MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: PR310514

9-Nitro-20(S)-camptothecin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR310514
RECORD_TITLE: 9-Nitro-20(S)-camptothecin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: Annotation level-1

CH$NAME: 9-Nitro-20(S)-camptothecin
CH$COMPOUND_CLASS: Carbolines
CH$FORMULA: C20H15N3O6
CH$EXACT_MASS: 393.355
CH$SMILES: CCC1(O)C(=O)OCC2=C1C=C1N(CC3=CC4=C(C=CC=C4N(=O)=O)N=C13)C2=O
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H15N3O6/c1-2-20(26)13-7-16-17-10(8-22(16)18(24)12(13)9-29-19(20)25)6-11-14(21-17)4-3-5-15(11)23(27)28/h3-7,26H,2,8-9H2,1H3
CH$LINK: INCHIKEY VHXNKPBCCMUMSW-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.87
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 394.10336

PK$SPLASH: splash10-0006-0039000000-5de3d4427bfa3e339a57
PK$NUM_PEAK: 199
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  88.40989 32.0 4
  121.0514 21.0 2
  135.29601 22.0 2
  146.06259 23.0 3
  153.06406 20.0 2
  159.04518 26.0 3
  167.06895 21.0 2
  168.07011 20.0 2
  175.04895 19.0 2
  180.08942 28.0 3
  193.08244 18.0 2
  194.09093 19.0 2
  196.64198 20.0 2
  201.38791 17.0 2
  202.07277 51.0 6
  207.0842 20.0 2
  208.09087 41.0 5
  212.8299 23.0 3
  213.13492 17.0 2
  217.07216 42.0 5
  217.09561 18.0 2
  217.12044 20.0 2
  218.08871 39.0 4
  219.08774 17.0 2
  219.09715 32.0 4
  220.04039 30.0 3
  220.069 24.0 3
  220.10942 47.0 5
  221.07002 20.0 2
  221.10745 18.0 2
  222.07814 46.0 5
  223.09169 17.0 2
  226.05319 21.0 2
  228.41399 20.0 2
  229.03575 17.0 2
  230.09459 20.0 2
  232.10078 24.0 3
  233.06699 41.0 5
  233.12526 18.0 2
  234.08156 38.0 4
  235.07677 27.0 3
  235.09485 51.0 6
  236.04617 18.0 2
  236.06601 21.0 2
  236.07533 27.0 3
  237.08223 25.0 3
  237.0993 42.0 5
  238.05431 24.0 3
  238.06558 42.0 5
  238.07414 37.0 4
  238.08542 17.0 2
  241.08481 21.0 2
  243.11317 20.0 2
  245.06084 44.0 5
  245.07256 64.0 7
  246.07399 18.0 2
  247.06306 22.0 2
  247.08788 326.0 37
  248.08511 136.0 15
  248.0972 112.0 13
  249.0233 25.0 3
  249.08961 39.0 4
  249.10524 18.0 2
  259.09305 20.0 2
  259.10812 24.0 3
  260.08325 18.0 2
  260.13168 17.0 2
  261.09747 42.0 5
  261.11133 24.0 3
  263.07092 132.0 15
  263.08783 20.0 2
  263.10822 18.0 2
  264.07495 116.0 13
  264.09055 37.0 4
  265.1076 30.0 3
  272.0798 20.0 2
  274.06931 35.0 4
  274.07965 20.0 2
  274.10895 48.0 5
  275.12488 18.0 2
  276.05096 30.0 3
  276.07748 21.0 2
  276.09229 25.0 3
  276.10223 21.0 2
  277.06702 20.0 2
  277.08975 39.0 4
  277.12442 29.0 3
  277.14005 24.0 3
  279.06354 67.0 8
  280.08102 23.0 3
  286.10001 27.0 3
  286.12842 24.0 3
  287.12854 23.0 3
  287.67767 20.0 2
  291.01382 19.0 2
  291.04324 86.0 10
  291.06912 694.0 78
  291.11948 18.0 2
  291.78149 18.0 2
  291.90021 18.0 2
  292.05048 26.0 3
  292.06943 174.0 20
  292.09119 149.0 17
  292.10318 46.0 5
  292.11816 22.0 2
  292.13531 55.0 6
  292.15314 20.0 2
  293.0289 18.0 2
  293.06952 196.0 22
  293.08115 356.0 40
  293.09372 103.0 12
  293.11566 17.0 2
  293.13593 52.0 6
  294.08704 110.0 12
  295.08728 49.0 6
  295.09836 21.0 2
  295.88184 23.0 3
  299.88501 18.0 2
  301.10089 25.0 3
  301.45312 26.0 3
  302.10901 36.0 4
  304.0831 43.0 5
  304.12225 1243.0 140
  304.14417 44.0 5
  305.09052 24.0 3
  305.12173 312.0 35
  305.14594 55.0 6
  305.71973 30.0 3
  306.06738 20.0 2
  306.11594 39.0 4
  306.13812 52.0 6
  307.06396 18.0 2
  307.09875 17.0 2
  307.1268 18.0 2
  309.08664 25.0 3
  309.13907 17.0 2
  311.09433 29.0 3
  318.08057 22.0 2
  319.02551 18.0 2
  319.04218 39.0 4
  319.06577 117.0 13
  320.056 42.0 5
  320.07745 55.0 6
  320.1239 69.0 8
  320.55023 29.0 3
  320.64731 20.0 2
  321.01221 28.0 3
  321.07437 17.0 2
  321.11478 20.0 2
  321.14026 20.0 2
  322.10602 22.0 2
  332.11615 17.0 2
  333.89972 27.0 3
  334.32617 30.0 3
  336.04309 26.0 3
  336.07095 28.0 3
  336.09744 42.0 5
  336.11722 27.0 3
  337.05951 23.0 3
  337.07346 24.0 3
  337.09003 38.0 4
  338.06409 22.0 2
  338.08875 40.0 5
  339.07358 40.0 5
  348.07541 20.0 2
  348.09631 135.0 15
  348.10953 242.0 27
  349.09918 32.0 4
  349.12668 21.0 2
  350.00037 17.0 2
  350.06506 17.0 2
  350.08463 17.0 2
  350.11584 877.0 99
  350.14581 19.0 2
  350.15738 19.0 2
  350.18381 17.0 2
  350.30389 18.0 2
  351.09586 39.0 4
  351.11761 404.0 46
  352.11734 22.0 2
  352.13574 19.0 2
  352.34363 20.0 2
  365.03955 41.0 5
  365.05746 237.0 27
  365.06955 236.0 27
  365.08606 83.0 9
  366.05426 62.0 7
  366.07425 88.0 10
  367.07986 24.0 3
  368.08847 24.0 3
  377.71896 20.0 2
  393.09225 29.0 3
  394.01364 17.0 2
  394.03778 65.0 7
  394.0535 62.0 7
  394.06613 69.0 8
  394.10303 8867.0 999
  394.16241 52.0 6
  394.23175 18.0 2
//

Imprint Feedback
system version 2.1.8
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
Responsible: Dr. Tobias Schulze