MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR308600

Digitonin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR308600
RECORD_TITLE: Digitonin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: Digitonin
CH$COMPOUND_CLASS: Steroidal saponins
CH$FORMULA: C56H92O29
CH$EXACT_MASS: 1229.323
CH$SMILES: CC1C2C(OC11CCC(C)CO1)C(O)C1C3CCC4CC(OC5OC(CO)C(OC6OC(CO)C(O)C(OC7OCC(O)C(O)C7O)C6OC6OC(CO)C(O)C(OC7OC(CO)C(O)C(O)C7O)C6O)C(O)C5O)C(O)CC4(C)C3CCC21C
CH$IUPAC: InChI=1S/C56H92O29/c1-19-7-10-56(75-17-19)20(2)31-45(85-56)37(67)32-22-6-5-21-11-26(24(61)12-55(21,4)23(22)8-9-54(31,32)3)76-50-42(72)39(69)44(30(16-60)80-50)81-53-48(47(36(66)29(15-59)79-53)83-49-40(70)33(63)25(62)18-74-49)84-52-43(73)46(35(65)28(14-58)78-52)82-51-41(71)38(68)34(64)27(13-57)77-51/h19-53,57-73H,5-18H2,1-4H3
CH$LINK: INCHIKEY UVYVLBIGDKGWPX-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE NEGATIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE -2.75 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.9815
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+HCOO]-
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 1273.57062985183

PK$SPLASH: splash10-004j-5290002105-7b2391f2b833d68fd17e
PK$NUM_PEAK: 209
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  71.01105 12.0 12
  85.03144 9.0 9
  87.00886 57.0 57
  89.02053 22.0 22
  95.01123 5.0 5
  97.0366 9.0 9
  100.01304 8.0 8
  101.02512 19.0 19
  107.03992 7.0 7
  113.02251 89.0 89
  114.03049 12.0 12
  115.04021 6.0 6
  119.03105 30.0 30
  125.02576 68.0 68
  126.02309 7.0 7
  137.02246 10.0 10
  137.05772 7.0 7
  139.07433 9.0 9
  143.02766 16.0 16
  143.03751 63.0 63
  149.04097 27.0 27
  159.02959 10.0 10
  161.02356 7.0 7
  161.04599 85.0 85
  162.03065 8.0 8
  162.0455 11.0 11
  178.05991 5.0 5
  179.05321 35.0 35
  191.03476 7.0 7
  195.06303 7.0 7
  196.06134 7.0 7
  203.05638 16.0 16
  209.03918 8.0 8
  223.05156 11.0 11
  225.06779 6.0 6
  247.0731 6.0 6
  247.08841 6.0 6
  252.05882 6.0 6
  265.08905 13.0 13
  275.06406 12.0 12
  275.07288 8.0 8
  279.08264 6.0 6
  293.08643 6.0 6
  305.08655 6.0 6
  323.09052 7.0 7
  323.10974 11.0 11
  356.68765 7.0 7
  383.1196 6.0 6
  384.11859 6.0 6
  408.12308 6.0 6
  434.19324 6.0 6
  436.24304 9.0 9
  446.74347 6.0 6
  467.14044 12.0 12
  468.13043 7.0 7
  468.14865 7.0 7
  492.11862 6.0 6
  505.44901 6.0 6
  512.76031 5.0 5
  525.16327 5.0 5
  526.83557 5.0 5
  561.04242 6.0 6
  566.33716 5.0 5
  574.27618 9.0 9
  580.34729 7.0 7
  580.99121 8.0 8
  591.35406 12.0 12
  592.34772 6.0 6
  603.93304 7.0 7
  604.74536 6.0 6
  609.26721 5.0 5
  609.35974 241.0 241
  609.37708 108.0 108
  609.41406 11.0 11
  610.31183 7.0 7
  610.35406 79.0 79
  610.3833 29.0 29
  610.43066 11.0 11
  611.35608 6.0 6
  611.38202 40.0 40
  617.12024 10.0 10
  617.21429 6.0 6
  618.21552 9.0 9
  631.21234 5.0 5
  651.35846 5.0 5
  653.17908 5.0 5
  664.02112 7.0 7
  672.34174 6.0 6
  685.41724 5.0 5
  700.38062 6.0 6
  700.44452 6.0 6
  701.20905 5.0 5
  705.38629 27.0 27
  706.41541 12.0 12
  709.76062 8.0 8
  717.39612 23.0 23
  718.40118 26.0 26
  718.78339 5.0 5
  719.37671 6.0 6
  728.29877 6.0 6
  740.34314 7.0 7
  746.70508 10.0 10
  753.36981 5.0 5
  771.39203 29.0 29
  771.42261 140.0 140
  771.45709 33.0 33
  772.39484 51.0 51
  772.42218 42.0 42
  773.39832 12.0 12
  773.66888 7.0 7
  774.40454 7.0 7
  775.83527 7.0 7
  776.2511 10.0 10
  777.41943 5.0 5
  802.17194 6.0 6
  809.19952 6.0 6
  852.0976 8.0 8
  854.75586 6.0 6
  891.45618 5.0 5
  902.46179 5.0 5
  903.33124 12.0 12
  903.45465 829.0 828
  903.58234 5.0 5
  904.38312 6.0 6
  904.42218 24.0 24
  904.47827 186.0 186
  905.44189 43.0 43
  905.47821 58.0 58
  906.45831 32.0 32
  907.46912 12.0 12
  908.20593 8.0 8
  909.66357 6.0 6
  911.3941 6.0 6
  913.75183 6.0 6
  915.35626 5.0 5
  915.4707 22.0 22
  916.43372 8.0 8
  933.43793 22.0 22
  933.46674 32.0 32
  933.49701 33.0 33
  933.64966 6.0 6
  934.48468 19.0 19
  935.46661 12.0 12
  953.71906 6.0 6
  982.39233 16.0 16
  988.33441 5.0 5
  995.85712 5.0 5
  1033.23596 6.0 6
  1041.55005 7.0 7
  1047.45886 5.0 5
  1047.49341 27.0 27
  1051.56799 7.0 7
  1052.11768 5.0 5
  1053.55261 14.0 14
  1065.07068 10.0 10
  1065.49011 39.0 39
  1066.48425 13.0 13
  1066.54797 7.0 7
  1067.51562 40.0 40
  1067.58838 5.0 5
  1078.49829 5.0 5
  1095.52429 537.0 536
  1095.5918 35.0 35
  1095.64575 8.0 8
  1096.52563 489.0 489
  1096.60107 25.0 25
  1096.64941 8.0 8
  1096.86035 5.0 5
  1097.45203 7.0 7
  1097.52332 102.0 102
  1097.57935 20.0 20
  1098.45837 7.0 7
  1098.51318 27.0 27
  1098.5791 7.0 7
  1099.50403 8.0 8
  1101.61841 6.0 6
  1101.7019 6.0 6
  1101.79761 6.0 6
  1102.2262 6.0 6
  1102.74231 7.0 7
  1102.88416 6.0 6
  1103.87891 6.0 6
  1105.93494 8.0 8
  1112.03345 6.0 6
  1152.30347 5.0 5
  1167.37866 6.0 6
  1171.052 7.0 7
  1219.32605 7.0 7
  1226.42676 15.0 15
  1226.51306 5.0 5
  1226.85156 6.0 6
  1227.51514 121.0 121
  1227.56812 1000.0 999
  1227.64441 34.0 34
  1227.68933 14.0 14
  1227.76062 5.0 5
  1228.35657 6.0 6
  1228.51794 72.0 72
  1228.58093 630.0 629
  1229.15063 7.0 7
  1229.56445 297.0 297
  1229.90076 5.0 5
  1230.53955 34.0 34
  1230.59949 62.0 62
  1231.54224 20.0 20
  1232.60852 12.0 12
  1238.14331 7.0 7
  1240.24438 7.0 7
  1259.68958 10.0 10
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze