MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR310638

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR310638
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: Annotation level-1

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Alkaloids
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)C1C2C(COC2=O)C(O)C2=C1C=C1OCOC1=C2
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.13874

PK$SPLASH: splash10-0002-0689100000-858a0eead69f81fd642e
PK$NUM_PEAK: 292
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  77.03709 24.0 8
  79.17729 29.0 9
  85.02806 34.0 11
  98.031 32.0 10
  109.06868 29.0 9
  115.05515 47.0 15
  117.06815 133.0 43
  117.07506 48.0 16
  117.27039 18.0 6
  123.03662 23.0 8
  123.04313 17.0 6
  125.06015 53.0 17
  125.22266 17.0 6
  127.05061 29.0 9
  128.05441 18.0 6
  131.03648 23.0 8
  131.04732 45.0 15
  132.05388 28.0 9
  133.06541 41.0 13
  133.58533 21.0 7
  135.03798 69.0 23
  135.04343 89.0 29
  135.05037 29.0 9
  138.03395 29.0 9
  138.0687 28.0 9
  143.04626 94.0 31
  143.05612 39.0 13
  145.0645 672.0 220
  146.06891 156.0 51
  147.04164 71.0 23
  147.06897 36.0 12
  149.02859 60.0 20
  151.03534 64.0 21
  152.0428 39.0 13
  153.02934 20.0 7
  153.0507 72.0 24
  155.04834 22.0 7
  155.05879 20.0 7
  155.94504 30.0 10
  159.97929 24.0 8
  160.04831 79.0 26
  161.05882 144.0 47
  161.78685 26.0 8
  166.06372 24.0 8
  168.08696 47.0 15
  169.07867 133.0 43
  169.08762 95.0 31
  170.08479 24.0 8
  171.04959 97.0 32
  172.0477 19.0 6
  172.05891 40.0 13
  173.04756 42.0 14
  173.05969 470.0 154
  173.9269 29.0 9
  174.05469 22.0 7
  174.06416 72.0 24
  174.12981 25.0 8
  175.04546 17.0 6
  175.07394 54.0 18
  175.08522 34.0 11
  177.05122 27.0 9
  181.08226 105.0 34
  182.08986 21.0 7
  185.03336 21.0 7
  185.05922 1360.0 444
  185.07808 37.0 12
  186.06639 279.0 91
  186.18771 17.0 6
  187.06651 25.0 8
  187.082 19.0 6
  188.0295 19.0 6
  188.03905 25.0 8
  189.04767 154.0 50
  189.05905 107.0 35
  189.53658 17.0 6
  189.9646 20.0 7
  190.0645 88.0 29
  195.06367 59.0 19
  196.06859 50.0 16
  197.05486 23.0 8
  198.08328 25.0 8
  200.04272 18.0 6
  200.0564 18.0 6
  201.02507 25.0 8
  201.05197 227.0 74
  202.06711 21.0 7
  203.07076 270.0 88
  203.08496 47.0 15
  204.07175 55.0 18
  205.06752 22.0 7
  210.06563 18.0 6
  215.03583 18.0 6
  215.08896 25.0 8
  218.96492 22.0 7
  219.05226 45.0 15
  219.06859 372.0 122
  219.17859 30.0 10
  220.06467 73.0 24
  220.07478 37.0 12
  226.08331 40.0 13
  227.07153 21.0 7
  228.03145 17.0 6
  228.9751 22.0 7
  229.02509 52.0 17
  229.05183 1138.0 372
  230.05168 124.0 41
  232.10681 23.0 8
  233.05791 43.0 14
  235.0717 21.0 7
  235.08272 22.0 7
  237.03189 20.0 7
  238.06145 61.0 20
  239.05095 18.0 6
  239.06032 28.0 9
  239.07472 34.0 11
  240.09915 19.0 6
  246.04915 20.0 7
  247.06036 2256.0 737
  247.08084 40.0 13
  248.06302 319.0 104
  248.09125 26.0 8
  249.06161 110.0 36
  249.07776 79.0 26
  250.06119 23.0 8
  251.07874 22.0 7
  252.09888 21.0 7
  254.06432 40.0 13
  255.06134 41.0 13
  259.08676 51.0 17
  260.08304 47.0 15
  261.09897 24.0 8
  261.20868 22.0 7
  262.07108 21.0 7
  263.07547 25.0 8
  263.08466 48.0 16
  264.09378 22.0 7
  264.11157 20.0 7
  265.04062 25.0 8
  267.05136 22.0 7
  267.07129 46.0 15
  269.08078 78.0 25
  270.09576 20.0 7
  272.07645 18.0 6
  275.0498 27.0 9
  275.06961 20.0 7
  275.09015 26.0 8
  276.07455 61.0 20
  276.10095 60.0 20
  277.0817 50.0 16
  277.20212 28.0 9
  278.09753 58.0 19
  279.05936 28.0 9
  280.08765 29.0 9
  281.07574 18.0 6
  282.06259 25.0 8
  282.08807 667.0 218
  282.10495 87.0 28
  282.11603 23.0 8
  282.22964 18.0 6
  282.78271 24.0 8
  283.03467 18.0 6
  283.05951 28.0 9
  283.07413 71.0 23
  283.09131 178.0 58
  284.06784 20.0 7
  284.10199 22.0 7
  289.09158 91.0 30
  290.09256 73.0 24
  290.11426 20.0 7
  291.0564 19.0 6
  291.07358 17.0 6
  291.09656 41.0 13
  292.07489 68.0 22
  292.90582 27.0 9
  297.07455 56.0 18
  297.08713 45.0 15
  297.76984 20.0 7
  298.07788 84.0 27
  298.08752 78.0 25
  299.0939 78.0 25
  303.06601 85.0 28
  304.05939 35.0 11
  304.07751 27.0 9
  305.08093 57.0 19
  305.8472 18.0 6
  306.07446 68.0 22
  306.09219 257.0 84
  307.07489 33.0 11
  307.0975 109.0 36
  307.11121 22.0 7
  308.10086 77.0 25
  309.06668 22.0 7
  309.08804 20.0 7
  312.09271 115.0 38
  312.10944 42.0 14
  312.12262 17.0 6
  312.73499 18.0 6
  313.08414 51.0 17
  313.10272 481.0 157
  313.11508 295.0 96
  314.10309 90.0 29
  314.11923 70.0 23
  319.08447 19.0 6
  319.09662 29.0 9
  319.11938 65.0 21
  320.04172 21.0 7
  320.0647 17.0 6
  320.10663 74.0 24
  320.1265 25.0 8
  321.07385 49.0 16
  321.10046 50.0 16
  321.1254 20.0 7
  322.09052 20.0 7
  322.11148 95.0 31
  322.1268 44.0 14
  323.08899 52.0 17
  323.10315 25.0 8
  323.12158 27.0 9
  324.10464 19.0 6
  324.12262 27.0 9
  329.11295 25.0 8
  329.69934 18.0 6
  332.06998 42.0 14
  333.07663 59.0 19
  334.06021 37.0 12
  334.07843 31.0 10
  335.05685 27.0 9
  335.08545 34.0 11
  335.10806 17.0 6
  336.08719 63.0 21
  336.10397 80.0 26
  337.06622 17.0 6
  337.09085 20.0 7
  337.10681 70.0 23
  337.21011 18.0 6
  337.62238 20.0 7
  337.67255 38.0 12
  338.08496 42.0 14
  338.1304 36.0 12
  339.11688 27.0 9
  340.11615 17.0 6
  340.35889 18.0 6
  345.32877 17.0 6
  347.10321 21.0 7
  348.07428 20.0 7
  348.0914 21.0 7
  348.10303 20.0 7
  348.11911 24.0 8
  348.15784 25.0 8
  349.07169 57.0 19
  349.10733 38.0 12
  351.10574 37.0 12
  351.12662 112.0 37
  352.12363 80.0 26
  352.13315 48.0 16
  353.14301 62.0 20
  354.10522 25.0 8
  355.10938 40.0 13
  355.13715 94.0 31
  356.12674 18.0 6
  364.10309 18.0 6
  364.11572 17.0 6
  365.08774 18.0 6
  366.06314 25.0 8
  366.10132 99.0 32
  367.08521 19.0 6
  367.10565 76.0 25
  367.68045 18.0 6
  373.12479 26.0 8
  376.50171 20.0 7
  379.11285 65.0 21
  379.12534 130.0 42
  380.12122 113.0 37
  381.08881 18.0 6
  381.10693 31.0 10
  383.10736 23.0 8
  386.14447 21.0 7
  397.09549 52.0 17
  397.12943 3057.0 999
  397.2215 40.0 13
  398.13095 764.0 250
  399.09991 17.0 6
  399.11774 55.0 18
  399.14066 24.0 8
  400.11749 28.0 9
  400.95505 18.0 6
  414.09619 20.0 7
  414.12128 375.0 123
  414.13632 448.0 146
  415.09674 69.0 23
  415.11649 77.0 25
  415.1377 451.0 147
//

Imprint Feedback
system version 2.2.8

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Tillmann G. Fischer

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo