MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR300150

Gardneramine; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR300150
RECORD_TITLE: Gardneramine; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Gardneramine
CH$COMPOUND_CLASS: 3-alkylindoles
CH$FORMULA: C23H28N2O5
CH$EXACT_MASS: 412.486
CH$SMILES: COC\C=C1/CN2[C@H]3CC45C2C[C@H]1[C@@H]3COC4=NC1=C5C(OC)=C(OC)C=C1OC
CH$IUPAC: InChI=1S/C23H28N2O5/c1-26-6-5-12-10-25-15-9-23-18(25)7-13(12)14(15)11-30-22(23)24-20-16(27-2)8-17(28-3)21(29-4)19(20)23/h5,8,13-15,18H,6-7,9-11H2,1-4H3/b12-5+/t13-,14+,15+,18?,23?/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY RIMDDIPKIZTBHU-KPDHXFAYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 3.822467
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 413.2070985

PK$SPLASH: splash10-03di-0149300000-32ca36f8624d8a5625a9
PK$NUM_PEAK: 190
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  82.06453 7.0 7
  91.05495 7.0 7
  94.06415 6.0 6
  97.08809 6.0 6
  106.0677 17.0 17
  107.07362 12.0 12
  107.09126 5.0 5
  119.07311 29.0 29
  120.07922 28.0 28
  120.08508 7.0 7
  123.08068 8.0 8
  131.07669 5.0 5
  132.08046 31.0 31
  133.0862 16.0 16
  134.0936 16.0 16
  134.10069 11.0 11
  138.09523 14.0 14
  144.08258 6.0 6
  145.08606 7.0 7
  146.09671 38.0 38
  147.09846 6.0 6
  151.09009 7.0 7
  151.09917 9.0 9
  152.10638 25.0 25
  158.08954 12.0 12
  158.09665 7.0 7
  159.10262 5.0 5
  160.07472 6.0 6
  161.0777 9.0 9
  162.0578 5.0 5
  164.10844 22.0 22
  165.10663 7.0 7
  166.12451 11.0 11
  189.0739 5.0 5
  190.12109 5.0 5
  192.06924 6.0 6
  203.09241 6.0 6
  205.07268 12.0 12
  206.07707 17.0 17
  207.05066 6.0 6
  218.03639 12.0 12
  218.04778 24.0 24
  219.04265 5.0 5
  219.08397 8.0 8
  220.06522 8.0 8
  220.09952 33.0 33
  221.06898 7.0 7
  222.0878 9.0 9
  230.06824 12.0 12
  230.08986 6.0 6
  231.07973 15.0 15
  232.05582 19.0 19
  232.06999 14.0 14
  233.07089 188.0 188
  234.0728 34.0 34
  234.08261 24.0 24
  234.11542 7.0 7
  235.08099 25.0 25
  236.07782 9.0 9
  236.08937 6.0 6
  244.06114 17.0 17
  245.04919 10.0 10
  245.05931 12.0 12
  245.08946 28.0 28
  246.0665 20.0 20
  246.0784 5.0 5
  246.0921 5.0 5
  246.10402 13.0 13
  246.11571 9.0 9
  247.06114 7.0 7
  247.08632 11.0 11
  248.06766 6.0 6
  248.09241 131.0 131
  249.09482 30.0 30
  250.10976 8.0 8
  256.05438 6.0 6
  258.0759 8.0 8
  258.09027 6.0 6
  259.07748 15.0 15
  260.06854 24.0 24
  260.08063 70.0 70
  261.0831 24.0 24
  261.09674 13.0 13
  262.09558 14.0 14
  262.10745 12.0 12
  262.1199 5.0 5
  263.09363 7.0 7
  269.09964 5.0 5
  270.07895 7.0 7
  271.08057 6.0 6
  272.09497 19.0 19
  273.08481 44.0 44
  273.09912 8.0 8
  274.08862 14.0 14
  274.10187 12.0 12
  281.09561 6.0 6
  282.07245 7.0 7
  286.10291 6.0 6
  287.099 5.0 5
  289.10986 6.0 6
  293.09018 5.0 5
  295.0867 7.0 7
  297.08377 6.0 6
  297.10938 8.0 8
  306.11282 15.0 15
  306.1232 5.0 5
  307.07669 6.0 6
  308.09427 14.0 14
  308.12079 6.0 6
  309.09033 16.0 16
  310.09454 6.0 6
  311.09985 17.0 17
  311.11853 11.0 11
  312.12628 9.0 9
  319.09525 9.0 9
  321.10828 7.0 7
  322.10999 13.0 13
  323.10648 16.0 16
  323.13168 30.0 30
  323.15747 9.0 9
  324.13452 9.0 9
  324.15326 6.0 6
  325.11905 32.0 32
  325.15271 6.0 6
  326.12839 6.0 6
  333.11484 6.0 6
  333.12997 8.0 8
  334.10205 17.0 17
  335.10132 9.0 9
  335.11575 8.0 8
  336.10709 17.0 17
  337.11786 17.0 17
  337.13126 12.0 12
  337.14609 10.0 10
  338.12628 22.0 22
  338.17783 6.0 6
  339.12625 12.0 12
  339.14468 11.0 11
  339.16376 8.0 8
  340.12659 6.0 6
  349.13693 5.0 5
  349.1553 17.0 17
  350.11771 8.0 8
  351.1131 15.0 15
  351.1362 117.0 117
  352.13693 36.0 36
  352.15533 9.0 9
  353.14215 101.0 101
  353.16003 35.0 35
  354.15009 20.0 20
  354.16797 11.0 11
  355.15619 37.0 37
  355.17416 15.0 15
  356.17694 29.0 29
  357.12479 7.0 7
  357.1832 11.0 11
  359.1568 10.0 10
  365.12213 11.0 11
  365.14288 46.0 46
  365.1571 56.0 56
  366.11835 5.0 5
  366.15659 164.0 164
  367.10007 8.0 8
  367.16425 333.0 333
  368.13791 6.0 6
  368.16785 71.0 71
  368.19284 5.0 5
  369.14001 6.0 6
  369.15869 6.0 6
  369.17603 9.0 9
  369.19333 7.0 7
  370.16992 7.0 7
  370.18732 30.0 30
  371.18814 16.0 16
  381.17886 9.0 9
  382.19598 13.0 13
  383.09393 6.0 6
  383.15994 216.0 216
  384.16089 56.0 56
  384.17773 21.0 21
  385.15002 11.0 11
  385.17059 5.0 5
  397.17078 51.0 51
  397.18588 55.0 55
  398.18268 207.0 207
  399.17242 11.0 11
  399.18417 24.0 24
  399.19879 10.0 10
  413.14508 10.0 10
  413.20776 1000.0 999
//

Imprint Feedback
system version 2.2.5

Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium

Responsible: Hannes Bohring

Funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under the National Research Data Infrastructure – NFDI4Chem – Projektnummer 441958208.

de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo