MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303551

Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303551
RECORD_TITLE: Bergenin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Bergenin
CH$COMPOUND_CLASS: Gallic acid and derivatives
CH$FORMULA: C14H16O9
CH$EXACT_MASS: 328.273
CH$SMILES: COC1=C(O)C=C2C(=O)O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]3C2=C1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C14H16O9/c1-21-11-5(16)2-4-7(9(11)18)12-13(23-14(4)20)10(19)8(17)6(3-15)22-12/h2,6,8,10,12-13,15-19H,3H2,1H3/t6-,8-,10+,12+,13-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY YWJXCIXBAKGUKZ-HJJNZUOJSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 2.8591
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 329.0867085

PK$SPLASH: splash10-057i-0930000000-6f9b3f20b1fc6fdcec59
PK$NUM_PEAK: 189
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  55.01993 24.0 24
  68.99663 27.0 27
  77.04178 21.0 21
  78.03691 20.0 20
  85.02872 50.0 50
  91.05387 44.0 44
  93.03757 29.0 29
  103.04037 38.0 38
  103.05166 23.0 23
  105.03423 44.0 44
  107.049 27.0 27
  108.04941 30.0 30
  115.05594 25.0 25
  117.03388 21.0 21
  117.04003 21.0 21
  118.07645 30.0 30
  119.04917 24.0 24
  121.0304 46.0 46
  121.0704 20.0 20
  125.05634 48.0 48
  127.05316 56.0 56
  131.04182 51.0 51
  131.05005 66.0 66
  133.02144 24.0 24
  133.03166 124.0 124
  134.02835 21.0 21
  134.03871 68.0 68
  135.0435 24.0 24
  137.02449 24.0 24
  138.02837 106.0 106
  138.03764 35.0 35
  140.0444 24.0 24
  145.0699 26.0 26
  147.04471 170.0 170
  148.00502 25.0 25
  149.01797 52.0 52
  150.03387 225.0 225
  151.02692 24.0 24
  151.03885 250.0 250
  152.01045 24.0 24
  152.03697 43.0 43
  153.03835 25.0 25
  153.05121 104.0 104
  154.01581 21.0 21
  156.74965 31.0 31
  157.0298 74.0 74
  158.03264 25.0 25
  159.04181 431.0 431
  160.04417 62.0 62
  161.0289 50.0 50
  161.06274 61.0 61
  162.0235 50.0 50
  162.03275 49.0 49
  162.06696 21.0 21
  163.03035 51.0 51
  163.04126 26.0 26
  163.05133 33.0 33
  165.01692 36.0 36
  165.0555 111.0 111
  166.01727 33.0 33
  166.02701 98.0 98
  167.06834 37.0 37
  168.07423 27.0 27
  169.23543 21.0 21
  171.5681 20.0 20
  172.01741 24.0 24
  172.0589 25.0 25
  173.05368 33.0 33
  174.02766 24.0 24
  174.03938 21.0 21
  175.03613 164.0 164
  176.03384 20.0 20
  176.04587 205.0 205
  177.01897 520.0 519
  177.0573 256.0 256
  177.07124 24.0 24
  177.7692 27.0 27
  178.02608 293.0 293
  178.05707 129.0 129
  178.82962 24.0 24
  179.03232 398.0 398
  179.05453 21.0 21
  180.0042 117.0 117
  180.01009 57.0 57
  180.03615 32.0 32
  181.05054 1000.0 999
  181.06654 46.0 46
  181.86044 20.0 20
  182.0471 116.0 116
  182.06094 30.0 30
  186.00859 21.0 21
  187.03091 86.0 86
  187.04201 173.0 173
  188.04099 81.0 81
  188.05219 39.0 39
  189.04953 43.0 43
  190.01895 55.0 55
  191.03256 311.0 311
  191.04256 116.0 116
  191.07211 72.0 72
  192.03568 50.0 50
  192.04674 20.0 20
  193.00728 87.0 87
  193.01874 30.0 30
  193.0486 389.0 389
  193.05583 106.0 106
  194.01318 21.0 21
  194.02237 46.0 46
  194.03143 24.0 24
  195.02945 544.0 543
  195.06741 24.0 24
  196.00272 24.0 24
  196.5262 24.0 24
  197.03401 45.0 45
  197.04724 139.0 139
  199.04018 105.0 105
  199.05424 29.0 29
  200.04254 52.0 52
  201.05434 45.0 45
  202.02838 72.0 72
  202.07698 20.0 20
  203.03194 82.0 82
  203.04254 50.0 50
  204.03418 85.0 85
  204.04485 58.0 58
  204.05106 20.0 20
  204.84068 30.0 30
  205.02831 25.0 25
  205.0374 93.0 93
  205.04756 319.0 319
  205.06024 129.0 129
  205.28362 24.0 24
  206.02303 229.0 229
  206.04636 20.0 20
  206.05701 89.0 89
  206.99904 24.0 24
  207.0213 24.0 24
  207.04846 39.0 39
  207.07294 29.0 29
  208.0307 24.0 24
  209.04601 75.0 75
  211.02176 51.0 51
  214.03908 26.0 26
  214.55058 36.0 36
  215.04251 26.0 26
  215.93228 54.0 54
  216.04114 26.0 26
  217.04277 20.0 20
  218.01768 30.0 30
  218.0296 25.0 25
  219.022 26.0 26
  219.03543 58.0 58
  219.06366 130.0 130
  220.03984 75.0 75
  221.02496 77.0 77
  221.04115 132.0 132
  221.04988 178.0 178
  222.05463 26.0 26
  223.00618 25.0 25
  223.03775 24.0 24
  223.05112 67.0 67
  227.0338 52.0 52
  229.05293 163.0 163
  230.01941 20.0 20
  230.05975 20.0 20
  231.01967 20.0 20
  231.02908 44.0 44
  232.03711 91.0 91
  232.04811 32.0 32
  233.04524 163.0 163
  235.05791 21.0 21
  235.0744 20.0 20
  236.03464 32.0 32
  237.03645 20.0 20
  238.04562 58.0 58
  243.04321 21.0 21
  245.04527 123.0 123
  245.05159 49.0 49
  246.04503 86.0 86
  247.04764 27.0 27
  247.0554 29.0 29
  249.0591 20.0 20
  250.05388 21.0 21
  252.05194 26.0 26
  257.04532 29.0 29
  263.05417 49.0 49
  263.06689 21.0 21
  264.07092 24.0 24
  275.06125 24.0 24
//

Imprint Feedback
system version 2.2.7

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Hannes Bohring

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo