MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR303905

Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303905
RECORD_TITLE: Ginkgolide C; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Ginkgolide C
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O11
CH$EXACT_MASS: 440.401
CH$SMILES: CC1C(=O)OC2C(O)C34C5OC(=O)C3(OC3OC(=O)C(O)C43C(C5O)C(C)(C)C)C12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O11/c1-5-12(24)28-11-8(22)18-10-6(21)7(16(2,3)4)17(18)9(23)13(25)30-15(17)31-20(18,14(26)29-10)19(5,11)27/h5-11,15,21-23,27H,1-4H3
CH$LINK: INCHIKEY AMOGMTLMADGEOQ-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 4.33045
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 441.139138

PK$SPLASH: splash10-004j-0910000000-b926e6326c27f94db142
PK$NUM_PEAK: 162
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  71.08493 34.0 34
  77.03665 49.0 49
  83.01054 60.0 60
  83.01754 76.0 76
  83.04961 24.0 24
  89.0408 26.0 26
  91.04309 24.0 24
  91.05503 98.0 98
  92.05923 24.0 24
  93.02879 29.0 29
  93.06768 23.0 23
  93.07331 62.0 62
  94.07274 32.0 32
  95.09369 24.0 24
  98.1534 80.0 80
  102.15434 33.0 33
  103.04974 27.0 27
  103.0561 121.0 121
  104.05555 30.0 30
  105.07056 222.0 222
  105.98704 24.0 24
  107.01472 39.0 39
  107.0486 116.0 116
  109.02934 29.0 29
  111.04289 75.0 75
  115.05763 122.0 122
  117.06961 27.0 27
  118.07633 26.0 26
  119.04453 86.0 86
  119.08428 50.0 50
  121.02923 29.0 29
  121.06327 208.0 208
  123.0451 132.0 132
  124.00911 47.0 47
  125.02055 30.0 30
  128.06223 76.0 76
  128.67096 24.0 24
  129.05885 29.0 29
  129.07031 67.0 67
  131.04532 26.0 26
  131.09108 26.0 26
  132.04922 24.0 24
  132.07605 36.0 36
  133.02542 80.0 80
  133.06662 155.0 155
  133.10953 39.0 39
  134.07214 46.0 46
  135.03577 24.0 24
  135.04726 110.0 110
  135.07869 27.0 27
  137.02644 149.0 149
  137.05696 26.0 26
  137.44083 29.0 29
  139.03374 24.0 24
  141.06938 34.0 34
  141.07535 29.0 29
  143.04968 77.0 77
  143.09262 29.0 29
  144.03821 39.0 39
  144.05362 24.0 24
  145.0228 27.0 27
  145.06104 56.0 56
  145.06816 36.0 36
  147.09552 27.0 27
  148.08546 26.0 26
  148.98715 33.0 33
  149.02094 209.0 209
  149.03012 76.0 76
  149.05853 175.0 175
  149.06915 90.0 90
  149.12289 37.0 37
  150.01578 27.0 27
  150.02519 30.0 30
  150.0334 32.0 32
  151.00455 33.0 33
  151.04497 63.0 63
  153.00693 43.0 43
  153.0209 27.0 27
  153.05144 29.0 29
  156.05319 30.0 30
  157.07176 53.0 53
  159.04498 56.0 56
  159.07637 60.0 60
  161.0231 24.0 24
  161.05763 26.0 26
  162.06187 76.0 76
  163.01384 39.0 39
  163.04088 82.0 82
  163.07428 95.0 95
  163.08376 30.0 30
  164.03642 29.0 29
  164.04758 26.0 26
  164.68169 24.0 24
  165.0159 60.0 60
  165.07068 29.0 29
  167.03163 73.0 73
  168.04698 34.0 34
  169.02693 27.0 27
  170.07068 44.0 44
  171.03661 55.0 55
  171.08183 27.0 27
  171.18878 24.0 24
  173.06134 83.0 83
  174.02277 29.0 29
  174.0981 24.0 24
  175.04446 24.0 24
  175.077 24.0 24
  177.01546 56.0 56
  177.05475 1000.0 999
  177.09708 27.0 27
  178.02983 30.0 30
  178.06088 63.0 63
  178.06808 30.0 30
  178.07726 36.0 36
  180.09708 24.0 24
  181.40387 32.0 32
  183.03917 24.0 24
  183.12154 26.0 26
  185.06001 36.0 36
  185.09767 92.0 92
  187.03641 55.0 55
  187.1118 24.0 24
  189.05493 43.0 43
  189.0649 53.0 53
  189.09119 26.0 26
  190.05682 30.0 30
  191.0284 66.0 66
  191.03967 53.0 53
  193.05029 36.0 36
  195.02985 505.0 504
  196.03815 56.0 56
  199.07304 29.0 29
  199.08398 26.0 26
  201.02394 27.0 27
  201.05882 33.0 33
  201.12831 36.0 36
  202.03404 39.0 39
  203.07843 88.0 88
  204.04922 33.0 33
  205.02139 24.0 24
  205.04541 102.0 102
  207.0275 24.0 24
  207.06082 43.0 43
  212.08383 34.0 34
  212.10963 40.0 40
  215.03607 82.0 82
  215.0563 29.0 29
  215.0685 24.0 24
  216.07512 33.0 33
  217.04761 24.0 24
  219.05872 55.0 55
  219.07219 29.0 29
  220.07262 29.0 29
  221.05281 29.0 29
  223.06375 33.0 33
  225.05968 34.0 34
  225.0903 34.0 34
  230.04634 24.0 24
  231.1338 32.0 32
  243.02235 29.0 29
  251.00772 34.0 34
  374.76828 24.0 24
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze