MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR306031

Procyanidin B1; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR306031
RECORD_TITLE: Procyanidin B1; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Procyanidin B1
CH$NAME: cis,trans''-4,8''-Bi-(3,3',4',5,7-pentahydroxyflavane)
CH$NAME: (-)-Epicatechin-(4-beta-8)-(+)-catechin
CH$COMPOUND_CLASS: Biflavonoids and polyflavonoids
CH$FORMULA: C30H26O12
CH$EXACT_MASS: 578.14243
CH$SMILES: C1[C@@H]([C@H](OC2=C1C(=CC(=C2[C@@H]3[C@H]([C@H](OC4=CC(=CC(=C34)O)O)C5=CC(=C(C=C5)O)O)O)O)O)C6=CC(=C(C=C6)O)O)O
CH$IUPAC: InChI=1S/C30H26O12/c31-13-7-20(37)24-23(8-13)41-29(12-2-4-16(33)19(36)6-12)27(40)26(24)25-21(38)10-17(34)14-9-22(39)28(42-30(14)25)11-1-3-15(32)18(35)5-11/h1-8,10,22,26-29,31-40H,9H2/t22-,26+,27+,28+,29+/m0/s1
CH$LINK: CAS 20315-25-7
CH$LINK: CHEMSPIDER 9425166
CH$LINK: INCHIKEY XFZJEEAOWLFHDH-UKWJTHFESA-N
CH$LINK: KNAPSACK C00009075
CH$LINK: PUBCHEM CID:11250133

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE -2.75 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 2.8429
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M-H]-
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 577.13514984783

PK$SPLASH: splash10-0570-0491720000-2a3c70cdb93bf6c2ddda
PK$NUM_PEAK: 136
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  57.03297 15.0 15
  97.02778 14.0 14
  106.76736 14.0 14
  109.02824 35.0 35
  123.04255 21.0 21
  125.02336 430.0 430
  135.04686 19.0 19
  137.02126 106.0 106
  148.97736 15.0 15
  150.02905 17.0 17
  151.03951 58.0 58
  161.01642 17.0 17
  161.0269 125.0 125
  161.0544 19.0 19
  161.06337 18.0 18
  162.04109 15.0 15
  162.06319 19.0 19
  164.00626 15.0 15
  165.02245 14.0 14
  173.02356 26.0 26
  174.03754 14.0 14
  175.03717 42.0 42
  175.04471 44.0 44
  175.07997 24.0 24
  177.01363 23.0 23
  178.02507 39.0 39
  179.03165 35.0 35
  179.04265 42.0 42
  180.04628 27.0 27
  181.06047 20.0 20
  187.02518 15.0 15
  187.0464 44.0 44
  188.04057 15.0 15
  189.01843 16.0 16
  190.05884 20.0 20
  198.07108 21.0 21
  201.02014 21.0 21
  202.01544 14.0 14
  203.05264 41.0 41
  203.06987 79.0 79
  203.07983 44.0 44
  204.03491 22.0 22
  205.05222 121.0 121
  206.0141 22.0 22
  206.04076 15.0 15
  213.01695 16.0 16
  215.62561 14.0 14
  217.04228 17.0 17
  221.08157 20.0 20
  229.04819 35.0 35
  231.02611 17.0 17
  239.05594 15.0 15
  240.43234 15.0 15
  242.06303 15.0 15
  243.06335 17.0 17
  244.06702 15.0 15
  245.04279 132.0 132
  245.06334 22.0 22
  245.07829 91.0 91
  245.09059 37.0 37
  246.08916 74.0 74
  247.05295 68.0 68
  253.0583 40.0 40
  254.09753 16.0 16
  256.03049 44.0 44
  256.04199 33.0 33
  257.03232 21.0 21
  258.04709 15.0 15
  269.04556 92.0 92
  270.04517 29.0 29
  271.06537 14.0 14
  271.09238 14.0 14
  273.03217 77.0 77
  280.0358 17.0 17
  281.03806 59.0 59
  285.03561 14.0 14
  285.04831 14.0 14
  286.04541 32.0 32
  287.05179 14.0 14
  287.0629 16.0 16
  288.06418 14.0 14
  289.07278 971.0 970
  290.06854 49.0 49
  297.06897 15.0 15
  297.07922 44.0 44
  298.05682 17.0 17
  299.00351 21.0 21
  299.05054 134.0 134
  300.06104 48.0 48
  301.07104 17.0 17
  301.46283 17.0 17
  307.06525 17.0 17
  313.02872 15.0 15
  321.07416 19.0 19
  328.10245 14.0 14
  330.06406 20.0 20
  331.08435 43.0 43
  335.94025 16.0 16
  336.06683 14.0 14
  339.08524 70.0 70
  339.15771 14.0 14
  341.06537 15.0 15
  342.05676 20.0 20
  343.06558 20.0 20
  363.09851 22.0 22
  364.07742 19.0 19
  382.10864 17.0 17
  383.10306 14.0 14
  389.06058 14.0 14
  395.65268 26.0 26
  406.92264 14.0 14
  407.07501 1000.0 999
  408.08105 198.0 198
  409.08093 95.0 95
  410.07864 17.0 17
  423.07574 21.0 21
  424.05872 21.0 21
  425.08875 386.0 386
  425.92444 17.0 17
  426.08228 70.0 70
  426.108 20.0 20
  427.0976 32.0 32
  451.08466 45.0 45
  451.10367 137.0 137
  452.10217 62.0 62
  452.11453 78.0 78
  453.10782 22.0 22
  467.09317 14.0 14
  502.77963 17.0 17
  533.14709 15.0 15
  559.11554 29.0 29
  576.13049 71.0 71
  576.90619 18.0 18
  577.10315 16.0 16
  577.13263 590.0 589
  577.16693 54.0 54
//

Imprint Feedback
system version 2.2
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo