04079 58.0 58
  123.04872 18.0 18
  124.04489 20.0 20
  127.05524 603.0 602
  128.06461 144.0 144
  129.06027 25.0 25
  129.07024 142.0 142
  130.03656 18.0 18
  130.05067 23.0 23
  131.04877 189.0 189
  135.04382 227.0 227
  135.10396 30.0 30
  135.43292 26.0 26
  136.04547 27.0 27
  138.06049 37.0 37
  141.02399 21.0 21
  143.03328 22.0 22
  143.04469 49.0 49
  143.0601 21.0 21
  145.04518 28.0 28
  145.06425 289.0 289
  145.0728 128.0 128
  146.06769 37.0 37
  150.03203 31.0 31
  151.03194 25.0 25
  151.03944 63.0 63
  152.04373 26.0 26
  153.05786 26.0 26
  153.06464 48.0 48
  155.04869 224.0 224
  155.06003 22.0 22
  155.07169 26.0 26
  156.04796 57.0 57
  157.06236 29.0 29
  159.04185 102.0 102
  161.0596 41.0 41
  163.0369 23.0 23
  165.0493 21.0 21
  165.07274 21.0 21
  167.05602 23.0 23
  170.49075 23.0 23
  171.04543 34.0 34
  172.0536 27.0 27
  173.05446 102.0 102
  174.06125 31.0 31
  175.04237 19.0 19
  176.07333 138.0 138
  177.04617 36.0 36
  177.05614 22.0 22
  179.08028 22.0 22
  181.07034 18.0 18
  181.08305 26.0 26
  181.10332 31.0 31
  182.06927 19.0 19
  184.04465 32.0 32
  185.01208 19.0 19
  185.05803 1000.0 999
  186.06488 103.0 103
  187.03239 78.0 78
  187.04376 27.0 27
  188.03255 26.0 26
  188.04721 128.0 128
  189.04735 61.0 61
  189.07564 19.0 19
  189.19429 21.0 21
  191.08105 74.0 74
  192.09081 22.0 22
  193.05891 22.0 22
  194.06609 32.0 32
  195.07378 38.0 38
  196.05826 48.0 48
  198.06183 22.0 22
  201.02988 18.0 18
  201.05637 55.0 55
  201.07919 21.0 21
  202.07861 22.0 22
  203.08629 18.0 18
  205.0739 21.0 21
  206.08037 18.0 18
  207.07147 20.0 20
  208.09573 21.0 21
  209.0264 19.0 19
  209.05994 37.0 37
  210.07162 35.0 35
  211.0329 42.0 42
  211.06693 19.0 19
  211.07961 68.0 68
  212.03616 35.0 35
  214.06635 30.0 30
  217.05969 46.0 46
  218.96048 26.0 26
  219.07693 87.0 87
  219.09062 20.0 20
  221.07057 53.0 53
  221.08612 32.0 32
  222.08221 27.0 27
  223.03676 30.0 30
  223.0786 35.0 35
  224.04431 86.0 86
  224.05562 20.0 20
  225.05661 46.0 46
  226.05408 49.0 49
  226.07224 36.0 36
  229.03705 45.0 45
  231.03952 31.0 31
  231.07214 22.0 22
  231.08096 39.0 39
  233.05925 38.0 38
  234.07002 67.0 67
  235.07857 26.0 26
  237.05769 69.0 69
  237.06723 23.0 23
  237.08899 22.0 22
  238.06285 86.0 86
  239.05542 63.0 63
  239.06812 179.0 179
  240.03841 46.0 46
  240.15219 18.0 18
  241.03775 22.0 22
  241.09264 19.0 19
  242.04915 18.0 18
  244.07449 30.0 30
  245.0573 21.0 21
  246.06085 21.0 21
  247.06187 34.0 34
  247.08362 31.0 31
  248.07547 32.0 32
  249.05573 152.0 152
  250.05083 23.0 23
  250.06313 19.0 19
  251.03683 63.0 63
  251.06793 26.0 26
  251.67072 19.0 19
  252.03563 45.0 45
  252.43195 18.0 18
  253.08574 18.0 18
  254.05611 76.0 76
  254.09268 18.0 18
  257.0874 27.0 27
  259.08414 84.0 84
  260.02441 28.0 28
  260.07809 19.0 19
  261.0463 37.0 37
  261.05951 31.0 31
  262.04126 22.0 22
  262.06345 29.0 29
  262.08124 37.0 37
  262.66095 18.0 18
  263.07602 93.0 93
  265.04504 55.0 55
  267.06705 95.0 95
  267.0795 38.0 38
  267.104 39.0 39
  269.06354 21.0 21
  275.06882 84.0 84
  276.08401 47.0 47
  277.05859 37.0 37
  277.08313 70.0 70
  277.09839 36.0 36
  277.79398 25.0 25
  278.0629 21.0 21
  278.09363 22.0 22
  280.06247 21.0 21
  281.06628 25.0 25
  282.04916 42.0 42
  282.07104 20.0 20
  282.08194 65.0 65
  282.09671 43.0 43
  283.06494 166.0 166
  287.07343 42.0 42
  289.09265 21.0 21
  289.10376 18.0 18
  290.05859 34.0 34
  290.30878 21.0 21
  291.05649 37.0 37
  291.0762 21.0 21
  291.10086 23.0 23
  292.0687 30.0 30
  293.52521 18.0 18
  294.07343 22.0 22
  295.53754 23.0 23
  301.03769 19.0 19
  303.07455 31.0 31
  304.0694 21.0 21
  305.0813 115.0 115
  305.0928 29.0 29
  306.09631 27.0 27
  320.10605 34.0 34
  321.07053 19.0 19
  322.06644 23.0 23
  322.08389 21.0 21
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo