MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR304376

Saikosaponin D; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR304376
RECORD_TITLE: Saikosaponin D; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Saikosaponin D
CH$COMPOUND_CLASS: Triterpene saponins
CH$FORMULA: C42H68O13
CH$EXACT_MASS: 780.993
CH$SMILES: C[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2CC[C@@]3(C)[C@@H](CC[C@]4(C)[C@@H]3C=CC35OC[C@@]6(CCC(C)(C)CC36)C(O)C[C@@]45C)[C@]2(C)CO)[C@H](O)C(OC2OC(CO)C(O)C(O)[C@H]2O)C1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C42H68O13/c1-21-28(46)33(55-34-31(49)30(48)29(47)22(18-43)53-34)32(50)35(52-21)54-27-10-11-37(4)23(38(27,5)19-44)8-12-39(6)24(37)9-13-42-25-16-36(2,3)14-15-41(25,20-51-42)26(45)17-40(39,42)7/h9,13,21-35,43-50H,8,10-12,14-20H2,1-7H3/t21-,22?,23-,24-,25?,26?,27+,28?,29?,30?,31-,32-,33?,34?,35+,37+,38+,39-,40+,41-,42?/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY KYWSCMDFVARMPN-DISCDMJRSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 8.253117
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 781.4732687

PK$SPLASH: splash10-02di-0952100000-da562abf67be31c6618d
PK$NUM_PEAK: 112
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  81.03714 161.0 161
  85.02904 136.0 136
  93.05968 136.0 136
  95.08997 271.0 271
  97.02875 195.0 195
  105.05168 144.0 144
  105.06379 153.0 153
  107.08957 280.0 280
  109.09773 305.0 305
  111.04645 246.0 246
  111.08186 153.0 153
  112.0544 136.0 136
  120.09345 161.0 161
  121.09338 136.0 136
  121.10234 136.0 136
  123.0839 297.0 297
  123.11633 619.0 618
  128.04131 398.0 398
  131.09137 144.0 144
  133.1069 169.0 169
  145.04738 178.0 178
  145.05724 136.0 136
  146.10234 178.0 178
  147.06525 136.0 136
  149.13306 288.0 288
  150.14113 169.0 169
  151.11665 415.0 415
  153.09137 144.0 144
  157.09998 203.0 203
  161.11905 322.0 322
  163.1489 492.0 492
  165.12276 136.0 136
  165.16466 136.0 136
  174.1405 322.0 322
  175.14742 1000.0 999
  176.14467 136.0 136
  177.15633 136.0 136
  177.16719 136.0 136
  183.12137 136.0 136
  185.13463 271.0 271
  186.14307 178.0 178
  187.14763 610.0 609
  188.15164 322.0 322
  191.12962 186.0 186
  191.13815 144.0 144
  195.14787 144.0 144
  197.1283 169.0 169
  199.15352 347.0 347
  201.12172 136.0 136
  201.15323 169.0 169
  201.168 144.0 144
  203.17575 144.0 144
  203.19298 136.0 136
  206.14014 153.0 153
  207.11584 212.0 212
  207.18236 178.0 178
  209.94528 136.0 136
  213.15689 297.0 297
  213.17188 246.0 246
  215.16219 347.0 347
  217.16119 314.0 314
  220.30536 136.0 136
  227.17691 161.0 161
  231.17599 144.0 144
  232.21004 153.0 153
  241.19492 136.0 136
  245.19 136.0 136
  248.353 136.0 136
  253.15855 178.0 178
  253.19443 136.0 136
  253.20312 203.0 203
  255.1743 161.0 161
  255.2063 153.0 153
  265.20532 373.0 373
  267.20511 271.0 271
  268.22308 169.0 169
  269.22995 178.0 178
  276.19342 136.0 136
  279.21793 288.0 288
  281.21527 136.0 136
  284.20148 136.0 136
  285.21692 136.0 136
  293.22238 280.0 280
  310.23047 136.0 136
  313.2049 178.0 178
  317.21805 136.0 136
  320.23953 178.0 178
  321.21411 169.0 169
  349.30508 229.0 229
  351.26593 136.0 136
  373.22101 144.0 144
  377.34357 136.0 136
  379.28589 136.0 136
  379.29788 161.0 161
  380.29099 136.0 136
  381.30533 136.0 136
  391.30365 136.0 136
  391.33847 178.0 178
  393.3027 153.0 153
  393.3187 178.0 178
  397.32507 153.0 153
  398.31393 178.0 178
  409.2915 288.0 288
  409.34128 136.0 136
  411.31445 144.0 144
  411.34772 144.0 144
  415.30411 144.0 144
  419.33643 169.0 169
  437.35721 169.0 169
  455.3501 153.0 153
  456.34094 136.0 136
  456.36694 144.0 144
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze