MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303541

Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303541
RECORD_TITLE: Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Bergenin
CH$COMPOUND_CLASS: Gallic acid and derivatives
CH$FORMULA: C14H16O9
CH$EXACT_MASS: 328.273
CH$SMILES: COC1=C(O)C=C2C(=O)O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]3C2=C1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C14H16O9/c1-21-11-5(16)2-4-7(9(11)18)12-13(23-14(4)20)10(19)8(17)6(3-15)22-12/h2,6,8,10,12-13,15-19H,3H2,1H3/t6-,8-,10+,12+,13-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY YWJXCIXBAKGUKZ-HJJNZUOJSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 2.8591
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 329.0867085

PK$SPLASH: splash10-0r29-0591000000-9b0e7f2d29df65a66c3a
PK$NUM_PEAK: 200
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  77.04142 94.0 94
  80.02388 30.0 30
  85.02934 25.0 25
  86.0316 35.0 35
  91.0497 35.0 35
  93.02248 27.0 27
  103.04 50.0 50
  110.04101 21.0 21
  111.04566 60.0 60
  119.04875 90.0 90
  119.06932 29.0 29
  123.05193 21.0 21
  127.04023 27.0 27
  130.04218 26.0 26
  131.04808 103.0 103
  133.02048 49.0 49
  133.03447 37.0 37
  133.06058 54.0 54
  134.03731 30.0 30
  134.0703 24.0 24
  137.06287 21.0 21
  138.02588 64.0 64
  138.03288 67.0 67
  144.03003 35.0 35
  146.02827 25.0 25
  146.03735 22.0 22
  147.04373 118.0 118
  148.01558 40.0 40
  150.02368 31.0 31
  151.03806 204.0 204
  152.01334 76.0 76
  152.04251 26.0 26
  153.0464 31.0 31
  153.05409 24.0 24
  156.05104 24.0 24
  159.04245 89.0 89
  161.05992 24.0 24
  162.01711 29.0 29
  162.02887 74.0 74
  162.03676 22.0 22
  163.03586 47.0 47
  164.04076 30.0 30
  164.0473 26.0 26
  165.021 26.0 26
  165.04785 22.0 22
  165.97404 21.0 21
  166.02701 102.0 102
  166.06868 29.0 29
  167.04062 29.0 29
  170.81195 24.0 24
  174.03847 37.0 37
  175.02676 29.0 29
  175.03589 22.0 22
  175.04694 75.0 75
  176.00969 21.0 21
  176.05037 21.0 21
  177.021 239.0 239
  177.04778 26.0 26
  177.06427 37.0 37
  177.9834 25.0 25
  178.0285 132.0 132
  178.0553 22.0 22
  179.01422 40.0 40
  179.03362 77.0 77
  179.07249 22.0 22
  179.99854 24.0 24
  180.00923 102.0 102
  180.04033 85.0 85
  181.03506 30.0 30
  181.054 415.0 415
  182.02008 22.0 22
  187.03651 70.0 70
  187.54884 24.0 24
  189.05589 31.0 31
  190.02805 67.0 67
  190.05782 22.0 22
  191.01422 56.0 56
  191.03458 158.0 158
  191.07266 32.0 32
  192.0285 21.0 21
  192.0374 61.0 61
  192.04257 27.0 27
  193.05263 291.0 291
  194.01396 31.0 31
  194.02419 81.0 81
  194.06129 27.0 27
  195.02249 137.0 137
  195.03328 166.0 166
  195.07465 21.0 21
  197.03069 22.0 22
  197.04373 198.0 198
  197.05219 123.0 123
  199.05011 59.0 59
  200.02147 26.0 26
  201.03554 21.0 21
  201.78851 22.0 22
  203.03865 44.0 44
  204.03841 96.0 96
  205.04547 276.0 276
  206.01321 24.0 24
  206.02417 113.0 113
  206.06885 29.0 29
  207.02249 59.0 59
  207.05431 25.0 25
  207.082 25.0 25
  208.03058 37.0 37
  208.03867 128.0 128
  208.04749 25.0 25
  208.06731 22.0 22
  209.02492 36.0 36
  209.04504 1000.0 999
  209.31223 30.0 30
  210.04617 84.0 84
  210.05687 39.0 39
  210.1541 21.0 21
  211.01839 21.0 21
  211.0303 24.0 24
  211.44679 21.0 21
  215.03102 46.0 46
  215.04202 67.0 67
  216.04544 44.0 44
  216.05391 21.0 21
  217.02675 56.0 56
  217.04236 22.0 22
  218.0257 25.0 25
  218.06856 22.0 22
  219.01776 21.0 21
  219.03661 22.0 22
  219.0537 65.0 65
  219.06093 96.0 96
  219.06956 107.0 107
  220.03343 22.0 22
  220.04239 26.0 26
  220.06358 40.0 40
  221.04727 459.0 459
  221.89777 21.0 21
  222.04242 25.0 25
  222.05162 35.0 35
  223.02396 85.0 85
  223.03439 52.0 52
  223.0567 52.0 52
  224.03252 30.0 30
  225.04625 27.0 27
  227.02992 21.0 21
  227.04019 66.0 66
  229.0251 35.0 35
  229.04454 25.0 25
  229.05272 30.0 30
  229.06332 50.0 50
  230.02765 25.0 25
  231.0739 36.0 36
  232.015 54.0 54
  232.02766 21.0 21
  233.00249 45.0 45
  233.04597 253.0 253
  233.0582 76.0 76
  235.05777 111.0 111
  236.05328 24.0 24
  236.06328 36.0 36
  237.03236 41.0 41
  242.02321 30.0 30
  245.03105 24.0 24
  246.05576 25.0 25
  247.05745 444.0 444
  248.05809 29.0 29
  249.02847 32.0 32
  251.01729 25.0 25
  251.05081 605.0 604
  251.06062 343.0 343
  252.06075 27.0 27
  253.0589 41.0 41
  257.04102 122.0 122
  257.05829 49.0 49
  258.04489 35.0 35
  260.0256 52.0 52
  260.03699 24.0 24
  263.00201 21.0 21
  263.05411 743.0 742
  263.06839 138.0 138
  263.91876 30.0 30
  264.05249 95.0 95
  264.07834 21.0 21
  272.8786 37.0 37
  274.9827 35.0 35
  275.04938 305.0 305
  275.06253 208.0 208
  276.05234 61.0 61
  276.06714 111.0 111
  276.99521 24.0 24
  281.06134 148.0 148
  282.06262 56.0 56
  293.05771 223.0 223
  293.06982 362.0 362
  294.07144 84.0 84
  311.06781 183.0 183
  311.08182 125.0 125
  312.08432 21.0 21
  329.0563 61.0 61
  329.08127 509.0 508
  329.09692 135.0 135
//

Imprint Feedback
system version 2.2.7

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Hannes Bohring

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo