MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR301308

9-Nitro-20(S)-camptothecin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR301308
RECORD_TITLE: 9-Nitro-20(S)-camptothecin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: 9-Nitro-20(S)-camptothecin
CH$COMPOUND_CLASS: Camptothecins
CH$FORMULA: C20H15N3O6
CH$EXACT_MASS: 393.355
CH$SMILES: CC[C@@]1(O)C(=O)OCC2=C1C=C1N(CC3=CC4=C(C=CC=C4N(=O)=O)N=C13)C2=O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H15N3O6/c1-2-20(26)13-7-16-17-10(8-22(16)18(24)12(13)9-29-19(20)25)6-11-14(21-17)4-3-5-15(11)23(27)28/h3-7,26H,2,8-9H2,1H3/t20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY VHXNKPBCCMUMSW-FQEVSTJZSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.86515
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 394.1033617

PK$SPLASH: splash10-0udl-0059000000-c18c620cad05f9d43fd3
PK$NUM_PEAK: 152
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  98.05428 6.0 6
  174.48177 6.0 6
  180.07249 7.0 7
  181.0482 6.0 6
  205.08511 7.0 7
  206.08255 6.0 6
  209.1076 6.0 6
  210.06541 6.0 6
  217.77315 6.0 6
  219.0676 6.0 6
  219.08914 11.0 11
  219.10033 5.0 5
  220.09384 6.0 6
  220.10582 15.0 15
  222.06705 6.0 6
  225.0901 5.0 5
  230.07825 9.0 9
  234.41652 7.0 7
  235.09006 47.0 47
  236.41759 6.0 6
  236.8976 6.0 6
  237.07997 8.0 8
  237.09946 5.0 5
  238.06158 7.0 7
  238.08031 33.0 33
  238.77231 5.0 5
  239.08443 7.0 7
  243.10854 7.0 7
  244.04019 7.0 7
  245.06184 6.0 6
  245.24318 6.0 6
  247.07684 14.0 14
  247.08627 57.0 57
  247.10631 15.0 15
  247.46382 6.0 6
  248.08696 12.0 12
  248.09727 28.0 28
  249.09019 7.0 7
  249.10374 14.0 14
  249.15573 9.0 9
  260.87866 5.0 5
  262.07712 7.0 7
  262.08893 12.0 12
  263.05536 10.0 10
  263.08566 28.0 28
  264.08084 10.0 10
  264.09183 9.0 9
  264.43799 5.0 5
  265.07999 20.0 20
  265.0874 8.0 8
  266.03601 5.0 5
  266.10519 6.0 6
  266.32037 5.0 5
  266.95502 8.0 8
  273.07773 6.0 6
  274.08307 6.0 6
  274.11655 12.0 12
  275.09137 6.0 6
  276.08218 15.0 15
  276.13541 8.0 8
  277.09387 8.0 8
  277.12427 11.0 11
  286.11139 9.0 9
  287.10339 13.0 13
  290.10849 7.0 7
  291.01508 12.0 12
  291.06549 363.0 363
  292.06802 131.0 131
  292.09317 30.0 30
  292.12009 86.0 86
  292.14108 17.0 17
  292.4202 6.0 6
  292.66092 6.0 6
  293.06659 110.0 110
  293.08133 290.0 290
  293.09259 72.0 72
  293.10986 5.0 5
  293.12503 14.0 14
  294.06805 32.0 32
  294.08386 58.0 58
  295.08661 16.0 16
  295.10297 6.0 6
  301.56818 6.0 6
  302.08835 11.0 11
  302.11038 5.0 5
  303.0997 9.0 9
  303.98508 8.0 8
  304.07867 14.0 14
  304.12207 1000.0 999
  305.10199 16.0 16
  305.12579 154.0 154
  305.14673 11.0 11
  305.79144 10.0 10
  306.12515 24.0 24
  306.13708 14.0 14
  307.07834 14.0 14
  308.08203 11.0 11
  308.35498 6.0 6
  310.07678 5.0 5
  312.60321 5.0 5
  313.60663 6.0 6
  318.08691 11.0 11
  319.03708 6.0 6
  319.06458 57.0 57
  319.07489 31.0 31
  320.03534 5.0 5
  320.0495 40.0 40
  320.06805 47.0 47
  320.10345 45.0 45
  320.12073 32.0 32
  321.065 8.0 8
  321.10599 15.0 15
  321.13016 18.0 18
  322.08163 17.0 17
  322.12781 6.0 6
  329.40115 6.0 6
  330.10437 7.0 7
  332.1203 6.0 6
  334.05505 6.0 6
  336.04468 6.0 6
  336.06119 20.0 20
  336.11407 6.0 6
  337.04617 10.0 10
  337.06342 11.0 11
  337.07333 15.0 15
  338.06952 26.0 26
  338.08731 16.0 16
  338.80356 5.0 5
  348.0993 62.0 62
  348.11197 122.0 122
  349.07196 5.0 5
  349.09396 10.0 10
  349.12167 19.0 19
  349.13113 7.0 7
  350.04172 7.0 7
  350.07712 9.0 9
  350.11084 369.0 369
  350.90186 6.0 6
  351.09329 14.0 14
  351.11868 88.0 88
  352.10297 6.0 6
  352.1326 13.0 13
  352.14932 7.0 7
  365.06158 141.0 141
  365.07401 91.0 91
  365.09848 8.0 8
  366.0426 12.0 12
  366.07523 49.0 49
  366.09689 6.0 6
  394.05457 11.0 11
  394.07623 21.0 21
  394.10135 228.0 228
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze