MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR303897

Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303897
RECORD_TITLE: Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide C
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O11
CH$EXACT_MASS: 440.401
CH$SMILES: CC1C(=O)OC2C(O)C34C5OC(=O)C3(OC3OC(=O)C(O)C43C(C5O)C(C)(C)C)C12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O11/c1-5-12(24)28-11-8(22)18-10-6(21)7(16(2,3)4)17(18)9(23)13(25)30-15(17)31-20(18,14(26)29-10)19(5,11)27/h5-11,15,21-23,27H,1-4H3
CH$LINK: INCHIKEY AMOGMTLMADGEOQ-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 4.33045
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 441.139138

PK$SPLASH: splash10-0006-0354900000-162fd6147fb6936d81da
PK$NUM_PEAK: 196
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  109.10001 9.0 9
  111.0306 7.0 7
  121.02412 7.0 7
  121.06482 6.0 6
  123.04527 6.0 6
  131.08293 6.0 6
  133.0946 7.0 7
  143.09064 9.0 9
  145.07468 7.0 7
  149.02263 6.0 6
  149.06555 12.0 12
  150.07443 6.0 6
  153.09445 9.0 9
  154.93353 7.0 7
  155.03918 10.0 10
  157.01149 7.0 7
  157.05408 9.0 9
  160.08774 7.0 7
  161.05232 7.0 7
  161.06033 6.0 6
  161.06654 8.0 8
  163.04008 7.0 7
  163.12714 8.0 8
  164.07306 6.0 6
  165.01802 6.0 6
  171.06662 7.0 7
  172.07649 8.0 8
  173.00987 7.0 7
  173.06151 12.0 12
  173.13824 6.0 6
  175.03914 6.0 6
  175.06129 6.0 6
  175.07788 11.0 11
  177.01021 6.0 6
  177.05334 38.0 38
  179.03603 20.0 20
  185.05479 6.0 6
  185.12762 7.0 7
  185.14755 7.0 7
  189.00963 17.0 17
  189.04652 7.0 7
  189.06297 7.0 7
  189.62074 6.0 6
  190.10005 6.0 6
  191.02101 6.0 6
  191.03249 7.0 7
  191.05255 8.0 8
  192.03706 8.0 8
  193.05992 11.0 11
  195.01465 9.0 9
  195.02832 45.0 45
  195.08153 8.0 8
  196.03687 13.0 13
  197.10715 6.0 6
  198.16837 6.0 6
  201.01328 7.0 7
  201.09718 8.0 8
  202.09978 6.0 6
  203.07036 28.0 28
  203.07761 11.0 11
  203.10756 6.0 6
  204.03027 6.0 6
  205.03987 10.0 10
  205.04543 25.0 25
  207.06639 12.0 12
  207.15717 6.0 6
  208.08771 10.0 10
  209.05592 6.0 6
  211.07423 16.0 16
  211.11171 6.0 6
  212.08176 7.0 7
  213.09259 9.0 9
  213.12166 7.0 7
  213.13235 6.0 6
  215.02747 11.0 11
  215.10851 6.0 6
  215.76035 15.0 15
  217.09209 8.0 8
  219.0209 6.0 6
  219.05199 8.0 8
  219.06593 29.0 29
  221.01001 9.0 9
  221.0455 7.0 7
  223.02522 7.0 7
  223.04662 6.0 6
  223.06187 9.0 9
  227.11009 18.0 18
  229.04568 9.0 9
  230.1272 6.0 6
  231.03554 6.0 6
  231.06259 8.0 8
  233.03583 38.0 38
  233.0482 52.0 52
  234.04633 12.0 12
  237.03577 8.0 8
  237.07475 7.0 7
  241.05331 10.0 10
  241.11977 15.0 15
  241.12914 7.0 7
  243.09807 14.0 14
  245.11674 7.0 7
  247.02602 6.0 6
  247.04234 8.0 8
  247.06102 11.0 11
  248.07039 19.0 19
  249.08162 8.0 8
  251.01544 8.0 8
  251.04897 12.0 12
  251.06201 20.0 20
  251.07401 10.0 10
  252.07204 11.0 11
  257.04425 9.0 9
  257.1235 7.0 7
  260.12762 6.0 6
  261.02805 7.0 7
  261.04541 13.0 13
  261.06219 6.0 6
  263.05658 11.0 11
  265.06958 16.0 16
  267.06348 6.0 6
  267.08899 10.0 10
  267.11459 7.0 7
  272.14542 6.0 6
  275.07581 6.0 6
  275.11981 7.0 7
  276.06439 13.0 13
  277.01389 6.0 6
  279.02695 8.0 8
  279.05649 19.0 19
  280.05988 6.0 6
  281.06754 14.0 14
  287.12061 6.0 6
  293.09558 7.0 7
  294.05017 8.0 8
  294.06509 6.0 6
  295.09525 6.0 6
  295.1109 7.0 7
  304.05338 7.0 7
  305.12314 7.0 7
  307.03763 28.0 28
  307.05246 51.0 51
  308.05475 6.0 6
  308.06509 6.0 6
  309.04449 8.0 8
  312.07465 7.0 7
  314.24716 6.0 6
  315.10492 6.0 6
  315.13217 7.0 7
  318.81552 7.0 7
  319.12784 9.0 9
  321.14011 12.0 12
  323.07715 7.0 7
  325.05014 97.0 97
  325.06775 44.0 44
  325.0874 9.0 9
  326.05258 6.0 6
  326.061 15.0 15
  327.05798 6.0 6
  327.07385 12.0 12
  331.11472 13.0 13
  333.14084 7.0 7
  335.07785 12.0 12
  335.84332 6.0 6
  339.0712 6.0 6
  339.08646 6.0 6
  349.06543 7.0 7
  349.12109 46.0 46
  349.13593 11.0 11
  350.12494 8.0 8
  353.0405 11.0 11
  353.05835 13.0 13
  359.10339 6.0 6
  361.12689 6.0 6
  367.04608 6.0 6
  367.12701 20.0 20
  367.15302 13.0 13
  368.1524 7.0 7
  377.11099 6.0 6
  377.13095 55.0 55
  385.06964 8.0 8
  386.06158 8.0 8
  389.58377 7.0 7
  395.10736 6.0 6
  395.13776 30.0 30
  396.14389 7.0 7
  396.16162 6.0 6
  405.12332 13.0 13
  413.13126 6.0 6
  417.74927 6.0 6
  423.11136 6.0 6
  423.13123 6.0 6
  424.12067 8.0 8
  428.66095 7.0 7
  441.09521 19.0 19
  441.12906 396.0 396
  441.14221 1000.0 999
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze