MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR307883

Etoposide; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR307883
RECORD_TITLE: Etoposide; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Etoposide
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C29H32O13
CH$EXACT_MASS: 588.562
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1O)C1C2C(COC2=O)C(OC2OC3COC(C)OC3C(O)C2O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C29H32O13/c1-11-36-9-20-27(40-11)24(31)25(32)29(41-20)42-26-14-7-17-16(38-10-39-17)6-13(14)21(22-15(26)8-37-28(22)33)12-4-18(34-2)23(30)19(5-12)35-3/h4-7,11,15,20-22,24-27,29-32H,8-10H2,1-3H3
CH$LINK: INCHIKEY VJJPUSNTGOMMGY-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE -2.75 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.420317
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+HCOO]-
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 633.18249395183

PK$SPLASH: splash10-0bvi-1649000000-429411946261b385429b
PK$NUM_PEAK: 135
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  49.85488 27.0 27
  55.01551 15.0 15
  56.25844 15.0 15
  58.32857 18.0 18
  83.01144 31.0 31
  84.01677 18.0 18
  85.029 137.0 137
  86.03551 24.0 24
  95.01308 59.0 59
  96.01735 20.0 20
  99.00683 33.0 33
  99.73396 16.0 16
  106.00432 16.0 16
  113.02313 595.0 594
  114.02723 81.0 81
  121.01993 19.0 19
  121.02892 66.0 66
  121.03811 15.0 15
  125.02091 20.0 20
  127.03847 498.0 498
  128.04343 59.0 59
  137.02167 29.0 29
  138.02754 33.0 33
  138.03612 25.0 25
  138.99988 17.0 17
  139.03191 18.0 18
  142.02202 20.0 20
  144.0645 20.0 20
  145.047 41.0 41
  145.054 72.0 72
  146.05771 46.0 46
  147.05728 15.0 15
  153.05434 107.0 107
  157.06357 53.0 53
  171.04863 16.0 16
  173.05305 21.0 21
  176.04388 17.0 17
  176.05058 18.0 18
  179.04994 18.0 18
  185.06369 18.0 18
  197.08545 15.0 15
  199.03351 31.0 31
  199.05006 15.0 15
  204.06664 19.0 19
  207.09984 16.0 16
  208.05792 19.0 19
  223.07056 35.0 35
  225.05991 44.0 44
  227.03241 24.0 24
  237.05438 18.0 18
  237.08322 18.0 18
  239.03287 16.0 16
  239.05789 16.0 16
  239.07373 15.0 15
  241.03862 16.0 16
  241.05412 37.0 37
  247.05977 15.0 15
  250.05112 26.0 26
  250.07051 15.0 15
  254.98566 38.0 38
  263.07242 15.0 15
  264.03506 16.0 16
  265.04965 17.0 17
  265.08942 15.0 15
  267.0835 15.0 15
  275.05847 16.0 16
  275.07291 19.0 19
  277.05325 92.0 92
  277.06497 18.0 18
  278.05609 43.0 43
  279.05521 119.0 119
  279.06876 112.0 112
  280.06317 52.0 52
  280.08691 19.0 19
  281.07907 55.0 55
  281.091 39.0 39
  282.09164 15.0 15
  283.02328 15.0 15
  289.04919 15.0 15
  291.07126 36.0 36
  292.07465 92.0 92
  293.03406 19.0 19
  293.04703 15.0 15
  293.07623 16.0 16
  295.04126 20.0 20
  295.08423 15.0 15
  295.09964 18.0 18
  296.10507 33.0 33
  297.10263 20.0 20
  298.0553 15.0 15
  305.08408 21.0 21
  306.99402 19.0 19
  307.06305 1000.0 999
  307.10919 24.0 24
  307.867 19.0 19
  308.05258 81.0 81
  308.0687 134.0 134
  308.11243 43.0 43
  309.07782 37.0 37
  310.07516 33.0 33
  310.13449 15.0 15
  316.07886 20.0 20
  321.04068 31.0 31
  321.07327 38.0 38
  322.07281 45.0 45
  322.08652 259.0 259
  323.05054 17.0 17
  323.08957 15.0 15
  324.08838 28.0 28
  324.11096 26.0 26
  329.09906 37.0 37
  335.06805 15.0 15
  335.09607 16.0 16
  337.05066 55.0 55
  337.0723 15.0 15
  338.07614 16.0 16
  338.12692 22.0 22
  339.10669 16.0 16
  339.13052 17.0 17
  340.0885 18.0 18
  346.07425 17.0 17
  349.06268 15.0 15
  350.07196 22.0 22
  351.04706 145.0 145
  351.06247 172.0 172
  351.0928 16.0 16
  352.03513 22.0 22
  352.05923 52.0 52
  353.06073 37.0 37
  361.10818 15.0 15
  366.05991 19.0 19
  366.07446 124.0 124
  368.07059 20.0 20
  368.0864 23.0 23
  390.06235 16.0 16
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze