MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR303829

Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303829
RECORD_TITLE: Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide B
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O10
CH$EXACT_MASS: 424.402
CH$SMILES: C[C@@H]1C(=O)O[C@H]2[C@H](O)[C@@]34[C@H]5C[C@@H](C(C)(C)C)[C@@]33[C@@H](O)C(=O)O[C@H]3O[C@@]4(C(=O)O5)[C@@]12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O10/c1-6-12(23)28-11-9(21)18-8-5-7(16(2,3)4)17(18)10(22)13(24)29-15(17)30-20(18,14(25)27-8)19(6,11)26/h6-11,15,21-22,26H,5H2,1-4H3/t6-,7+,8-,9+,10+,11+,15+,17+,18+,19-,20-/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY SQOJOAFXDQDRGF-MMQTXUMRSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.359533
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 425.1442234

PK$SPLASH: splash10-004i-0375900000-34e107ff522356c8d7be
PK$NUM_PEAK: 177
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  91.05721 7.0 7
  97.02973 13.0 13
  119.08138 6.0 6
  123.07991 6.0 6
  127.03821 7.0 7
  135.0455 6.0 6
  137.06062 6.0 6
  141.07159 10.0 10
  145.01918 5.0 5
  145.06647 39.0 39
  147.07802 6.0 6
  147.12892 5.0 5
  151.00464 6.0 6
  151.8289 7.0 7
  153.07463 7.0 7
  157.10065 14.0 14
  159.07443 6.0 6
  159.08034 16.0 16
  161.06281 10.0 10
  162.06409 8.0 8
  163.04164 7.0 7
  164.12218 6.0 6
  167.04088 6.0 6
  168.08058 6.0 6
  169.06041 9.0 9
  169.0995 6.0 6
  171.07288 6.0 6
  173.06105 6.0 6
  173.09576 13.0 13
  176.07394 6.0 6
  176.08838 6.0 6
  177.05124 24.0 24
  177.09711 6.0 6
  183.12309 6.0 6
  185.05919 6.0 6
  185.09502 6.0 6
  187.07368 9.0 9
  187.10979 9.0 9
  189.06543 8.0 8
  191.03531 6.0 6
  191.10231 9.0 9
  195.09024 5.0 5
  195.12215 14.0 14
  197.08942 6.0 6
  198.07054 6.0 6
  201.08421 9.0 9
  201.09462 13.0 13
  203.03448 11.0 11
  203.11464 7.0 7
  207.02225 5.0 5
  207.03728 6.0 6
  207.12036 10.0 10
  210.06909 5.0 5
  211.11028 7.0 7
  212.0798 12.0 12
  213.06044 5.0 5
  213.08743 23.0 23
  213.09839 21.0 21
  213.13065 9.0 9
  214.09122 5.0 5
  215.06024 5.0 5
  215.10605 11.0 11
  217.08614 18.0 18
  219.06558 6.0 6
  219.10051 16.0 16
  221.03688 5.0 5
  221.04668 21.0 21
  223.04323 6.0 6
  223.11002 18.0 18
  225.09203 12.0 12
  225.13853 5.0 5
  226.0957 10.0 10
  229.0979 10.0 10
  229.11154 12.0 12
  230.10295 5.0 5
  231.09982 13.0 13
  231.14078 8.0 8
  234.06448 6.0 6
  235.11723 18.0 18
  237.08749 5.0 5
  237.14388 6.0 6
  237.59364 6.0 6
  238.09523 6.0 6
  239.07892 5.0 5
  241.08394 24.0 24
  241.12486 13.0 13
  243.05916 10.0 10
  243.10135 10.0 10
  245.08791 19.0 19
  245.11322 10.0 10
  247.05644 9.0 9
  247.10577 10.0 10
  247.13188 7.0 7
  249.11087 5.0 5
  251.04079 6.0 6
  251.06013 8.0 8
  251.09906 6.0 6
  251.11087 10.0 10
  253.12764 26.0 26
  255.03014 5.0 5
  255.13789 6.0 6
  255.40314 5.0 5
  257.04373 13.0 13
  257.07587 25.0 25
  257.09167 25.0 25
  257.12213 10.0 10
  259.09787 9.0 9
  261.11157 5.0 5
  262.09125 8.0 8
  269.09457 5.0 5
  269.1145 15.0 15
  271.12915 19.0 19
  272.13086 6.0 6
  273.03699 7.0 7
  273.0498 6.0 6
  273.07294 8.0 8
  275.07455 16.0 16
  275.0936 35.0 35
  276.0929 11.0 11
  277.13324 5.0 5
  278.11313 6.0 6
  280.0733 5.0 5
  281.11411 14.0 14
  283.12286 5.0 5
  287.12585 14.0 14
  287.39484 5.0 5
  289.10724 6.0 6
  289.11777 5.0 5
  289.15692 6.0 6
  293.06561 7.0 7
  296.08606 6.0 6
  297.09818 5.0 5
  297.11627 9.0 9
  299.11993 21.0 21
  301.069 18.0 18
  301.14355 14.0 14
  305.09033 12.0 12
  305.10455 73.0 73
  306.11133 10.0 10
  307.09454 15.0 15
  309.10812 6.0 6
  315.11185 14.0 14
  315.12332 14.0 14
  316.78177 6.0 6
  318.98254 6.0 6
  319.05054 7.0 7
  320.04486 9.0 9
  321.069 6.0 6
  321.10831 21.0 21
  325.09335 8.0 8
  325.11292 6.0 6
  327.10699 9.0 9
  327.125 16.0 16
  333.12369 16.0 16
  333.14343 13.0 13
  335.09592 13.0 13
  337.06082 5.0 5
  339.06909 9.0 9
  343.11484 33.0 33
  344.10867 6.0 6
  344.13177 9.0 9
  347.10452 6.0 6
  361.10953 23.0 23
  361.13251 127.0 127
  362.12112 13.0 13
  363.12363 7.0 7
  371.11826 48.0 48
  372.12317 6.0 6
  379.12701 9.0 9
  389.12247 47.0 47
  390.13297 13.0 13
  407.12317 21.0 21
  407.1413 20.0 20
  408.13287 10.0 10
  409.15747 17.0 17
  425.14572 1000.0 999
  425.18979 6.0 6
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze