MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR303809

Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303809
RECORD_TITLE: Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide B
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O10
CH$EXACT_MASS: 424.402
CH$SMILES: C[C@@H]1C(=O)O[C@H]2[C@H](O)[C@@]34[C@H]5C[C@@H](C(C)(C)C)[C@@]33[C@@H](O)C(=O)O[C@H]3O[C@@]4(C(=O)O5)[C@@]12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O10/c1-6-12(23)28-11-9(21)18-8-5-7(16(2,3)4)17(18)10(22)13(24)29-15(17)30-20(18,14(25)27-8)19(6,11)26/h6-11,15,21-22,26H,5H2,1-4H3/t6-,7+,8-,9+,10+,11+,15+,17+,18+,19-,20-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY SQOJOAFXDQDRGF-MMQTXUMRSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.359533
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 425.1442234

PK$SPLASH: splash10-0a4i-0392000000-9581909bf83b9c3ea416
PK$NUM_PEAK: 325
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  57.07506 41.0 41
  69.03555 57.0 57
  71.08543 41.0 41
  95.06721 45.0 45
  97.02649 35.0 35
  97.07126 57.0 57
  97.10303 35.0 35
  103.06165 45.0 45
  105.06857 51.0 51
  107.0472 51.0 51
  109.06876 98.0 98
  113.0283 41.0 41
  115.05778 43.0 43
  115.07388 35.0 35
  122.02904 53.0 53
  123.04838 37.0 37
  129.07274 179.0 179
  134.0688 51.0 51
  135.0457 93.0 93
  135.08261 37.0 37
  136.07602 41.0 41
  137.0573 43.0 43
  143.08998 71.0 71
  145.06342 159.0 159
  145.10138 71.0 71
  145.14793 51.0 51
  146.06375 43.0 43
  147.03554 37.0 37
  147.07219 35.0 35
  147.08305 120.0 120
  148.04729 43.0 43
  148.07396 35.0 35
  148.15585 53.0 53
  149.05844 102.0 102
  149.13145 35.0 35
  151.07629 37.0 37
  151.1097 35.0 35
  153.07072 41.0 41
  155.03119 39.0 39
  156.08797 35.0 35
  157.07132 47.0 47
  157.10962 45.0 45
  158.03963 43.0 43
  161.02924 37.0 37
  161.04825 35.0 35
  161.06407 63.0 63
  161.08955 43.0 43
  161.0976 41.0 41
  164.04321 47.0 47
  169.10477 61.0 61
  170.09207 41.0 41
  171.0484 41.0 41
  171.06989 41.0 41
  171.08223 106.0 106
  173.01894 41.0 41
  173.05098 45.0 45
  173.06456 49.0 49
  173.07718 37.0 37
  173.08524 47.0 47
  173.09399 110.0 110
  173.10397 102.0 102
  175.07574 77.0 77
  176.10248 41.0 41
  177.0484 169.0 169
  177.05981 232.0 232
  178.0901 49.0 49
  179.04828 47.0 47
  179.09358 79.0 79
  179.10629 67.0 67
  181.09952 39.0 39
  181.30003 67.0 67
  183.07951 77.0 77
  184.12357 41.0 41
  185.06451 35.0 35
  185.09184 287.0 287
  185.10918 45.0 45
  185.13057 37.0 37
  186.10251 110.0 110
  187.04082 45.0 45
  187.07156 35.0 35
  187.10419 112.0 112
  189.0163 47.0 47
  189.05516 67.0 67
  189.0818 73.0 73
  189.09065 41.0 41
  189.09923 65.0 65
  190.05563 35.0 35
  190.06403 35.0 35
  191.07072 128.0 128
  191.1051 79.0 79
  193.08907 35.0 35
  195.08107 89.0 89
  195.12178 57.0 57
  196.0282 55.0 55
  197.06581 51.0 51
  197.13655 45.0 45
  198.05383 35.0 35
  199.02007 43.0 43
  199.0746 165.0 165
  201.06317 39.0 39
  201.09071 224.0 224
  202.03505 49.0 49
  202.06245 39.0 39
  202.09329 75.0 75
  202.11205 39.0 39
  203.04543 41.0 41
  203.06645 240.0 240
  203.07259 93.0 93
  203.10272 81.0 81
  204.11588 41.0 41
  205.01796 37.0 37
  205.04176 71.0 71
  205.05824 41.0 41
  207.03067 100.0 100
  207.04001 75.0 75
  207.1028 43.0 43
  207.1263 39.0 39
  209.1328 116.0 116
  209.13971 35.0 35
  211.04662 39.0 39
  211.06987 47.0 47
  212.04396 79.0 79
  212.0825 45.0 45
  213.08803 195.0 195
  213.0977 79.0 79
  213.1068 43.0 43
  213.11751 41.0 41
  213.12689 35.0 35
  214.10782 41.0 41
  214.13179 35.0 35
  215.0302 43.0 43
  215.06633 185.0 185
  215.07384 104.0 104
  215.0955 112.0 112
  216.87732 35.0 35
  217.03497 53.0 53
  217.05534 89.0 89
  217.08319 163.0 163
  217.11879 35.0 35
  218.05209 37.0 37
  219.05246 35.0 35
  219.0737 35.0 35
  219.1003 110.0 110
  220.06429 85.0 85
  220.08806 49.0 49
  221.04478 43.0 43
  221.09258 35.0 35
  223.10191 41.0 41
  223.10844 112.0 112
  224.08125 47.0 47
  224.0983 49.0 49
  225.09175 154.0 154
  225.12698 51.0 51
  225.14563 63.0 63
  226.08936 55.0 55
  227.06882 47.0 47
  227.10417 41.0 41
  227.14458 98.0 98
  227.98857 35.0 35
  228.06593 71.0 71
  229.02798 41.0 41
  229.04138 45.0 45
  229.05888 39.0 39
  229.08821 157.0 157
  229.10106 51.0 51
  229.12056 93.0 93
  230.05179 37.0 37
  230.09593 154.0 154
  230.10677 37.0 37
  231.03888 39.0 39
  231.06096 108.0 108
  231.10483 232.0 232
  232.10403 35.0 35
  233.0527 43.0 43
  233.08096 124.0 124
  233.10884 47.0 47
  235.06824 83.0 83
  235.08685 37.0 37
  237.02982 37.0 37
  237.13158 43.0 43
  239.05139 43.0 43
  240.06482 57.0 57
  240.07991 47.0 47
  241.07886 41.0 41
  241.08923 83.0 83
  241.10199 61.0 61
  241.11839 87.0 87
  241.12808 55.0 55
  242.11736 35.0 35
  243.06157 43.0 43
  243.10052 197.0 197
  243.13541 89.0 89
  244.11147 35.0 35
  244.13838 57.0 57
  245.00438 47.0 47
  245.10478 59.0 59
  245.11925 41.0 41
  247.06984 77.0 77
  247.1035 130.0 130
  249.07603 45.0 45
  250.10747 47.0 47
  251.10173 108.0 108
  251.1179 144.0 144
  252.11394 77.0 77
  253.11626 77.0 77
  253.43532 35.0 35
  255.03745 43.0 43
  255.06282 75.0 75
  255.11572 35.0 35
  255.12915 65.0 65
  255.13914 89.0 89
  256.04184 41.0 41
  256.10001 47.0 47
  256.24942 51.0 51
  257.04257 59.0 59
  257.07669 323.0 323
  257.11765 83.0 83
  259.05978 71.0 71
  259.0947 254.0 254
  259.12741 87.0 87
  260.13434 53.0 53
  260.90396 45.0 45
  261.11597 77.0 77
  261.15695 41.0 41
  262.09778 43.0 43
  263.10315 41.0 41
  265.09924 33.0 33
  265.10727 91.0 91
  267.0687 47.0 47
  267.09839 35.0 35
  268.83994 55.0 55
  269.08691 187.0 187
  269.11688 293.0 293
  269.21921 49.0 49
  271.09598 79.0 79
  271.12283 128.0 128
  271.13538 83.0 83
  272.06735 93.0 93
  272.14508 35.0 35
  273.01508 59.0 59
  273.03931 116.0 116
  273.05008 51.0 51
  273.07272 91.0 91
  273.12054 37.0 37
  274.09961 47.0 47
  275.05923 39.0 39
  275.09048 91.0 91
  275.12711 35.0 35
  277.09744 73.0 73
  279.09219 41.0 41
  280.10489 35.0 35
  281.11624 252.0 252
  282.1225 53.0 53
  283.09857 47.0 47
  283.12964 142.0 142
  283.45157 37.0 37
  283.50934 37.0 37
  285.06802 87.0 87
  285.07816 55.0 55
  285.11374 45.0 45
  286.05762 35.0 35
  286.08182 41.0 41
  286.10596 41.0 41
  287.08978 39.0 39
  287.10129 116.0 116
  287.12082 181.0 181
  287.13168 140.0 140
  288.08798 100.0 100
  289.10086 77.0 77
  289.15765 43.0 43
  292.02121 45.0 45
  292.98282 39.0 39
  296.09445 39.0 39
  297.11188 163.0 163
  298.1145 163.0 163
  299.08783 35.0 35
  299.1008 96.0 96
  299.12704 148.0 148
  300.12799 51.0 51
  301.0383 37.0 37
  301.07001 71.0 71
  301.12167 37.0 37
  301.13776 93.0 93
  302.40228 61.0 61
  303.04147 41.0 41
  303.08145 47.0 47
  304.31772 51.0 51
  305.10373 1000.0 999
  305.14957 37.0 37
  306.08759 57.0 57
  306.10452 140.0 140
  306.11224 59.0 59
  307.09634 35.0 35
  309.10025 35.0 35
  309.12567 35.0 35
  310.07974 41.0 41
  315.0882 51.0 51
  315.12201 144.0 144
  315.13043 47.0 47
  317.15262 37.0 37
  318.09659 41.0 41
  319.05109 110.0 110
  319.1062 35.0 35
  325.11206 163.0 163
  327.01682 41.0 41
  327.11743 47.0 47
  327.13199 35.0 35
  328.12473 35.0 35
  333.11417 39.0 39
  337.07001 35.0 35
  343.11365 53.0 53
  344.1106 45.0 45
  344.13065 73.0 73
  347.0708 49.0 49
  348.11407 45.0 45
  354.10223 37.0 37
  355.11813 51.0 51
  355.47778 51.0 51
  361.1301 494.0 494
  363.12418 35.0 35
  371.09836 81.0 81
  371.11325 37.0 37
  389.10815 41.0 41
  407.12701 39.0 39
  425.14221 35.0 35
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze