MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR303827

Saikosaponin a; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303827
RECORD_TITLE: Saikosaponin a; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Saikosaponin a
CH$COMPOUND_CLASS: Triterpene saponins
CH$FORMULA: C42H68O13
CH$EXACT_MASS: 780.993
CH$SMILES: C[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2CC[C@@]3(C)[C@@H](CC[C@]4(C)[C@@H]3C=C[C@]35OC[C@@]6(CCC(C)(C)C[C@@H]36)[C@@H](O)C[C@@]45C)[C@]2(C)CO)[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)[C@H]1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C42H68O13/c1-21-28(46)33(55-34-31(49)30(48)29(47)22(18-43)53-34)32(50)35(52-21)54-27-10-11-37(4)23(38(27,5)19-44)8-12-39(6)24(37)9-13-42-25-16-36(2,3)14-15-41(25,20-51-42)26(45)17-40(39,42)7/h9,13,21-35,43-50H,8,10-12,14-20H2,1-7H3/t21-,22-,23-,24-,25-,26+,27+,28+,29-,30+,31-,32-,33+,34+,35+,37+,38+,39-,40+,41-,42+/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY KYWSCMDFVARMPN-MSSMMRRTSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 7.1571
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 781.4732687

PK$SPLASH: splash10-0uds-1982200000-c3fa87c7fe23fa5c1fa0
PK$NUM_PEAK: 106
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  69.0689 112.0 112
  75.04274 95.0 95
  81.06853 313.0 313
  83.04972 212.0 212
  85.02768 123.0 123
  85.03503 112.0 112
  95.08585 123.0 123
  101.02299 95.0 95
  104.8659 95.0 95
  109.10287 201.0 201
  111.04168 296.0 296
  111.11659 128.0 128
  119.08501 184.0 184
  119.09167 123.0 123
  120.09216 95.0 95
  121.09772 223.0 223
  125.09901 95.0 95
  129.05968 95.0 95
  135.08904 95.0 95
  135.11795 441.0 441
  137.12965 128.0 128
  145.04825 128.0 128
  145.09537 318.0 318
  146.10632 145.0 145
  147.11609 95.0 95
  149.13078 436.0 436
  154.10698 95.0 95
  155.08856 128.0 128
  157.10114 95.0 95
  159.11252 218.0 218
  160.11623 123.0 123
  161.12239 112.0 112
  162.10268 117.0 117
  163.10532 95.0 95
  167.10316 134.0 134
  169.10962 117.0 117
  171.11066 112.0 112
  175.14174 251.0 251
  181.11818 95.0 95
  185.14165 106.0 106
  187.14056 123.0 123
  187.153 201.0 201
  189.16118 223.0 223
  190.12793 112.0 112
  193.15927 184.0 184
  195.10713 101.0 101
  195.11931 134.0 134
  199.10564 95.0 95
  201.12938 123.0 123
  201.16676 385.0 385
  203.17413 128.0 128
  204.19063 95.0 95
  205.15942 134.0 134
  205.16852 201.0 201
  211.14561 145.0 145
  212.15594 106.0 106
  213.1657 615.0 614
  215.186 151.0 151
  217.15982 140.0 140
  218.1537 101.0 101
  224.15291 101.0 101
  225.16205 156.0 156
  227.13896 123.0 123
  227.17435 307.0 307
  228.16035 106.0 106
  231.16759 101.0 101
  239.17972 95.0 95
  241.2063 240.0 240
  242.17415 101.0 101
  245.19182 95.0 95
  251.19156 168.0 168
  253.19682 1000.0 999
  254.2036 106.0 106
  257.18091 212.0 212
  265.19739 95.0 95
  266.1911 95.0 95
  267.19388 117.0 117
  269.23602 140.0 140
  270.18524 112.0 112
  275.1828 128.0 128
  281.2254 117.0 117
  283.19775 173.0 173
  284.19534 112.0 112
  303.20749 156.0 156
  306.22986 218.0 218
  309.23569 112.0 112
  309.24908 101.0 101
  349.2793 112.0 112
  363.33273 106.0 106
  377.31915 190.0 190
  389.30682 117.0 117
  389.34503 101.0 101
  390.32297 101.0 101
  393.2851 112.0 112
  397.30988 151.0 151
  399.29379 112.0 112
  407.3107 112.0 112
  408.31549 112.0 112
  409.3078 128.0 128
  411.34787 168.0 168
  418.75284 134.0 134
  419.31506 140.0 140
  419.33649 101.0 101
  426.88809 112.0 112
  437.33792 425.0 425
  455.3555 346.0 346
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze