MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR306007

Procyanidin B1; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR306007
RECORD_TITLE: Procyanidin B1; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Procyanidin B1
CH$NAME: cis,trans''-4,8''-Bi-(3,3',4',5,7-pentahydroxyflavane)
CH$NAME: (-)-Epicatechin-(4-beta-8)-(+)-catechin
CH$COMPOUND_CLASS: Biflavonoids and polyflavonoids
CH$FORMULA: C30H26O12
CH$EXACT_MASS: 578.14243
CH$SMILES: C1[C@@H]([C@H](OC2=C1C(=CC(=C2[C@@H]3[C@H]([C@H](OC4=CC(=CC(=C34)O)O)C5=CC(=C(C=C5)O)O)O)O)O)C6=CC(=C(C=C6)O)O)O
CH$IUPAC: InChI=1S/C30H26O12/c31-13-7-20(37)24-23(8-13)41-29(12-2-4-16(33)19(36)6-12)27(40)26(24)25-21(38)10-17(34)14-9-22(39)28(42-30(14)25)11-1-3-15(32)18(35)5-11/h1-8,10,22,26-29,31-40H,9H2/t22-,26+,27+,28+,29+/m0/s1
CH$LINK: CAS 20315-25-7
CH$LINK: CHEMSPIDER 9425166
CH$LINK: INCHIKEY XFZJEEAOWLFHDH-UKWJTHFESA-N
CH$LINK: KNAPSACK C00009075
CH$LINK: PUBCHEM CID:11250133

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE -2.75 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 2.8429
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M-H]-
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 577.13514984783

PK$SPLASH: splash10-0570-0691620000-4c9d009a1be628464fdd
PK$NUM_PEAK: 132
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  53.51035 23.0 23
  57.0327 59.0 59
  109.02698 14.0 14
  125.02386 473.0 473
  125.03103 94.0 94
  126.02048 17.0 17
  126.02857 37.0 37
  127.02892 14.0 14
  137.02219 102.0 102
  138.02168 20.0 20
  138.03128 27.0 27
  145.03032 18.0 18
  145.05496 14.0 14
  149.01408 21.0 21
  151.03633 35.0 35
  151.04355 23.0 23
  155.10585 18.0 18
  160.05022 27.0 27
  161.02538 239.0 239
  162.02676 90.0 90
  162.06081 23.0 23
  163.03535 62.0 62
  163.04182 21.0 21
  167.02826 17.0 17
  167.036 27.0 27
  175.03441 16.0 16
  175.04117 35.0 35
  175.06956 16.0 16
  177.01027 19.0 19
  177.02098 16.0 16
  177.05125 21.0 21
  177.07091 14.0 14
  179.03108 67.0 67
  179.04088 20.0 20
  184.35146 19.0 19
  188.04793 63.0 63
  200.05151 17.0 17
  202.03236 20.0 20
  203.06212 37.0 37
  203.07114 63.0 63
  204.07654 16.0 16
  205.00839 34.0 34
  205.05106 20.0 20
  208.03755 16.0 16
  213.05452 19.0 19
  215.04454 18.0 18
  221.08475 15.0 15
  227.02931 18.0 18
  229.05052 36.0 36
  231.02478 34.0 34
  231.03651 19.0 19
  231.07114 34.0 34
  237.05759 16.0 16
  238.0733 16.0 16
  243.02994 20.0 20
  243.06821 28.0 28
  245.03432 25.0 25
  245.04858 57.0 57
  245.06761 51.0 51
  245.0843 15.0 15
  245.09334 18.0 18
  247.05103 17.0 17
  247.07632 19.0 19
  251.10545 14.0 14
  253.04701 28.0 28
  255.02415 20.0 20
  255.03432 19.0 19
  256.0383 20.0 20
  257.02692 19.0 19
  257.04663 16.0 16
  269.04868 18.0 18
  271.0578 16.0 16
  273.03339 23.0 23
  274.0524 20.0 20
  280.31592 23.0 23
  281.04456 16.0 16
  283.02258 16.0 16
  283.04318 16.0 16
  283.06738 16.0 16
  284.02805 16.0 16
  285.0332 16.0 16
  285.05444 16.0 16
  287.05667 168.0 168
  288.05762 61.0 61
  289.06976 1000.0 999
  290.06137 26.0 26
  290.0813 40.0 40
  291.08127 14.0 14
  293.03531 16.0 16
  297.03372 36.0 36
  297.07419 16.0 16
  299.05298 110.0 110
  300.0585 22.0 22
  311.04633 20.0 20
  327.04788 27.0 27
  327.07022 17.0 17
  328.06665 16.0 16
  331.06079 15.0 15
  339.08536 67.0 67
  340.08105 26.0 26
  369.10297 17.0 17
  379.10492 27.0 27
  381.10345 26.0 26
  394.09372 23.0 23
  407.07684 714.0 713
  408.0798 183.0 183
  408.09412 53.0 53
  409.0777 84.0 84
  411.97992 16.0 16
  412.10239 14.0 14
  425.08459 453.0 453
  425.10934 35.0 35
  426.08606 77.0 77
  426.11176 16.0 16
  432.08026 19.0 19
  437.07822 15.0 15
  447.06989 16.0 16
  449.08975 16.0 16
  451.09705 171.0 171
  452.11856 20.0 20
  453.11475 18.0 18
  468.09637 18.0 18
  489.15891 27.0 27
  508.77435 14.0 14
  513.11688 14.0 14
  533.18097 14.0 14
  559.11987 20.0 20
  559.13965 16.0 16
  575.11816 31.0 31
  576.1311 31.0 31
  577.13147 594.0 593
  577.20007 23.0 23
//

Imprint Feedback
system version 2.2
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo