MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR307851

Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR307851
RECORD_TITLE: Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide C
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O11
CH$EXACT_MASS: 440.401
CH$SMILES: CC1C(=O)OC2C(O)C34C5OC(=O)C3(OC3OC(=O)C(O)C43C(C5O)C(C)(C)C)C12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O11/c1-5-12(24)28-11-8(22)18-10-6(21)7(16(2,3)4)17(18)9(23)13(25)30-15(17)31-20(18,14(26)29-10)19(5,11)27/h5-11,15,21-23,27H,1-4H3
CH$LINK: INCHIKEY AMOGMTLMADGEOQ-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE -2.75 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 4.331234
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M-H]-
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 439.12458514783

PK$SPLASH: splash10-004i-0940000000-98e051737773f383a02d
PK$NUM_PEAK: 157
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  69.03229 47.0 47
  72.99177 32.0 32
  97.02132 7.0 7
  97.03273 17.0 17
  100.98388 7.0 7
  101.02518 8.0 8
  109.02545 17.0 17
  109.06597 8.0 8
  110.03516 9.0 9
  113.02413 240.0 240
  114.02493 31.0 31
  115.02933 8.0 8
  115.04026 7.0 7
  118.03866 7.0 7
  125.02367 1000.0 999
  125.06599 7.0 7
  126.02682 49.0 49
  127.02454 8.0 8
  127.03819 23.0 23
  129.01709 17.0 17
  130.07301 9.0 9
  130.09973 9.0 9
  135.03807 7.0 7
  135.04701 7.0 7
  137.05995 7.0 7
  141.01694 61.0 61
  143.02242 6.0 6
  143.03308 50.0 50
  144.05275 7.0 7
  149.02356 8.0 8
  149.05876 9.0 9
  149.0952 15.0 15
  150.09821 8.0 8
  150.18434 10.0 10
  151.03352 9.0 9
  151.119 7.0 7
  153.12572 7.0 7
  156.06026 9.0 9
  159.03419 9.0 9
  161.02307 9.0 9
  162.03185 8.0 8
  163.03552 20.0 20
  163.10849 7.0 7
  164.04311 9.0 9
  164.05153 7.0 7
  165.04851 23.0 23
  165.05913 7.0 7
  165.09555 8.0 8
  176.03763 7.0 7
  176.12035 8.0 8
  177.054 7.0 7
  177.08142 7.0 7
  177.08818 6.0 6
  177.09802 27.0 27
  179.10202 7.0 7
  180.10968 8.0 8
  187.15982 9.0 9
  188.03783 9.0 9
  188.04929 17.0 17
  189.04797 8.0 8
  189.05605 8.0 8
  190.02411 8.0 8
  190.03159 27.0 27
  191.03284 8.0 8
  191.0423 17.0 17
  191.07184 9.0 9
  191.10829 46.0 46
  191.14183 8.0 8
  192.10713 8.0 8
  193.09105 8.0 8
  194.08841 7.0 7
  195.09413 22.0 22
  195.11176 39.0 39
  196.1011 8.0 8
  197.11951 8.0 8
  200.11589 12.0 12
  202.06425 52.0 52
  202.13644 8.0 8
  203.06708 13.0 13
  203.10564 8.0 8
  203.13568 19.0 19
  205.04944 7.0 7
  205.08681 9.0 9
  207.09816 18.0 18
  207.1069 7.0 7
  209.1147 18.0 18
  213.12573 15.0 15
  214.09889 12.0 12
  215.14124 31.0 31
  216.14156 7.0 7
  216.15863 7.0 7
  217.11896 7.0 7
  220.0739 7.0 7
  221.11693 15.0 15
  221.13118 8.0 8
  221.15268 9.0 9
  223.1049 9.0 9
  224.10939 9.0 9
  225.11356 17.0 17
  229.12697 8.0 8
  230.09583 33.0 33
  230.10716 7.0 7
  231.12965 22.0 22
  231.13805 69.0 69
  232.10631 9.0 9
  232.14691 8.0 8
  234.13316 8.0 8
  235.12677 7.0 7
  235.14206 15.0 15
  239.10806 8.0 8
  241.12344 23.0 23
  242.12823 8.0 8
  243.13799 8.0 8
  244.10704 8.0 8
  244.13657 15.0 15
  245.11865 23.0 23
  246.04848 8.0 8
  246.06253 8.0 8
  246.12808 10.0 10
  247.08833 16.0 16
  247.1299 31.0 31
  248.10655 29.0 29
  257.1088 7.0 7
  258.71768 7.0 7
  259.11777 14.0 14
  259.1373 124.0 124
  260.12546 17.0 17
  260.14859 14.0 14
  263.1474 9.0 9
  264.11246 8.0 8
  265.09891 8.0 8
  273.10403 8.0 8
  275.12732 28.0 28
  277.13443 14.0 14
  277.15613 15.0 15
  278.1344 7.0 7
  280.13129 8.0 8
  281.14868 15.0 15
  285.09607 8.0 8
  285.11676 21.0 21
  291.1279 9.0 9
  291.1369 8.0 8
  303.11487 15.0 15
  308.12805 9.0 9
  309.14612 8.0 8
  321.13803 28.0 28
  323.11575 8.0 8
  337.12698 9.0 9
  365.11465 9.0 9
  365.13229 34.0 34
  366.13242 8.0 8
  383.11984 15.0 15
  383.13544 35.0 35
  384.13391 7.0 7
  384.14819 13.0 13
  411.12128 10.0 10
  439.12613 7.0 7
//

Imprint Feedback
system version 2.2
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo