MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR304392

Saikosaponin D; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR304392
RECORD_TITLE: Saikosaponin D; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Saikosaponin D
CH$COMPOUND_CLASS: Triterpene saponins
CH$FORMULA: C42H68O13
CH$EXACT_MASS: 780.993
CH$SMILES: C[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2CC[C@@]3(C)[C@@H](CC[C@]4(C)[C@@H]3C=CC35OC[C@@]6(CCC(C)(C)CC36)C(O)C[C@@]45C)[C@]2(C)CO)[C@H](O)C(OC2OC(CO)C(O)C(O)[C@H]2O)C1O
CH$IUPAC: InChI=1S/C42H68O13/c1-21-28(46)33(55-34-31(49)30(48)29(47)22(18-43)53-34)32(50)35(52-21)54-27-10-11-37(4)23(38(27,5)19-44)8-12-39(6)24(37)9-13-42-25-16-36(2,3)14-15-41(25,20-51-42)26(45)17-40(39,42)7/h9,13,21-35,43-50H,8,10-12,14-20H2,1-7H3/t21-,22?,23-,24-,25?,26?,27+,28?,29?,30?,31-,32-,33?,34?,35+,37+,38+,39-,40+,41-,42?/m1/s1
CH$LINK: INCHIKEY KYWSCMDFVARMPN-DISCDMJRSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 8.253117
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 781.4732687

PK$SPLASH: splash10-02ti-1960200000-87d74700d95d3aa37c72
PK$NUM_PEAK: 111
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  69.07178 157.0 157
  75.04092 206.0 206
  75.04587 157.0 157
  85.02792 471.0 471
  85.0365 157.0 157
  95.08287 353.0 353
  95.08801 157.0 157
  97.10066 402.0 402
  97.10809 225.0 225
  106.06719 157.0 157
  107.08672 431.0 431
  109.05945 157.0 157
  109.09921 333.0 333
  109.10699 373.0 373
  110.10265 186.0 186
  111.04626 441.0 441
  111.08614 422.0 422
  119.08681 431.0 431
  121.10459 324.0 324
  129.05424 167.0 167
  131.07047 186.0 186
  133.10083 373.0 373
  135.11574 853.0 852
  137.10272 196.0 196
  137.13104 176.0 176
  144.0909 176.0 176
  145.05478 235.0 235
  146.10674 206.0 206
  147.10992 167.0 167
  149.13002 196.0 196
  149.13744 157.0 157
  150.13644 304.0 304
  151.15059 167.0 167
  158.09935 157.0 157
  161.13824 343.0 343
  161.15024 157.0 157
  162.1368 176.0 176
  163.12044 216.0 216
  163.14468 196.0 196
  169.09048 157.0 157
  170.10497 343.0 343
  173.10526 167.0 167
  174.13014 157.0 157
  175.15224 167.0 167
  177.13478 157.0 157
  177.17285 167.0 167
  180.15144 186.0 186
  183.12149 157.0 157
  185.13515 225.0 225
  187.11693 225.0 225
  187.14497 206.0 206
  187.15273 353.0 353
  189.1658 206.0 206
  190.16924 510.0 509
  194.12228 176.0 176
  199.14752 157.0 157
  200.15054 167.0 167
  201.15924 186.0 186
  201.17412 157.0 157
  202.17082 186.0 186
  203.13799 196.0 196
  204.1804 294.0 294
  211.14238 186.0 186
  212.15433 167.0 167
  213.14511 186.0 186
  213.16612 157.0 157
  213.17783 167.0 167
  214.17912 176.0 176
  215.17827 157.0 157
  215.19055 157.0 157
  217.15794 167.0 167
  219.13148 186.0 186
  227.09975 353.0 353
  227.18004 167.0 167
  229.17987 206.0 206
  229.19763 206.0 206
  231.17432 539.0 538
  239.09579 216.0 216
  239.18111 324.0 324
  241.19566 373.0 373
  251.18317 235.0 235
  253.19675 176.0 176
  253.20978 176.0 176
  254.06107 167.0 167
  254.19514 235.0 235
  255.17801 245.0 245
  255.22079 196.0 196
  256.21173 157.0 157
  257.19901 196.0 196
  267.1748 157.0 157
  271.19382 206.0 206
  273.22699 206.0 206
  281.19485 294.0 294
  282.21841 157.0 157
  283.18863 157.0 157
  301.21646 324.0 324
  312.58514 167.0 167
  359.24207 167.0 167
  361.28491 235.0 235
  396.33411 176.0 176
  401.32462 167.0 167
  407.33188 167.0 167
  409.36124 176.0 176
  411.3165 333.0 333
  411.33105 157.0 157
  412.33606 157.0 157
  419.33359 1000.0 999
  425.33453 157.0 157
  427.36288 167.0 167
  437.34427 235.0 235
  438.33786 157.0 157
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze