MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303549

Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303549
RECORD_TITLE: Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Bergenin
CH$COMPOUND_CLASS: Gallic acid and derivatives
CH$FORMULA: C14H16O9
CH$EXACT_MASS: 328.273
CH$SMILES: COC1=C(O)C=C2C(=O)O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]3C2=C1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C14H16O9/c1-21-11-5(16)2-4-7(9(11)18)12-13(23-14(4)20)10(19)8(17)6(3-15)22-12/h2,6,8,10,12-13,15-19H,3H2,1H3/t6-,8-,10+,12+,13-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY YWJXCIXBAKGUKZ-HJJNZUOJSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 2.8591
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 329.0867085

PK$SPLASH: splash10-01u3-0791000000-dafce6e14ef4fa3f6f5f
PK$NUM_PEAK: 168
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  57.03561 43.0 43
  73.02716 32.0 32
  79.05588 29.0 29
  91.04977 33.0 33
  94.03964 41.0 41
  103.03098 48.0 48
  103.03554 27.0 27
  103.04432 43.0 43
  103.0582 40.0 40
  119.04961 32.0 32
  120.99448 43.0 43
  127.05064 33.0 33
  131.04662 105.0 105
  131.05629 37.0 37
  132.02191 59.0 59
  133.0264 88.0 88
  135.04041 30.0 30
  136.01744 32.0 32
  136.05003 29.0 29
  136.26318 53.0 53
  137.02554 97.0 97
  138.02521 91.0 91
  139.04102 32.0 32
  144.05832 38.0 38
  147.0443 244.0 244
  150.02908 83.0 83
  150.03638 43.0 43
  151.03499 37.0 37
  151.0423 65.0 65
  152.87393 30.0 30
  153.04578 27.0 27
  156.06094 49.0 49
  158.03258 29.0 29
  158.04001 32.0 32
  159.04111 35.0 35
  159.05057 201.0 201
  160.04779 30.0 30
  160.05484 43.0 43
  161.06044 62.0 62
  162.01906 40.0 40
  162.0331 94.0 94
  166.03136 32.0 32
  166.05672 29.0 29
  167.07616 33.0 33
  170.47711 27.0 27
  171.03851 48.0 48
  173.01933 32.0 32
  173.05621 43.0 43
  173.23457 61.0 61
  175.03683 40.0 40
  176.0405 68.0 68
  176.04884 121.0 121
  176.05507 40.0 40
  177.00372 180.0 180
  177.01842 115.0 115
  177.06032 81.0 81
  178.01553 38.0 38
  178.02545 102.0 102
  178.03456 33.0 33
  178.04814 33.0 33
  179.03426 54.0 54
  179.04268 107.0 107
  180.00458 140.0 140
  180.0361 27.0 27
  181.04562 266.0 266
  181.05167 594.0 593
  182.02124 27.0 27
  182.04614 32.0 32
  182.06059 67.0 67
  184.18935 27.0 27
  187.04004 110.0 110
  187.70279 35.0 35
  188.04008 45.0 45
  188.04713 30.0 30
  189.01534 38.0 38
  189.04782 143.0 143
  189.05713 46.0 46
  190.02872 38.0 38
  191.03093 154.0 154
  191.03926 182.0 182
  191.06308 41.0 41
  192.03711 61.0 61
  192.04613 91.0 91
  192.05942 38.0 38
  193.01347 29.0 29
  193.02905 43.0 43
  193.04268 156.0 156
  193.05249 84.0 84
  194.02032 32.0 32
  195.02666 303.0 303
  197.04176 457.0 457
  198.03737 27.0 27
  199.0293 45.0 45
  199.04059 72.0 72
  199.05286 29.0 29
  202.06519 29.0 29
  203.04477 45.0 45
  204.03265 73.0 73
  204.04036 145.0 145
  204.04881 33.0 33
  205.019 38.0 38
  205.04385 244.0 244
  205.06291 56.0 56
  206.00606 33.0 33
  206.0204 172.0 172
  206.04376 48.0 48
  207.02675 100.0 100
  207.05598 27.0 27
  207.06987 29.0 29
  208.039 260.0 260
  209.03568 118.0 118
  209.04443 473.0 473
  210.0376 33.0 33
  210.04536 59.0 59
  210.05426 54.0 54
  211.03558 32.0 32
  215.00818 33.0 33
  215.02827 33.0 33
  216.03558 94.0 94
  219.00729 38.0 38
  219.02672 80.0 80
  219.0619 189.0 189
  220.06464 68.0 68
  221.04678 406.0 406
  222.04913 27.0 27
  223.01753 48.0 48
  223.02855 89.0 89
  223.05658 27.0 27
  223.06593 27.0 27
  225.02907 30.0 30
  228.05391 61.0 61
  229.05901 27.0 27
  232.02951 27.0 27
  232.03876 45.0 45
  233.04752 460.0 460
  234.04601 102.0 102
  235.03357 54.0 54
  235.05696 62.0 62
  239.85915 27.0 27
  245.04514 132.0 132
  247.05589 247.0 247
  247.06825 57.0 57
  248.16933 27.0 27
  249.03993 134.0 134
  251.04993 562.0 561
  251.06384 264.0 264
  252.06032 29.0 29
  253.06085 83.0 83
  257.02829 27.0 27
  257.0419 32.0 32
  263.05502 1000.0 999
  264.05698 134.0 134
  264.95645 29.0 29
  265.0621 33.0 33
  275.05389 554.0 553
  276.05447 33.0 33
  276.06396 48.0 48
  281.06366 132.0 132
  282.07214 65.0 65
  282.48312 27.0 27
  293.05136 72.0 72
  293.06812 626.0 625
  293.24728 32.0 32
  294.06885 68.0 68
  311.07214 396.0 396
  312.08282 33.0 33
  329.06937 111.0 111
  329.08487 654.0 653
//

Imprint Feedback
system version 2.2.7

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Hannes Bohring

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo