MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR308574

Digitonin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR308574
RECORD_TITLE: Digitonin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Digitonin
CH$COMPOUND_CLASS: Steroidal saponins
CH$FORMULA: C56H92O29
CH$EXACT_MASS: 1229.323
CH$SMILES: CC1C2C(OC11CCC(C)CO1)C(O)C1C3CCC4CC(OC5OC(CO)C(OC6OC(CO)C(O)C(OC7OCC(O)C(O)C7O)C6OC6OC(CO)C(O)C(OC7OC(CO)C(O)C(O)C7O)C6O)C(O)C5O)C(O)CC4(C)C3CCC21C
CH$IUPAC: InChI=1S/C56H92O29/c1-19-7-10-56(75-17-19)20(2)31-45(85-56)37(67)32-22-6-5-21-11-26(24(61)12-55(21,4)23(22)8-9-54(31,32)3)76-50-42(72)39(69)44(30(16-60)80-50)81-53-48(47(36(66)29(15-59)79-53)83-49-40(70)33(63)25(62)18-74-49)84-52-43(73)46(35(65)28(14-58)78-52)82-51-41(71)38(68)34(64)27(13-57)77-51/h19-53,57-73H,5-18H2,1-4H3
CH$LINK: INCHIKEY UVYVLBIGDKGWPX-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE -2.75 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.9815
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M-H]-
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 1227.56515054783

PK$SPLASH: splash10-0zfs-7330004209-c7e999cff5afc5319247
PK$NUM_PEAK: 144
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  59.01189 19.0 19
  59.01765 16.0 16
  71.01575 13.0 13
  87.00759 68.0 68
  89.02325 50.0 50
  90.02679 12.0 12
  97.03214 17.0 17
  99.00287 14.0 14
  101.01984 28.0 28
  101.02943 18.0 18
  113.02363 150.0 150
  114.02448 18.0 18
  125.02033 45.0 45
  127.04272 21.0 21
  131.0376 16.0 16
  137.0594 40.0 40
  139.04251 12.0 12
  143.02673 57.0 57
  143.03636 102.0 102
  149.0394 15.0 15
  151.05144 15.0 15
  157.05116 15.0 15
  157.12619 23.0 23
  161.04266 177.0 177
  162.04465 18.0 18
  162.0524 12.0 12
  179.03078 40.0 40
  179.04706 18.0 18
  179.05891 37.0 37
  180.0602 12.0 12
  181.06204 12.0 12
  183.06557 29.0 29
  197.04124 15.0 15
  203.06168 33.0 33
  225.06702 12.0 12
  235.07996 25.0 25
  235.08821 34.0 34
  245.07341 35.0 35
  251.1759 16.0 16
  257.06769 50.0 50
  264.05902 17.0 17
  269.05646 15.0 15
  291.77234 19.0 19
  310.78256 12.0 12
  323.09641 35.0 35
  323.12305 21.0 21
  332.50143 13.0 13
  383.13034 13.0 13
  437.12671 31.0 31
  456.15652 23.0 23
  467.1239 12.0 12
  477.01657 15.0 15
  485.13058 20.0 20
  491.2572 22.0 22
  607.14838 17.0 17
  607.87061 18.0 18
  609.34991 450.0 450
  609.37573 313.0 313
  609.95477 15.0 15
  610.362 285.0 285
  612.39368 12.0 12
  612.76379 18.0 18
  617.17798 16.0 16
  617.19836 12.0 12
  632.93005 18.0 18
  706.34027 14.0 14
  706.41644 33.0 33
  707.36536 18.0 18
  707.39594 19.0 19
  717.37024 17.0 17
  727.64972 12.0 12
  746.96039 12.0 12
  759.34979 12.0 12
  759.64752 21.0 21
  771.39691 138.0 138
  771.42389 79.0 79
  771.44153 48.0 48
  772.42938 147.0 147
  773.38989 12.0 12
  773.44788 68.0 68
  774.42175 17.0 17
  774.75769 13.0 13
  778.70807 13.0 13
  809.62384 13.0 13
  811.64154 12.0 12
  813.4021 15.0 15
  839.44305 13.0 13
  840.44769 18.0 18
  880.4845 15.0 15
  891.68579 13.0 13
  901.4422 14.0 14
  903.36987 25.0 25
  903.46033 1000.0 999
  904.04095 13.0 13
  904.40759 51.0 51
  904.45801 394.0 394
  904.4975 94.0 94
  905.41205 18.0 18
  905.45068 135.0 135
  905.47693 79.0 79
  905.52625 14.0 14
  906.49438 15.0 15
  908.92566 13.0 13
  909.26624 17.0 17
  911.03125 24.0 24
  915.44916 18.0 18
  933.45746 38.0 38
  933.47894 37.0 37
  933.50073 34.0 34
  934.29565 15.0 15
  934.46753 28.0 28
  934.50867 28.0 28
  935.48413 14.0 14
  940.96942 18.0 18
  956.17627 20.0 20
  981.92389 20.0 20
  994.02551 13.0 13
  1008.68054 12.0 12
  1047.50232 52.0 52
  1048.50183 51.0 51
  1065.53699 30.0 30
  1065.58447 13.0 13
  1066.50085 13.0 13
  1066.52747 12.0 12
  1066.70142 21.0 21
  1067.4978 18.0 18
  1069.50012 12.0 12
  1095.49304 147.0 147
  1095.53394 578.0 577
  1095.59436 30.0 30
  1096.44653 28.0 28
  1096.51831 443.0 443
  1096.57239 35.0 35
  1096.61267 18.0 18
  1097.50464 45.0 45
  1097.53589 45.0 45
  1097.57617 34.0 34
  1097.62463 14.0 14
  1098.55957 15.0 15
  1103.05151 12.0 12
  1107.08337 12.0 12
  1211.58972 12.0 12
  1227.51904 64.0 64
  1227.56958 470.0 470
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze