MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR303812

Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303812
RECORD_TITLE: Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide B
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O10
CH$EXACT_MASS: 424.402
CH$SMILES: C[C@@H]1C(=O)O[C@H]2[C@H](O)[C@@]34[C@H]5C[C@@H](C(C)(C)C)[C@@]33[C@@H](O)C(=O)O[C@H]3O[C@@]4(C(=O)O5)[C@@]12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O10/c1-6-12(23)28-11-9(21)18-8-5-7(16(2,3)4)17(18)10(22)13(24)29-15(17)30-20(18,14(25)27-8)19(6,11)26/h6-11,15,21-22,26H,5H2,1-4H3/t6-,7+,8-,9+,10+,11+,15+,17+,18+,19-,20-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY SQOJOAFXDQDRGF-MMQTXUMRSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.359533
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 425.1442234

PK$SPLASH: splash10-00kf-0920000000-e0ef80d5184ed6ee5b63
PK$NUM_PEAK: 227
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  79.04922 154.0 154
  79.05491 84.0 84
  81.06734 70.0 70
  81.0722 128.0 128
  87.08112 66.0 66
  91.05608 425.0 425
  93.07034 62.0 62
  95.08485 62.0 62
  97.03132 128.0 128
  105.06309 106.0 106
  105.07053 256.0 256
  105.07491 106.0 106
  107.09195 103.0 103
  111.08201 121.0 121
  115.04789 128.0 128
  115.05536 429.0 429
  117.05523 95.0 95
  117.06791 168.0 168
  117.07296 136.0 136
  119.04844 165.0 165
  119.08077 73.0 73
  121.02727 106.0 106
  123.0819 62.0 62
  127.04433 95.0 95
  127.06087 77.0 77
  128.05994 66.0 66
  129.06749 92.0 92
  129.07559 315.0 315
  130.06607 77.0 77
  130.07669 194.0 194
  130.08482 62.0 62
  131.073 125.0 125
  132.05197 66.0 66
  134.03235 103.0 103
  135.04163 88.0 88
  135.05579 81.0 81
  137.04893 92.0 92
  138.49768 158.0 158
  139.42648 99.0 99
  141.06847 330.0 330
  141.07872 143.0 143
  142.07773 839.0 838
  143.08649 1000.0 999
  144.05458 88.0 88
  144.08163 136.0 136
  144.10132 95.0 95
  145.06653 447.0 447
  145.09911 348.0 348
  145.10689 99.0 99
  146.10019 66.0 66
  146.10759 95.0 95
  147.00677 92.0 92
  147.04669 66.0 66
  147.07704 179.0 179
  147.11877 136.0 136
  148.04605 62.0 62
  149.05902 158.0 158
  152.05882 70.0 70
  152.07195 227.0 227
  153.06619 564.0 563
  153.07498 128.0 128
  154.07558 256.0 256
  155.04587 62.0 62
  155.07391 260.0 260
  155.08546 410.0 410
  156.05673 84.0 84
  156.09093 212.0 212
  157.06793 234.0 234
  157.09755 308.0 308
  157.1064 147.0 147
  157.15012 84.0 84
  158.07475 62.0 62
  158.10281 84.0 84
  158.10851 84.0 84
  159.04524 414.0 414
  159.0818 66.0 66
  159.12366 147.0 147
  160.05283 168.0 168
  160.08559 70.0 70
  161.02667 125.0 125
  161.04695 168.0 168
  161.06245 103.0 103
  161.0975 66.0 66
  162.03081 92.0 92
  165.0696 681.0 680
  166.07219 231.0 231
  166.08261 62.0 62
  167.08394 451.0 451
  169.06676 399.0 399
  169.09877 190.0 190
  170.0274 73.0 73
  170.10439 99.0 99
  171.03716 70.0 70
  171.04623 176.0 176
  171.0827 147.0 147
  171.11754 81.0 81
  171.35938 77.0 77
  172.091 150.0 150
  173.02605 62.0 62
  173.05644 66.0 66
  173.06651 92.0 92
  173.08778 81.0 81
  173.10033 205.0 205
  173.13171 99.0 99
  175.03542 139.0 139
  175.04254 110.0 110
  175.07449 249.0 249
  176.06525 106.0 106
  176.73048 70.0 70
  177.01381 73.0 73
  177.02722 62.0 62
  177.05809 147.0 147
  178.017 88.0 88
  178.06892 62.0 62
  179.08417 150.0 150
  180.09183 77.0 77
  180.1033 77.0 77
  181.05722 84.0 84
  181.06639 95.0 95
  181.09914 73.0 73
  182.07509 125.0 125
  183.07059 99.0 99
  183.07823 275.0 275
  183.11501 73.0 73
  184.0963 88.0 88
  185.05727 179.0 179
  185.07985 66.0 66
  185.09468 571.0 570
  185.12883 73.0 73
  186.07153 73.0 73
  187.04356 154.0 154
  187.07901 132.0 132
  187.10439 125.0 125
  187.34868 77.0 77
  187.95911 62.0 62
  189.05083 106.0 106
  189.09058 77.0 77
  191.03461 158.0 158
  191.04257 172.0 172
  191.08034 70.0 70
  192.03934 92.0 92
  192.09152 139.0 139
  193.04208 66.0 66
  194.07185 73.0 73
  195.08128 242.0 242
  195.1189 66.0 66
  196.07672 62.0 62
  196.10857 73.0 73
  196.12569 77.0 77
  197.05508 70.0 70
  197.10283 88.0 88
  197.13634 66.0 66
  198.06483 62.0 62
  198.09729 66.0 66
  199.03735 179.0 179
  199.06789 220.0 220
  199.10658 66.0 66
  199.13475 84.0 84
  200.04681 125.0 125
  201.0925 231.0 231
  201.14362 70.0 70
  202.07939 70.0 70
  202.09749 99.0 99
  203.10985 139.0 139
  204.08287 106.0 106
  205.03136 84.0 84
  205.08655 62.0 62
  205.1069 77.0 77
  206.11664 66.0 66
  207.10774 70.0 70
  207.11548 201.0 201
  208.08775 95.0 95
  210.10579 139.0 139
  211.07706 158.0 158
  211.12164 73.0 73
  212.0583 81.0 81
  212.07484 165.0 165
  213.05429 73.0 73
  213.06317 81.0 81
  213.09276 73.0 73
  213.13054 73.0 73
  214.05234 84.0 84
  214.08994 95.0 95
  214.09785 62.0 62
  214.13474 88.0 88
  215.06551 84.0 84
  216.05919 121.0 121
  217.08394 158.0 158
  222.10522 66.0 66
  223.11676 73.0 73
  225.07703 62.0 62
  225.08658 81.0 81
  226.0399 66.0 66
  227.03363 128.0 128
  227.06859 66.0 66
  227.11177 77.0 77
  228.03606 125.0 125
  229.0889 150.0 150
  229.12762 88.0 88
  230.04922 99.0 99
  232.1031 81.0 81
  235.02939 77.0 77
  235.11005 150.0 150
  237.04517 103.0 103
  237.08627 70.0 70
  238.0966 66.0 66
  240.08719 110.0 110
  241.04143 81.0 81
  241.06412 81.0 81
  241.08835 227.0 227
  241.17458 62.0 62
  243.09776 77.0 77
  245.08022 62.0 62
  245.40703 165.0 165
  248.08514 132.0 132
  256.06592 66.0 66
  263.08243 70.0 70
  264.07065 139.0 139
  264.08331 77.0 77
  266.40872 62.0 62
  269.09085 99.0 99
  269.11053 62.0 62
  271.09177 73.0 73
  276.63419 121.0 121
  319.99457 66.0 66
  322.39313 66.0 66
  347.35712 62.0 62
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze