MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR310459

Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR310459
RECORD_TITLE: Ginkgolide B; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: Annotation level-1

CH$NAME: Ginkgolide B
CH$COMPOUND_CLASS: Ginkgolides and bilobalides
CH$FORMULA: C20H24O10
CH$EXACT_MASS: 424.402
CH$SMILES: CC1C(=O)OC2C(O)C34C5CC(C(C)(C)C)C33C(O)C(=O)OC3OC4(C(=O)O5)C12O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H24O10/c1-6-12(23)28-11-9(21)18-8-5-7(16(2,3)4)17(18)10(22)13(24)29-15(17)30-20(18,14(25)27-8)19(6,11)26/h6-11,15,21-22,26H,5H2,1-4H3
CH$LINK: INCHIKEY SQOJOAFXDQDRGF-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.36
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 425.14422

PK$SPLASH: splash10-004i-0396800000-32d3ca62ab9a3f887b37
PK$NUM_PEAK: 276
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  55.05659 18.0 5
  69.06559 20.0 6
  74.66629 18.0 5
  83.0108 17.0 5
  105.07487 20.0 6
  109.03346 37.0 10
  113.09183 18.0 5
  121.06905 27.0 7
  121.81543 34.0 9
  127.04942 17.0 5
  127.07694 20.0 6
  129.06862 17.0 5
  131.04967 20.0 6
  137.02167 23.0 6
  145.05042 17.0 5
  145.10597 20.0 6
  146.10712 17.0 5
  147.07867 38.0 11
  149.06311 19.0 5
  153.63832 35.0 10
  156.0632 18.0 5
  157.09901 87.0 24
  159.08215 44.0 12
  159.1207 19.0 5
  160.08514 17.0 5
  160.12315 18.0 5
  163.05629 20.0 6
  163.1181 31.0 9
  165.09875 20.0 6
  167.0249 17.0 5
  169.05965 17.0 5
  169.10556 60.0 17
  173.05247 20.0 6
  174.03534 29.0 8
  177.0461 59.0 16
  177.08557 20.0 6
  178.0766 30.0 8
  179.07758 17.0 5
  182.10396 39.0 11
  183.09102 24.0 7
  185.06773 24.0 7
  185.093 87.0 24
  185.15002 19.0 5
  187.03473 28.0 8
  187.12523 26.0 7
  189.08562 22.0 6
  189.09642 20.0 6
  189.12843 38.0 11
  190.08922 18.0 5
  191.03214 17.0 5
  191.04041 27.0 7
  191.11481 21.0 6
  192.02623 17.0 5
  192.03787 22.0 6
  192.08266 26.0 7
  193.05531 20.0 6
  195.07239 17.0 5
  196.12411 40.0 11
  197.10034 39.0 11
  197.13237 20.0 6
  198.1021 19.0 5
  199.03609 18.0 5
  199.07994 47.0 13
  199.11349 18.0 5
  200.06873 29.0 8
  200.12372 22.0 6
  201.0144 24.0 7
  201.03755 20.0 6
  201.08322 16.0 4
  201.09273 80.0 22
  203.07498 23.0 6
  204.12123 21.0 6
  205.09828 20.0 6
  205.10768 18.0 5
  205.11874 19.0 5
  207.02293 18.0 5
  207.03615 21.0 6
  207.11624 19.0 5
  207.16425 27.0 7
  209.14139 25.0 7
  211.07368 25.0 7
  212.06898 43.0 12
  213.04787 20.0 6
  213.08438 52.0 14
  213.09674 46.0 13
  214.23119 20.0 6
  214.82454 20.0 6
  215.06589 20.0 6
  215.07649 24.0 7
  215.10817 36.0 10
  216.08618 26.0 7
  216.1176 20.0 6
  217.08194 38.0 11
  219.02641 46.0 13
  219.06456 18.0 5
  219.09123 17.0 5
  222.15892 22.0 6
  224.11569 20.0 6
  225.09251 17.0 5
  225.11867 37.0 10
  225.13693 32.0 9
  227.04465 24.0 7
  227.06476 17.0 5
  227.10266 54.0 15
  227.12003 21.0 6
  227.14806 17.0 5
  229.04866 35.0 10
  229.08189 47.0 13
  229.08885 106.0 29
  230.09381 36.0 10
  231.09576 46.0 13
  233.55211 17.0 5
  237.09924 20.0 6
  237.13634 23.0 6
  238.1021 17.0 5
  239.07077 36.0 10
  239.11331 63.0 17
  241.07918 38.0 11
  241.08954 26.0 7
  241.12129 43.0 12
  242.09329 18.0 5
  242.1291 17.0 5
  243.06213 18.0 5
  244.09805 20.0 6
  244.11035 20.0 6
  245.0168 29.0 8
  245.03564 24.0 7
  245.04524 17.0 5
  245.08209 57.0 16
  245.09969 20.0 6
  245.12186 17.0 5
  246.10947 20.0 6
  246.16594 20.0 6
  247.05692 23.0 6
  247.07605 21.0 6
  247.09962 22.0 6
  247.12027 20.0 6
  251.10757 17.0 5
  253.08963 46.0 13
  253.11288 44.0 12
  253.12418 68.0 19
  254.12743 22.0 6
  255.02356 23.0 6
  255.10176 21.0 6
  255.11195 17.0 5
  255.13428 20.0 6
  256.07507 37.0 10
  256.15228 27.0 7
  257.0762 48.0 13
  257.08981 40.0 11
  257.10269 20.0 6
  259.06522 22.0 6
  259.08621 81.0 22
  259.09991 24.0 7
  259.11169 19.0 5
  259.13785 17.0 5
  260.09143 46.0 13
  260.14694 22.0 6
  261.07831 26.0 7
  261.11316 20.0 6
  262.37573 20.0 6
  263.10342 37.0 10
  265.07135 17.0 5
  265.12143 17.0 5
  269.11124 39.0 11
  269.12112 19.0 5
  269.26895 21.0 6
  270.11572 17.0 5
  271.08496 22.0 6
  271.10184 17.0 5
  271.11557 37.0 10
  271.12915 18.0 5
  272.06979 22.0 6
  273.06607 43.0 12
  273.11819 33.0 9
  273.14764 17.0 5
  275.08804 105.0 29
  275.11288 17.0 5
  276.1011 19.0 5
  279.05392 17.0 5
  279.0983 79.0 22
  281.08093 19.0 5
  281.12558 17.0 5
  282.12775 40.0 11
  283.09305 25.0 7
  283.11978 46.0 13
  283.13211 19.0 5
  285.11295 40.0 11
  286.08109 17.0 5
  287.09442 20.0 6
  287.12277 24.0 7
  287.13199 48.0 13
  289.09656 44.0 12
  293.11871 17.0 5
  295.11554 24.0 7
  297.06815 34.0 9
  297.11578 17.0 5
  297.12372 48.0 13
  298.09879 32.0 9
  299.08743 38.0 11
  299.10788 23.0 6
  299.1312 82.0 23
  300.13193 20.0 6
  301.0314 34.0 9
  301.07333 33.0 9
  301.11157 19.0 5
  303.08929 79.0 22
  303.16519 25.0 7
  303.47986 18.0 5
  304.11212 26.0 7
  305.10193 166.0 46
  305.11603 84.0 23
  306.11627 66.0 18
  307.09845 29.0 8
  309.13214 43.0 12
  312.3924 18.0 5
  315.12152 85.0 24
  315.13721 24.0 7
  316.14969 20.0 6
  317.12009 21.0 6
  317.15637 22.0 6
  319.06155 17.0 5
  319.12027 20.0 6
  321.0903 43.0 12
  321.10742 38.0 11
  325.09927 19.0 5
  325.12238 44.0 12
  327.12061 35.0 10
  328.12802 25.0 7
  329.07394 20.0 6
  333.06531 23.0 6
  333.10968 20.0 6
  333.13998 39.0 11
  335.10611 18.0 5
  335.12122 18.0 5
  335.15402 24.0 7
  337.05447 34.0 9
  337.07108 24.0 7
  342.19049 17.0 5
  343.09488 18.0 5
  343.11624 108.0 30
  343.30035 17.0 5
  344.103 59.0 16
  345.12048 37.0 10
  345.1377 79.0 22
  345.14899 20.0 6
  349.09171 17.0 5
  349.11774 20.0 6
  351.14334 32.0 9
  353.10651 58.0 16
  361.05487 18.0 5
  361.07144 19.0 5
  361.10953 55.0 15
  361.13251 604.0 168
  362.12744 35.0 10
  362.14667 30.0 8
  363.12402 19.0 5
  363.1347 34.0 9
  369.16553 17.0 5
  371.11649 57.0 16
  371.20901 27.0 7
  371.31512 17.0 5
  379.15262 35.0 10
  380.14435 17.0 5
  389.11765 61.0 17
  389.13358 115.0 32
  390.09744 44.0 12
  396.04312 17.0 5
  407.11841 37.0 10
  407.13516 33.0 9
  407.1506 37.0 10
  409.11496 17.0 5
  409.13397 61.0 17
  425.11203 61.0 17
  425.14426 3598.0 999
  425.26428 17.0 5
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze