MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-NAIST-KNA00692

Cytidine; LC-ESI-ITFT; MS; NEG

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-NAIST-KNA00692
RECORD_TITLE: Cytidine; LC-ESI-ITFT; MS; NEG
DATE: 2016.01.19 (Created 2009.11.19, modified 2011.08.03)
AUTHORS: Takahashi H, Kanaya S, Ogasawara N, Graduate School of Information Science, NAIST
LICENSE: CC BY-SA
COMMENT: [Spectral] Cytidine (exact mass = 243.08552) and 3,4-Dihydroxy-L-phenylalanine (exact mass = 197.06881) and NAD+ (exact mass = 663.10912) were not completely separated on HPLC under the present analytical conditions as described in "AC$XXX". Additionally some of the peaks in this data contains dimers and other unidentified ions.

CH$NAME: Cytidine
CH$COMPOUND_CLASS: Natural Product
CH$FORMULA: C9H13N3O5
CH$EXACT_MASS: 243.08552
CH$SMILES: OC[C@@H](O1)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1N(C=2)C(=O)N=C(N)C2
CH$IUPAC: InChI=1S/C9H13N3O5/c10-5-1-2-12(9(16)11-5)8-7(15)6(14)4(3-13)17-8/h1-2,4,6-8,13-15H,3H2,(H2,10,11,16)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1
CH$LINK: CAS 65-46-3
CH$LINK: CHEBI 17562
CH$LINK: KEGG C00475
CH$LINK: NIKKAJI J4.837B
CH$LINK: PUBCHEM 3758
CH$LINK: INCHIKEY UHDGCWIWMRVCDJ-XVFCMESISA-N
CH$LINK: COMPTOX DTXSID60891552

AC$INSTRUMENT: LTQ Orbitrap XL, Thermo Scientfic
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-ITFT
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 35eV
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME TOSOH TSKgel ODS-100V 5um Part no. 21456
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT 0min:3%, 45min:97%, 50min:97%, 50.1:3%, 57min:3% (acetonitrile)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.5 ml/min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.446143 min
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A 0.1%formate-water
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B 0.1%formate-acetonitrile

MS$FOCUSED_ION: BASE_PEAK 540.053894

PK$SPLASH: splash10-0006-0190172001-4ca783f5032ac1d04334
PK$NUM_PEAK: 379
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  108.033119 2622.781250 1
  109.029842 6408.827148 1
  109.037156 3040.349854 1
  109.038877 3240.656738 1
  109.041028 201562.500000 39
  109.042964 4632.454590 1
  110.036279 71794.273438 14
  110.044130 5966.591309 1
  112.985735 40952.539063 8
  122.037373 11570.173828 2
  124.007380 8160.251465 2
  133.014296 13410.049805 3
  134.047155 28589.134766 6
  135.045232 35509.441406 7
  139.007027 8036.193848 2
  150.056055 3910.977295 1
  152.046464 67864.335938 13
  153.049576 2902.204590 1
  158.925325 60134.414063 12
  174.979931 11450.901367 2
  179.034665 7882.043457 2
  192.990906 13175.540039 3
  196.014002 3407.321533 1
  196.049263 4326.449219 1
  196.052375 8802.897461 2
  196.057043 17027.005859 3
  196.061192 883731.750000 172
  196.066379 15559.880859 3
  196.069491 8666.301758 2
  196.072603 3119.624512 1
  196.074678 4304.937012 1
  196.108918 3267.941895 1
  197.064500 68877.601563 13
  198.065523 3511.352051 1
  199.072070 4220.405273 1
  208.061445 6874.622070 1
  211.000984 38861.289063 8
  232.037829 4371.226074 1
  241.881042 6677.862793 1
  242.012581 15915.370117 3
  242.023251 3225.475586 1
  242.036056 4109.203125 1
  242.038190 3701.968506 1
  242.043170 3284.246094 1
  242.044593 3945.643311 1
  242.046728 3464.737793 1
  242.048862 3331.038574 1
  242.051708 6350.448730 1
  242.054554 3484.021240 1
  242.055977 5147.738281 1
  242.060957 15351.689453 3
  242.065938 36368.691406 7
  242.071631 64656.613281 13
  242.078035 3989445.250000 775
  242.084439 68452.140625 13
  242.086574 8294.299805 2
  242.089421 37238.281250 7
  242.093691 11291.954102 2
  242.095826 18376.439453 4
  242.098673 6781.660645 1
  242.102943 6454.059082 1
  242.105790 4021.620850 1
  242.107213 2857.829834 1
  242.110060 5025.933594 1
  242.112907 3769.916260 1
  242.115754 2822.073486 1
  242.118601 5144.097656 1
  242.121448 2853.912598 1
  242.134261 2776.427979 1
  242.143515 15601.071289 3
  242.167009 2602.675293 1
  242.274556 7032.335449 1
  243.061605 6984.769531 1
  243.068764 3281.509766 1
  243.075208 14547.042969 3
  243.080936 350408.000000 68
  243.087381 5076.350586 1
  243.092393 3183.318604 1
  244.081438 26409.097656 5
  245.085229 3686.390625 1
  254.946176 3868.393799 1
  259.022108 3583.018555 1
  264.048921 5203.342285 1
  272.949778 2813.179199 1
  272.957446 188496.968750 37
  272.965114 3155.902832 1
  273.960461 4578.907715 1
  278.047590 2870.980957 1
  278.055474 169706.453125 33
  279.058560 11641.602539 2
  280.052032 50395.175781 10
  281.055269 3891.950928 1
  287.828679 4602.753906 1
  287.999432 11182.073242 2
  288.029907 3019.464844 1
  288.032678 3037.638672 1
  288.049302 4611.639648 1
  288.052997 2861.539795 1
  288.055768 3462.935547 1
  288.059463 9798.307617 2
  288.062234 11336.484375 2
  288.067776 25712.238281 5
  288.076090 48153.726563 9
  288.078861 17653.384766 3
  288.083480 2992312.000000 581
  288.092718 44128.320313 9
  288.095490 6289.948730 1
  288.098261 24844.423828 5
  288.103805 8413.126953 2
  288.107500 12426.750977 2
  288.116740 4045.070068 1
  288.125980 3229.467773 1
  288.128752 2871.481934 1
  288.136144 4099.123535 1
  288.168489 10658.649414 2
  288.339544 4867.915039 1
  289.080071 17262.535156 3
  289.086572 312333.593750 61
  289.093072 2901.608643 1
  289.095858 4633.018066 1
  290.086510 21023.476563 4
  290.090244 8235.905273 2
  290.966890 3774.531494 1
  305.073594 33447.976563 6
  306.049428 10798.941406 2
  318.094339 5937.209473 1
  328.044651 133500.437500 26
  329.048253 14263.237305 3
  332.109716 23804.591797 5
  333.112517 3691.879883 1
  340.045329 17737.929688 3
  340.054807 7020.607422 1
  342.002566 6376.315430 1
  346.055630 102537.390625 20
  347.058776 7964.646973 2
  350.010383 2758.357178 1
  356.070845 29062.078125 6
  366.009386 7347.128418 1
  367.092627 5946.364258 1
  378.897410 3446.406006 1
  380.485318 3119.394043 1
  386.011971 2753.783691 1
  387.968062 3732.427734 1
  393.129933 37423.304688 7
  394.133268 5630.473633 1
  403.147506 3398.180420 1
  407.997487 3541.339600 1
  408.011501 241253.718750 47
  408.025515 3085.670898 1
  409.014549 13759.414063 3
  426.021226 166283.640625 32
  426.968084 3738.071533 1
  427.024762 16238.363281 3
  428.026828 2866.975098 1
  439.117644 3152.681641 1
  439.133290 6356.889160 1
  439.147199 474241.843750 92
  439.155893 3826.640381 1
  439.162848 5062.185547 1
  439.175019 2882.653809 1
  440.150389 88213.734375 17
  441.153518 5550.485840 1
  485.163895 35423.406250 7
  486.166869 6139.102539 1
  487.553078 3321.935303 1
  489.941511 7754.619629 2
  493.149348 2840.912598 1
  504.941269 2602.664307 1
  507.951549 6736.559082 1
  512.609774 7881.682129 2
  513.112275 2848.213867 1
  514.997175 5619.786621 1
  518.894282 5200.307617 1
  521.141413 37364.582031 7
  522.145327 7784.020020 2
  523.138581 9396.694336 2
  529.475564 3763.610107 1
  529.947752 6195.726563 1
  531.129831 3176.439697 1
  531.150645 7447.561035 1
  531.171460 597724.562500 116
  531.192277 7282.336914 1
  531.206155 3502.006592 1
  532.174356 109191.664063 21
  533.177768 10414.464844 2
  535.001363 2702.396240 1
  538.074907 10054.796875 2
  539.397887 6336.690430 1
  539.836016 14393.840820 3
  539.871563 3081.009277 1
  539.914224 3589.455811 1
  539.923705 4091.037842 1
  539.933187 2700.218018 1
  539.942668 4647.595703 1
  539.949779 2650.920654 1
  539.956891 3611.489014 1
  539.966373 5623.260254 1
  539.975855 3573.777588 1
  539.980597 4678.577148 1
  539.990079 11549.985352 2
  539.997192 14689.151367 3
  540.013787 34135.000000 7
  540.020900 14731.567383 3
  540.035126 59645.437500 12
  540.054094 5143967.000000 999
  540.075435 59195.644531 11
  540.082549 9633.025391 2
  540.092035 33499.890625 7
  540.106263 10294.451172 2
  540.113378 17434.626953 3
  540.122864 6001.139648 1
  540.127607 4318.738770 1
  540.137094 5893.618164 1
  540.146581 3475.078369 1
  540.151324 2790.190918 1
  540.160811 5433.399902 1
  540.170299 4020.732178 1
  540.179787 2645.794922 1
  540.189275 5522.408203 1
  540.198763 2916.860596 1
  540.217740 2767.782715 1
  540.272305 13482.063477 3
  540.554753 13378.791016 3
  540.709124 4960.246582 1
  541.015688 6151.120117 1
  541.025198 2713.995850 1
  541.037086 11310.545898 2
  541.044219 4925.048828 1
  541.056107 892212.937500 173
  541.072752 6087.667969 1
  541.077508 9246.542969 2
  541.094153 5711.132324 1
  542.058527 135421.734375 26
  543.061345 13214.338867 3
  547.955018 3559.626953 1
  548.158638 5884.647461 1
  549.134674 3328.196045 1
  558.064941 5575.552246 1
  562.036325 13768.448242 3
  564.012626 3203.879395 1
  573.631517 3036.066162 1
  575.085258 6284.742676 1
  576.021793 5884.968262 1
  583.131278 2973.562500 1
  586.060753 3200.750000 1
  592.964460 5315.527344 1
  593.975110 5213.900879 1
  599.155983 2766.520996 1
  601.078015 12802.558594 2
  601.579481 6698.492188 1
  601.981106 3261.526123 1
  634.153623 3765.987061 1
  634.651741 3234.580078 1
  661.806305 4914.756348 1
  662.015434 4234.253418 1
  662.025088 5048.465820 1
  662.034743 2779.887207 1
  662.047616 12089.750977 2
  662.057271 6103.536621 1
  662.076582 21526.898438 4
  662.102332 2108850.000000 410
  662.121645 14099.661133 3
  662.131301 22563.525391 4
  662.140958 3266.236572 1
  662.153835 12497.186523 2
  662.173150 4126.933105 1
  662.182808 6724.574219 1
  662.195686 2681.905518 1
  662.398557 4645.862793 1
  662.604744 54448.746094 11
  663.049663 2780.667725 1
  663.078695 3861.744873 1
  663.104503 465852.281250 90
  663.123860 3239.619629 1
  663.133539 4736.104492 1
  663.608057 3812.511963 1
  664.105718 47403.703125 9
  665.109202 6370.243652 1
  672.168079 4201.175781 1
  672.668810 3050.548584 1
  682.232765 52592.750000 10
  683.237139 16434.708984 3
  684.084827 3121.011475 1
  695.177132 6899.196289 1
  695.679530 3482.749756 1
  716.020740 3351.143311 1
  728.251014 4703.838867 1
  730.088698 7561.093262 1
  737.127397 3411.135254 1
  760.637697 5936.531250 1
  761.141299 2803.744629 1
  764.229317 3711.072510 1
  772.169898 10244.375000 2
  774.253745 43088.222656 8
  775.260088 12822.421875 2
  776.260223 3661.848389 1
  783.647133 95753.960938 19
  784.111533 2616.607666 1
  784.148869 58367.765625 11
  784.646936 14986.125977 3
  785.149633 6900.946777 1
  793.710785 6207.853516 1
  794.217991 3984.692139 1
  816.716716 5425.470703 1
  817.219653 4978.363281 1
  859.172409 41953.949219 8
  860.177222 11263.370117 2
  861.174248 4029.064697 1
  905.067881 2673.142090 1
  905.098747 6420.336426 1
  905.114181 2755.127441 1
  905.129615 4275.355957 1
  905.150195 9137.347656 2
  905.160485 9022.745117 2
  905.186211 1171081.250000 227
  905.222229 8056.394043 2
  905.237666 10693.065430 2
  905.268541 6019.123047 1
  905.283979 3580.971436 1
  905.314856 2765.864990 1
  905.695807 15837.662109 3
  906.190373 296026.062500 57
  906.221297 3023.808350 1
  906.236759 3281.875000 1
  906.695660 3868.566162 1
  907.196207 49429.292969 10
  908.193375 6945.942871 1
  915.758849 3717.330566 1
  925.314805 6078.879883 1
  938.265177 4158.667480 1
  938.759491 4383.728516 1
  993.652524 9583.664063 2
  993.664359 9603.107422 2
  994.155719 8054.432129 2
  994.653371 3940.568604 1
  994.665224 3934.917725 1
  1026.737517 14867.166016 3
  1027.234954 13778.194336 3
  1027.726528 4729.242676 1
  1027.738977 4555.283203 1
  1028.224684 2760.215576 1
  1036.799511 3335.093506 1
  1059.793004 4089.783936 1
  1102.249061 8407.961914 2
  1115.194111 4002.349854 1
  1116.200943 2672.268555 1
  1125.759297 3038.169434 1
  1148.270826 181168.671875 35
  1148.770882 8500.494141 2
  1149.271265 72109.195313 14
  1149.315432 2969.859619 1
  1150.273011 16748.273438 3
  1151.276068 4775.874023 1
  1158.833538 2662.530762 1
  1181.336266 2615.303467 1
  1181.850402 2804.030273 1
  1203.167229 4875.343750 1
  1236.724975 2598.638428 1
  1236.757844 3213.950439 1
  1237.242806 6101.862793 1
  1265.976780 3505.570557 1
  1269.806528 4441.674805 1
  1270.302506 4656.491211 1
  1270.328168 4247.566406 1
  1270.824452 4251.097168 1
  1271.329592 2812.821777 1
  1325.199396 9970.788086 2
  1325.226739 10686.676758 2
  1326.229912 6042.479004 1
  1345.350181 3399.942871 1
  1347.198031 3453.686523 1
  1358.299291 2939.655762 1
  1365.992715 3467.626221 1
  1391.369576 24446.818359 5
  1391.859975 3766.117920 1
  1392.350634 13171.483398 3
  1392.370265 13299.817383 3
  1393.352382 4982.786621 1
  1393.381862 3985.280518 1
//

Imprint Feedback
system version 2.2.7

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Hannes Bohring

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo